AFLP银染法和荧光标记法对文蛤遗传多样性评价的效果分析
发布时间:2022-10-08 11:22
以文蛤山东种群(SD)和广西种群(GX)为实验材料,比较分析了AFLP银染法和荧光标记法对遗传多样性的评价效果。结果显示,AFLP荧光标记法在选择性扩增引物5’端加了FAM荧光标记,产物直接在DNA测序仪上检测,自动采集图像和数据,较银染法的数据准确度更高、稳定性更好。从遗传参数来看,银染法和荧光标记法获得的GX种群的多态位点比例、Nei’s基因多样性指数和香侬信息指数均高于SD种群,表明两种方法遗传多样性评价的结果一致。AFLP荧光标记法在文蛤两种群中共获得244个扩增位点,多态位点比例为94.26%,均高于银染法(177个扩增位点,多态位点比例85.31%)。文蛤SD和GX种群的扩增位点数、多态位点比例、Nei’s基因多样性指数和香侬信息指数均是荧光标记法>银染法。
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.2.1 基因组DNA的提取
1.2.2 酶切、连接、预扩增和选择性扩增
1.2.3 PCR产物检测
1.3 数据处理与分析
2 结果与分析
2.1 AFLP荧光标记法和银染法的指纹图谱和多态性比较分析
2.2 AFLP银染法和荧光标记法对文蛤种群遗传多样性评价的效果分析
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]文蛤(Meretrix meretrix)4个壳色花纹品系的遗传差异分析[J]. 朱东丽,林志华,董迎辉,姚韩韩. 海洋与湖沼. 2011(03)
[2]泥蚶4个快速生长家系的遗传变异分析[J]. 姚韩韩,董迎辉,林志华,朱东丽. 水产学报. 2011(03)
[3]三种蛏的遗传多样性分析[J]. 邵艳卿,陆荣茂,董迎辉,柴雪良,肖国强,林志华. 海洋科学. 2009(10)
[4]广西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志华,黄晓婷,董迎辉,包振民,胡景杰. 海洋与湖沼. 2009(01)
[5]基于形态参数和AFLP标记的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群体遗传变异分析[J]. 林志华,董迎辉,李宁,陆荣茂,肖国强,柴雪良,刘保忠,孙长森,包振民,胡景杰. 海洋与湖沼. 2008(03)
[6]帘蛤科4种养殖蛤群体遗传多样性和种间关系的fAFLP分析[J]. 彭永兴,程汉良,夏德全,吴婷婷,孟学平,吉红九,董志国. 海洋科学. 2008(01)
[7]兔荧光扩增片段长度多态性分析体系的建立[J]. 郭雄明,任文陟,张嘉保. 军医进修学院学报. 2007(03)
[8]合浦珠母贝遗传连锁图谱的构建[J]. 喻达辉,王小玉,黄桂菊,郭奕惠,龚世园,王爱民. 中国水产科学. 2007(03)
[9]我国沿海不同群体文蛤遗传差异RAPD分析[J]. 冯建彬,李家乐,王美珍,陈汉春. 海洋渔业. 2005(04)
[10]利用RAPD和AFLP标记初步构建太平洋牡蛎的遗传连锁图谱[J]. 李莉,郭希明. 海洋与湖沼. 2003(05)
本文编号:3687628
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
1.2.1 基因组DNA的提取
1.2.2 酶切、连接、预扩增和选择性扩增
1.2.3 PCR产物检测
1.3 数据处理与分析
2 结果与分析
2.1 AFLP荧光标记法和银染法的指纹图谱和多态性比较分析
2.2 AFLP银染法和荧光标记法对文蛤种群遗传多样性评价的效果分析
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]文蛤(Meretrix meretrix)4个壳色花纹品系的遗传差异分析[J]. 朱东丽,林志华,董迎辉,姚韩韩. 海洋与湖沼. 2011(03)
[2]泥蚶4个快速生长家系的遗传变异分析[J]. 姚韩韩,董迎辉,林志华,朱东丽. 水产学报. 2011(03)
[3]三种蛏的遗传多样性分析[J]. 邵艳卿,陆荣茂,董迎辉,柴雪良,肖国强,林志华. 海洋科学. 2009(10)
[4]广西文蛤(Meretrix)的fAFLP及ITS分析[J]. 林志华,黄晓婷,董迎辉,包振民,胡景杰. 海洋与湖沼. 2009(01)
[5]基于形态参数和AFLP标记的文蛤(Meretrix meretrix)不同地理群体遗传变异分析[J]. 林志华,董迎辉,李宁,陆荣茂,肖国强,柴雪良,刘保忠,孙长森,包振民,胡景杰. 海洋与湖沼. 2008(03)
[6]帘蛤科4种养殖蛤群体遗传多样性和种间关系的fAFLP分析[J]. 彭永兴,程汉良,夏德全,吴婷婷,孟学平,吉红九,董志国. 海洋科学. 2008(01)
[7]兔荧光扩增片段长度多态性分析体系的建立[J]. 郭雄明,任文陟,张嘉保. 军医进修学院学报. 2007(03)
[8]合浦珠母贝遗传连锁图谱的构建[J]. 喻达辉,王小玉,黄桂菊,郭奕惠,龚世园,王爱民. 中国水产科学. 2007(03)
[9]我国沿海不同群体文蛤遗传差异RAPD分析[J]. 冯建彬,李家乐,王美珍,陈汉春. 海洋渔业. 2005(04)
[10]利用RAPD和AFLP标记初步构建太平洋牡蛎的遗传连锁图谱[J]. 李莉,郭希明. 海洋与湖沼. 2003(05)
本文编号:3687628
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