纤维蛋白原相关蛋白与Kruppel样因子在罗氏沼虾先天免疫中的初步功能研究

发布时间：2021-08-07 05:03

　　自然界中一般认为高等脊椎动物是既具有先天性免疫,也具有获得性免疫的,而在无脊椎动物中由于缺乏真正的抗体和特异性的免疫性细胞,因此机体的防御反应只有先天性免疫。本文对罗氏沼虾的先天性免疫做出了相关研究。1.WSSV刺激后罗氏沼虾淋巴器官的转录组分析。罗氏沼虾（Macrobrachiumrosenbergii）是一种具有经济重要性的甲壳类动物,一般认为成虾对白斑综合征病毒（WSSV）感染耐受。本研究采用新一代测序来确定WSSV感染淋巴器官和对照组淋巴器官之间的转录组差异。从对照样品和WSSV感染样品中分别产生总共44,606,694和40,384,856个纯净读段并组装成73,658和72,374个基因。基于同源搜索,KEGG,GO和COG分析,21,323个基因被注释。其中,鉴定出4951个差异表达基因,并将其分类到244个代谢途径。以凝血级联和模式识别受体信号通路为例,讨论宿主对WSSV感染的反应。我们还鉴定了 12,308个简单序列重复序列,可以进一步用作功能标记。该结果有助于更好地理解虾淋巴器官对WSSV的免疫应答,在缺少虾基因组背景下,可以提供虾的新基因信息。2.纤维蛋白原样凝集... 

【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：92 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２．３．２．１罗氏沼虫下的同源性检索

Ｚ?Ｃｙｔｏｓｋｅｌｅｔｃｘｉ??Ｆｕｎｃｔｉｏｎ?Ｃｌａｓｓ??图２．２．３．３罗氏沼虾转录组的ＣＯＧ功能分类??Ｆｉｇ．?２．２．３．３?ＣＯＧ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｍ．?ｒｏｓｅｎｂｅｒｇｉｉ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ??１７??

２．３．４差异表达基因（ＤＥＧｓ）的ＧＯ网络分析??为了更好地了解ＷＳＳＶ感染的分子机制并在转录组水平阐明罗氏沼虾的抗??病毒过程，本次实验进行了对照样品和感染样品之间的ＤＥＧ比较。ＷＳＳＶ感染??后，ＤＥＧ的上调数量远远多于下调的数量，从而表明ＷＳＳＶ感染过程与转录物??积累有关（图２．３．３）。接下来，进行ＧＯ功能富集分析，并进行ＧＯ转录物组??装重叠群的网络，示于图２．３．４中。对于转录物组装重叠群，大部分基因本体过??表达与代谢过程有关，如“单一生物体过程”和“有机氮化合物过程”（Ｅ值分别为??３．７５Ｅ－０５和４．５Ｅ－０４）。在富集分析中，ＧＯ术语“催化活性”和“水解酶活性”分别??显示为分子功能类别中最显着的代表性术语，Ｅ值分别为５．８７Ｅ－０６和２．４５Ｅ－０５。??这些催化和水解酶相关过程可能在罗氏沼虾的淋巴器官ＷＳＳＶ反应中发挥重要??作用。此外，大部分反应发生在“胞外区”（Ｅ值为９．５９Ｅ－０７）。与对照样本相比，??我们还发现，在感染样本中许多异常表达的ＤＥＧｓ参与各种免疫过程，后文中的??纤维蛋白原相关蛋白基因与Ｋｒｕｐｐｅｌ样因子基因均来源于此。这里列出了一些涉??及凝血级联和模式识别受体的免疫基因（表４）。讨论部分提供了详细的解释。??

【参考文献】：
期刊论文
[1]抑癌基因KLF6在肿瘤中的研究进展[J]. 王小萼,汪宏波.  医学综述. 2008(14)
[2]无脊椎动物先天免疫模式识别受体研究进展[J]. 王金星,赵小凡.  生物化学与生物物理进展. 2004(02)

博士论文
[1]十足目甲壳动物C型凝集素功能研究[D]. 王显伟.山东大学 2012



本文编号：3327132