3种色型仿刺参线粒体和核糖体序列片段遗传结构比较研究

发布时间：2021-05-25 13:29

　　仿刺参作为我国重要的海水养殖物种,良种选育是目前研究的重点,其中体色是重要的考虑因素之一。为了比较3种不同体色仿刺参的遗传结构,采用PCR扩增与测序技术对我国3种体色（青色、白色和紫色）仿刺参线粒体16S rRNA和COⅠ与核糖体18S rRNA-ITS-28S rRNA序列片段进行分析,揭示其遗传结构差异及系统发育关系。结果表明,16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列长度分别为812～830 bp、877～915 bp、1 536～1 572 bp。16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列在青色、紫色和白色仿刺参中分别检测到单倍型个数分别为4/5/5、5/3/4和4/4/3,COⅠ序列多态性位点数目所比例最大,16S rRNA序列最小。3种色型仿刺参16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列遗传距离数值均比较小,范围分别为0～0.014 7、0～0.021 2和0～0.010 3,没有达到种的分化水平。以紫海胆为外群,基于COⅠ序列构建系统发育树,结果表明白刺参单独聚为一支,但是紫色和青色... 

【文章来源】：山东大学学报(理学版). 2020,55(11)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
0 引言
1 实验材料与方法
    1.1 样本采集及处理
    1.2 DNA提取、PCR扩增及测序
    1.3 数据处理
2 结果与分析
    2.1 3种色型仿刺参16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列特征分析
    2.2 3种色型仿刺参群体遗传多样性分析
    2.3 遗传距离分析
    2.4 系统发育树构建
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]光照对白刺参、青刺参和紫刺参生长、消化及免疫的影响[J]. 李静,刘佳亮,曹学彬,王福辰,李君华,郑龙华,郭治诚,孙路平,刘石林.  大连海洋大学学报. 2020(02)
[2]基于多个线粒体序列的中韩俄沿海不同地理群体刺参的遗传多样性及种群结构分析[J]. 王锦锦,廖梅杰,李彬,王印庚,荣小军,张正,葛建龙.  渔业科学进展. 2020(01)
[3]仿刺参线粒体全基因组序列结构及比较研究[J]. 李云峰,李梦遥,王健,高祥刚,赫崇波,周遵春,杨爱馥.  水产科学. 2012(08)
[4]4种海参16S rRNA和COI基因片段序列比较及系统学研究[J]. 陈丽梅,李琪,李赟.  中国水产科学. 2008(06)

博士论文
[1]不同色型仿刺参Apostichopus japonicus（Selenka）环境适应性与营养需求的比较研究[D]. 柏雨岑.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]基于高通量测序的刺参白化发生和子代体色分离研究[D]. 马得友.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2013



本文编号：3205422