瘤背石磺代谢蛋白PAK2基因的克

发布时间：2021-11-24 03:38

　　p21活化蛋白激酶2（PAK2）在生物中具有促进细胞增殖生长、抗凋亡等重要作用,可激活细胞增殖生长相关基因的表达。为探究PAK2基因在石磺细胞增殖代谢中的作用,通过RACE技术克隆得到瘤背石磺（Onchidium reevesii）PAK2基因的cDNA全长,并利用实时荧光定量PCR（q RT-PCR）技术分析PAK2基因在不同组织中的相对表达情况。结果表明,瘤背石磺PAK2基因cDNA全长1 809 bp,包含1 488 bp的开放阅读框,共编码495个氨基酸,基因序列较为保守。序列分析结果显示,瘤背石磺和光滑双脐螺（Biomphalaria glabrata）PAK2基因相似度达到83%,氨基酸序列同源性高达88%。通过生物进化分析研究得出瘤背石磺与绿色海蜗牛（Elysia chlorotica）的进化关系相对较近。q RT-PCR结果显示,肠道和背部PAK2基因表达量明显高于其他组织,其次为神经组织和肝胰腺,腹足、口器和性腺的表达量处于中等水平,而蛋白腺表达最低。初步阐明了瘤背石磺PAK2基因的生物信息学特征以及在各组织中的表达水平,为研究其在石磺科贝类中的具体作用机理奠定了基础... 

【文章来源】：安徽农业大学学报. 2020,47(02)CSCD

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【图文】：

PAK2序列和推测编码的氨基酸序列

PAK2三级结构预测

瘤背石磺PAK2所编码氨基酸和其他物种的PAK2所编码氨基酸具有相似序列，瘤背石磺、光滑双脐螺（Biomphalaria glabrata）、绿色海蜗牛（Elysia chlorotica）和加州海兔（Aplysia californica)PAK2氨基酸序列预测分析（图3），序列同源性分别为88%、85%和84%。运用ML法构建瘤背石磺PAK2氨基酸序列与光滑双脐螺、绿色海蜗牛、加州海兔、福寿螺（Pomacea canaliculata）和长牡蛎（Crassostrea gigas）等软体动物门12种动物的PAK2序列的系统进化树（图4）分析结果显示，腹足纲类、瓣鳃纲类以及头足类生物分别聚类为一支。其中腹足纲类动物中瘤背石磺和绿色海蜗牛的PAK2聚类为一支，再与光滑双脐螺和加州海兔聚类为一大支。通过氨基酸序列对比以及进化树分析可以得出瘤背石磺与绿色海蜗牛的进化关系相对较近。


本文编号：3515155