卵形鲳鲹盐度适应调控机制研究
发布时间：2021-01-23 03:41
卵形鲳鲹（Trachinotus Ovatus）是一种中上层暖水性鱼类,生长速度快,肉质鲜美,营养价值高,已成为中国南方地区主要的海水养殖品种之一。由于暴雨和台风等极端天气经常导致池塘和海湾中的盐度急剧下降,严重影响卵形鲳鲹的生长和生存。因此,研究卵形鲳鲹在盐度胁迫下的渗透压调节机制是必要的。本研究通过转录组测序技术对慢性盐度胁迫下卵形鲳鲹的鳃进行分析,得到显著差异表达基因和代谢通路。在急性盐度胁迫下,本研究首先对血清中的渗透压、Na+/Cl-离子浓度、皮质醇（COR）和催乳素（PRL）进行测定。其次还对鳃中的Na+/K+-ATPase（NKA）进行测定。最后,从转录组数据中与盐度相关显著差异表达基因筛选出NKAα1、NKCC1a和AQP1a的基因序列,研究它们在急性盐度胁迫下对卵形鲳鲹渗透调节的影响。本文的主要结果如下:1.利用转录组测序技术构建了与卵形鲳鲹盐度适应相关的转录组数据库,共获得410,071,902 raw reads。过滤和去除低质量的reads得到高质量的405,814,464reads,将所得的Unigene对比到数据库中,注释到38,437个Unigene,37...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：105 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
转录组测序流程图
图 2-2 信息分析流程Figure 2-2 Information analysis process表达注释得到的 Unigene 序列通过 blastx 与 Nr、Swissprot、KEGG库进行比对（evalue<1e﹣5视为显著性），获得相似性最高白的功能对 Unigene 进行蛋白功能注释、pathway 注释、Cology（GO）功能注释等[56]。表达基因鉴定wtie 2 程序[57]将每个文库中的高质量 reads 映射到从头装对来自比对的映射读数进行计数，然后使用 RSEMV1.2.1M（每千万碱基对测序的转录物序列的片段每千碱基的预
图 2-3 卵形鲳鲹鳃组织总 RNA 电泳图r 5000; 1，2，3：对应 SL-1，SL-2 和 SL-3；4，5，6：对应 MS-1，MS-2 和 MS-3；7，89：对应 SN-1，SN-2 和 SN-3Figure 2-3 Electrophoretic pattern of total RNA in Trachinotus ovatus gillser 5000; 1，2，3：Correspondence SL-1，SL-2 and SL-3；4，5，6：Correspondence MS-1MS-2 and MS-3；7，8，9：Correspondence SN-1，SN-2 and SN-3
【参考文献】：
期刊论文
[1]卵形鲳鲹MHCⅡβ基因的克隆与表达分析[J]. 于文博,朱克诚,郭华阳,张楠,孙潇潇,吴娜,张殿昌. 南方水产科学. 2017(04)
[2]刀鲚水通道蛋白1的分子克隆及高盐作用下的表达分析[J]. 王美垚,杨健,徐跑,徐钢春,徐东坡,尤洋,刘凯,段金荣,周彦锋,方弟安,张敏莹,俞振飞. 中国水产科学. 2017(03)
[3]转录组学技术在水产动物研究中的运用[J]. 罗辉,叶华,肖世俊,郑曙明,王晓清,王志勇. 水产学报. 2015(04)
[4]卵形鲳鲹育种群体遗传多样性分析[J]. 孙立元,郭华阳,朱彩艳,马振华,江世贵,张殿昌. 南方水产科学. 2014(02)
[5]盐度胁迫及昼夜变化对鲻鱼幼鱼消化酶活力的影响[J]. 于娜,李加儿,区又君,范春燕,张建生. 南方水产科学. 2011(06)
[6]萨罗罗非鱼NKCC1α基因cDNA克隆及mRNA组织表达差异[J]. 范武江,李思发. 动物学研究. 2010(06)
[7]鱼类的非特异性免疫概述[J]. 李新文,吕延玲. 黑龙江水产. 2010(02)
[8]半滑舌鳎幼鱼消化酶同功酶谱初步研究[J]. 田相利,任晓伟,董双林,房景辉. 生物技术通报. 2008(S1)
