Gliomastix和Phialophora多样性及分类研究

发布时间：2020-05-05 03:51

【摘要】：粘鞭霉属(Gliomastix),属子囊菌门(Ascomycota),粪壳菌纲(Sordariomycetes);瓶霉属(Phialophora),属子囊菌门(Ascomycota),散囊菌纲(Eurotiomycetes)。两属真菌常见而广布,多营腐生或弱寄生生活,二者普遍生存于土壤。Gliomastix属真菌在医药、农业及工业上具有开发应用前景,Phialophora属真菌是多种植物和人的致病菌,对两属、种的准确鉴定是研究、利用两属真菌的基础。本研究自2016年至2018年,自贵阳、遵义、凯里、毕节、福州等地采集土壤标本500余份,通过平板稀释法分离得到300余个菌株,经鉴定,其中11株为粘鞭霉属,7株为瓶霉属phialophora-like,在上述城市均分离到粘鞭霉属,证明该属广泛存在于土壤中。另外,山东农业大学赠送了21株粘鞭霉属菌株,22株瓶霉属菌株,采集地为贵州、湖北、海南、广西、四川和青海等省。对粘鞭霉属菌株,在形态学研究的基础上,利用ITS、LSU、SSU、tub2和rpb2五个基因片段,分别通过最大似然法(Maximum Likelihood)、最大简约法(Maximum Parsimony)和邻接法(Neighbor-joining tree)构建单基因和多基因进化树进行系统学分析,并通过分析各个基因标签对该属真菌种的区分度和可信度(自举支持率),对5个基因标签做出评价,结果:ITS、LSU、tub2和rpb2对种的区分度较高,分支处的自举支持率由小到大为:tub2ITSLSUrpb2,SSU对种的区分度不高,部分近似种不能被区分开,因此,推荐使用ITS、LSU、tub2和rpb2鉴定粘鞭霉属。本文鉴定出4个粘鞭霉属的种:Gliomastix felina、G.rosegrise、G.murorum和G.polychroma。对于phialophora-like菌株,根据构建的ITS,LSU和tub2基因加合树及ITS序列单基因进化树,并参考文献,把phialophora-like的种划分到另外15个属,并组建了3个新组合种:Gaeumannomyces zeicola com.nov.(Deacon,D.B.ScottW.Gams)K.Y.WangY.L.Jiang,G.graminicola com.nov.(Deacon,D.B.ScottW.Gams)K.Y.WangY.L.Jiang Ramophialophora geniculate com.nov.(Emden J.H.Van.)K.Y.WangY.L.Jiang,另外,发现2个中国新纪录种Capronia leucadendri、Fonsecaea multimorphosa。为比较粘鞭霉属4个种和瓶霉属6个种的物种间结构差异,对这些种的ITS2的核苷酸序列进行了比对分析并预测其二级结构模型,结果表明:核苷酸比对构建的系统树与ITS2二级结构特征的比较结果基本一致,这段高度保守的序列对系统树的构建以及亲缘关系起判定作用,说明ITS2二级结构对两属的鉴定和亲缘关系研究有效。本试验所有标本和菌株保存于贵州大学农学院植物病理学实验室标本室(HGUP)。
【图文】：

支持率,霉属,系统发育树,外群

24图 1 基于 LSU，ITS 序列对粘鞭霉属构建的系统发育树 ML 与 MP 节点支持率值大于 50%的数值标在分枝处，，以 Acremonium alcalophilum（JCM7366）为外群.Fig. 1 Phylogentic tree of Gliomastix generated from Maximum Likelihood analysis and Maximum Parsimonyanalysis based on combined LSU, ITS sequences. Bootstrap values of ML、MP ≥50%areshownabovethebranches.The tree is rooted with Acremonium alcalophilum（JCM7366）.

自举,支持率

自举支持率"g50%显示在支上ing tree obtained from the 19 rpb2 sequences data. Bootstrap values a
【学位授予单位】：贵州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：Q949.32

【参考文献】