基于微卫星标记的胭脂鱼遗传多样性研究及脂肪酸分析

发布时间：2020-09-18 12:01

　　 胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus),隶属于鲤形目(Cypriniformes)、亚口鱼科(Catostomidae)、胭脂鱼属(Myxocyprinus),是中国特有属、种。目前被列入中国二级重点保护动物。本次利用微卫星标记研究了胭脂鱼养殖群体的遗传多样性,监测胭脂鱼遗传资源的变动水平,为科学指导选育优良种质资源进行人工放流提供基础。同时分析胭脂鱼不同生长阶段的脂肪酸含量,为合理配置养殖饵料提供理论依据。主要研究结果如下:1.利用13个微卫星标记研究了我国重庆万州、江西永丰、江西新干三个胭脂鱼繁殖基地子一代群体的遗传多样性和遗传结构,结果显示,13个微卫星位点均呈多态性,等位基因数目为8~17个,观测杂合度范围为0.1081~0.8255,平均观测杂合度为0.6378。多态信息含量为0.35~0.84,平均多态信息含量为0.74。Shannon多样性指数为1.61~1.64,观测杂合度为0.1081~0.8255,期望杂合度为0.3846~0.8568,Hardy-weinberg遗传偏离指数为-0.7189~0.0725。2.三个养殖群体多态信息含量依次为新干0.73、重庆0.69、永丰0.62,均具有高度多态性,遗传多样性丰富。根据遗传相似指数分析,永丰和重庆群体遗传距离较近,重庆和新干遗传距离较远。三个养殖群体间遗传分化系数均值为0.075,存在中度遗传分化。群体间基因流均值为4.9825,显示基因交流充分,而Structure分析显示三个群体间具有遗传分化,表明基因交流并没有制约地理种群间的遗传分化。3.养殖群体与野外采集胭脂鱼脂肪酸检测得到30种脂肪酸,饱和脂肪酸10种,不饱和脂肪酸20种,其中单不饱和脂肪酸9种,多不饱和脂肪酸11种,组成无差异。4.养殖群体和野外采集胭脂鱼肌肉的脂肪酸分析比较发现:野外采集胭脂鱼的饱和脂肪酸和单不饱和脂肪酸的总量均显著低于养殖群体,单不饱和脂肪酸含量为养殖胭脂鱼C18:1ω9较高,野外采集胭脂鱼以C16:1为主。多不饱和脂肪酸含量为野外采集胭脂鱼显著高于养殖群体,Σω3/Σω6(野外标本)1Σω3/Σω6(养殖标本),因投喂植物性油脂代替鱼油等动物性饵料,使得提供了较高的ω6多不饱和脂肪酸,ω9不饱和脂肪酸含量的累积,显示养殖群体ω3不足,为使用于人工放流养殖胭脂鱼群体更接近野生鱼类,适应野外环境,应在饵料中添加ω3脂肪酸。5.根据脂肪酸标志分析,胭脂鱼潜在食物资源为浮游植物维管束植物细菌浮游动物。比较三个不同采集地点(泰和、峡江、遂川)胭脂鱼脂肪酸含量发现,胭脂鱼生活环境不同,15种脂肪酸含量具有显著差异。提供胭脂鱼必须脂肪酸的主要贡献者绿藻在泰和居于较高水平。胭脂鱼不饱和脂肪酸中,裸藻类的标志物脂肪酸C18:3ω6可能在鱼类发育中具有重要的生理生化作用。6.胭脂鱼胚胎发育阶段,鱼卵和仔鱼时期脂肪酸含量中,饱和脂肪酸单饱和脂肪酸多不饱和脂肪酸,与其他生长阶段具有差异。在未开口摄食前饱和脂肪酸C16:0比C18:0选择性消耗,C16:0可能为主要供能者,单不饱和脂肪酸C18:1可能为主要补充者。不饱和脂肪酸,鱼卵到仔鱼阶段ω3系列代谢活跃,C20:6ω3(DHA)的作用比C20:5ω3(EPA)明显,仔鱼阶段后ω6系列代谢活动程度要高于ω3系列。
【学位单位】：南昌大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2017
【中图分类】：S917.4
【部分图文】：

多态微卫星位点Mas39的扩增STR分型结果

图 2.2 三个胭脂鱼种群的 UPGMA 聚类分析Fig. 2.2 UPGMA tree of Nei's genetic distances in the three populations of M. asiaticus注：pop1 为新干胭脂鱼养殖群体，pop2 为重庆胭脂鱼养殖群体，pop3 为永丰胭脂鱼养殖群体。Notes: pop1 was the populations of M. asiaticus in Xingan, pop2 was the populations of M.asiaticus in Chongqing, pop3 was the populations of M. asiaticus in Yongfeng.2.3.4 微卫星标记在胭脂鱼人工放流中的应用根据实验样本三个胭脂鱼养殖群体和5尾野外采集胭脂鱼在13个微卫星位点的遗传信息，利用 Structure 软件的贝叶斯聚类分析方法进行遗传关系聚类分析和种群遗传结构分析。各分类簇 K 最大可能值如表 2.12 所示，通过计算△ K发现，当 K = 4 时，△ K 取得最大值（图 2.3），由此可见，所分析的个体根据遗传结构的可分为 4 个簇（图 2.4）。从图 2.4 中看出，新干胭脂鱼养殖群体大部分为 Cluster1 和 Cluster4；重庆胭脂鱼养殖群体 Cluster2 占大部分，永丰胭

表 2.12 胭脂鱼不同养殖群体分类簇值 K 的最大可能值Table 2.12 The maximum possible value of K in M. asiaticus populations运行次数簇值 K （K value)2 3 4 5 6 7 8Run 1 -5880.6 -5582.4 -5271.7 -5144.5 -5055.5 -4938.5 -4914.8Run 2 -5880.6 -5549.4 -5271.7 -5125.3 -5055.5 -4993.8 -4915.9Run 3 -5880.8 -5536.9 -5271.1 -5124.7 -5053.0 -4975.3 -4936.9Run 4 -5880.7 -5537.4 -5271.0 -5125.8 -5053.0 -4994.5 -4933.7Run 5 -5881.0 -5537.3 -5270.5 -5124.6 -5052.4 -4978.5 -4896.6Run 6 -5880.6 -5536.9 -5270.8 -5124.6 -5040.9 -4975.8 -4925.4Run 7 -5880.6 -5537.3 -5270.7 -5126.2 -5053.3 -4990.3 -4925.4

【参考文献】

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本文编号：2821618