[9]盐度对施氏鲟幼鱼消化酶活力的影响[J]. 庄平,章龙珍,田宏杰,赵峰,宋超. 中国水产科学. 2008(02)
[10]NPA motif在水通道蛋白AQP1表达和转水功能中的重要性[J]. 姜勇,麻彤辉. 科学通报. 2007(04)
博士论文
[1]黄鳝性别分化相关候选基因的筛选及相关功能研究[D]. 丁炜东.南京农业大学 2016
硕士论文
[1]应用TALEN技术敲除斑马鱼IDH基因及突变体筛选[D]. 熊小杰.南方医科大学 2016
本文编号：2994478
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：105 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
转录组测序流程图
图 2-2 信息分析流程Figure 2-2 Information analysis process表达注释得到的 Unigene 序列通过 blastx 与 Nr、Swissprot、KEGG库进行比对（evalue<1e﹣5视为显著性），获得相似性最高白的功能对 Unigene 进行蛋白功能注释、pathway 注释、Cology（GO）功能注释等[56]。表达基因鉴定wtie 2 程序[57]将每个文库中的高质量 reads 映射到从头装对来自比对的映射读数进行计数，然后使用 RSEMV1.2.1M（每千万碱基对测序的转录物序列的片段每千碱基的预
图 2-3 卵形鲳鲹鳃组织总 RNA 电泳图r 5000; 1，2，3：对应 SL-1，SL-2 和 SL-3；4，5，6：对应 MS-1，MS-2 和 MS-3；7，89：对应 SN-1，SN-2 和 SN-3Figure 2-3 Electrophoretic pattern of total RNA in Trachinotus ovatus gillser 5000; 1，2，3：Correspondence SL-1，SL-2 and SL-3；4，5，6：Correspondence MS-1MS-2 and MS-3；7，8，9：Correspondence SN-1，SN-2 and SN-3
【参考文献】：
期刊论文
[1]卵形鲳鲹MHCⅡβ基因的克隆与表达分析[J]. 于文博,朱克诚,郭华阳,张楠,孙潇潇,吴娜,张殿昌. 南方水产科学. 2017(04)
[2]刀鲚水通道蛋白1的分子克隆及高盐作用下的表达分析[J]. 王美垚,杨健,徐跑,徐钢春,徐东坡,尤洋,刘凯,段金荣,周彦锋,方弟安,张敏莹,俞振飞. 中国水产科学. 2017(03)
[3]转录组学技术在水产动物研究中的运用[J]. 罗辉,叶华,肖世俊,郑曙明,王晓清,王志勇. 水产学报. 2015(04)
[4]卵形鲳鲹育种群体遗传多样性分析[J]. 孙立元,郭华阳,朱彩艳,马振华,江世贵,张殿昌. 南方水产科学. 2014(02)
[5]盐度胁迫及昼夜变化对鲻鱼幼鱼消化酶活力的影响[J]. 于娜,李加儿,区又君,范春燕,张建生. 南方水产科学. 2011(06)
[6]萨罗罗非鱼NKCC1α基因cDNA克隆及mRNA组织表达差异[J]. 范武江,李思发. 动物学研究. 2010(06)
[7]鱼类的非特异性免疫概述[J]. 李新文,吕延玲. 黑龙江水产. 2010(02)
[8]半滑舌鳎幼鱼消化酶同功酶谱初步研究[J]. 田相利,任晓伟,董双林,房景辉. 生物技术通报. 2008(S1)
[9]盐度对施氏鲟幼鱼消化酶活力的影响[J]. 庄平,章龙珍,田宏杰,赵峰,宋超. 中国水产科学. 2008(02)
[10]NPA motif在水通道蛋白AQP1表达和转水功能中的重要性[J]. 姜勇,麻彤辉. 科学通报. 2007(04)
博士论文
[1]黄鳝性别分化相关候选基因的筛选及相关功能研究[D]. 丁炜东.南京农业大学 2016
硕士论文
[1]应用TALEN技术敲除斑马鱼IDH基因及突变体筛选[D]. 熊小杰.南方医科大学 2016
本文编号：2994478
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