青海省6种裂腹鱼COI基因作为DNA条形码的适用性初探

发布时间：2022-12-10 01:23

　　青海省裂腹鱼鱼类至少有20种,占土著鱼类的40%以上,具有重要的生态价值。由于生态环境的恶化和人为因素的干扰,很多物种群已濒临灭绝。快速和准确的物种鉴定对于这些物种的保护至关重要,而基于形态学的传统分类法很难满足这一需求。因此,本研究通过DNA条形码技术初步探讨了在青海省裂腹鱼物种鉴定中的适用性。本研究中,测序获得了青海26尾裂腹鱼（6个物种）的细胞色素c氧化酶亚基I （COI）基因,并经GenBank数据库进行比对;基于K2P模型分析COI序列变异;运用贝叶斯法（BI）和最大似然法（ML）构建系统发育树。结果显示,6种裂腹鱼COI序列检测得到15个单倍型,且各物种间无共享的单倍型。基于K2P模型,最大种内遗传距离和最小种间遗传距离分别为（0.621±0.297）%和（2.792±0.644）%。种间平均遗传距离为（12.205±1.307）%,约为种内平均遗传距离（（0.327±0.162）%）的37倍,表明各物种的COI序列间已经形成明显"条形码间隙"。AMOVA分析显示,遗传变异主要来自种间,约占97.05%;FST=0.970 54,p＜0.01,说明各物种间分化程度极高。此外... 

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 COI基因序列分析
    1.2 遗传变异分析
    1.3 系统发育关系分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 材料
    3.2 DNA提取及PCR扩增
    3.3 数据分析


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3715771