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产鼠李糖脂生物表面活性剂防御假单胞菌的构建与优化

发布时间:2020-07-18 05:25
【摘要】:鼠李糖脂(Rhamnolipid)生物表面活性剂主要通过铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)发酵法生产获得,但是铜绿假单胞菌较强的条件致病性限制了其在工业中的应用。利用基因工程手段构建一株相对安全且高效的鼠李糖脂生产菌株,是目前该领域研究的重点。本研究利用假单胞菌的重组酶系统敲除防御假单胞菌Pf-5(Pse-udomonas protegens Pf-5)的羟基脂肪酸合成编码基因pha,从而消除鼠李糖脂合成的竞争性抑制作用,增加鼠李糖脂产量。与此同时,通过两亲本接合转移的方法整合来源于P.aeruginosa PAO1的鼠李糖基转移酶基因(Rhamnosyltransferase gene,rhlAB)于Pf-5基因组中。本研究利用Red/ET DNA重组技术对实验室已有的含鼠李糖基转移酶基因的表达载体pBBR1-genta-RhlAB进行修饰,将3种不同强度组成型启动子(P_(apra)、P_(tac)和P_(rhaB))成功替换了P.aeruginosa PAO1中的P_(RhlAB)原始启动子,构建了表达载体pBBR1-genta-P_(apra)-RhlAB,p-BBR1-kan-P_(tac)-RhlAB和pBBR1-kan-P_(rhaB)-RhlAB,并将这些表达载体分别在P.protegens Pf-5中异源表达,实现了不同产量的鼠李糖脂异源合成。在LB培养基中摇瓶发酵至42 h时,Pf-5/pBBR1-genta-RhlA B的鼠李糖脂产量为17.56 mg/L,而Pf-5/pBBR1-genta-P_(apra)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-kan-P_(tac)-RhlAB和Pf-5/pBBR1-kan-P_(rhaB)-RhlAB的鼠李糖脂产量分别是11.135 mg/L,441.135 mg/L,557.764 mg/L,启动子优化后鼠李糖脂产量分别是原始启动子的0.63,25.12和31.76倍。进一步对工程菌株进行培养基优化,以1%的葡萄糖为碳源的LB培养基中摇瓶发酵至42 h时,工程菌Pf-5/pBBR1-genta-P_(apra)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-genta-P_(apra)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-kan-P_(tac)-RhlAB,Pf-5/pB-BR1-kan-P_(rhaB)-RhlAB的鼠李糖脂产量分别为18.778 mg/L,38.859mg/L,375.742 mg/L,418.551 mg/L。在以橄榄油为碳源的LB培养基中摇瓶发酵至42 h时,工程菌Pf-5/pBBR1-genta-P_(apra)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-genta-P_(apra)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-kan-P_(tac)-RhlAB,Pf-5/pBB-R1-kan-P_(rhaB)-RhlAB的鼠李糖脂产量分别为30.208 mg/L,55.011 mg/L,937.887 mg/L,844.517 mg/L。以1%的橄榄油为碳源的PG培养基中摇瓶发酵至42 h时,工程菌Pf-5/pBBR1-kan-P_(tac)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-kan-P_(rhaB)-RhlAB的鼠李糖脂产量分别为403.27 mg/L,522.034 mg/L。以1%的橄榄油为碳源的MSP培养基中摇瓶发酵至42 h时,工程菌Pf-5/pBBR1-kan-P_(tac)-RhlAB,Pf-5/pBBR1-kan-P_(rhaB)-RhlAB的鼠李糖脂产量分别为410.022 mg/L,586.079 mg/L。获得了最优生产鼠李糖脂工程菌Pf-5/pBBR1-kan-P_(tac)-RhlAB,鼠李糖脂产量达到937.887 mg/L。对发酵产物进行高效液相色谱-质谱联用技术分析,共检出相对含量变化的4类质核比不同的鼠李糖脂同系物。并通过实时荧光定量PCR定量分析rhlAB基因,在P_(apra),P_(tac)和P_(rhaB)启动子调控下,rhlAB基因的相对表达量分别是原始启动子调控下的0.93,2.16和2.77倍。本研究首次在防御假单胞菌Pf-5中对rhlAB基因进行了调控功能研究,利用定向遗传改造的方法成功构建了鼠李糖脂高产菌株,为实现鼠李糖脂rhlAB基因异源高效表达和合成调控奠定了相关基础。
【学位授予单位】:湖南师范大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:Q78
【图文】:

重组载体,鼠李糖脂,同源重组,质粒载体


重组载体 pBeloBAC11-oriT-TnpA-genta-RhlAB。将重组载体 pBeloBAC11-oriT-TnpA-genta-RhlAB 电转入 ET12567 菌株用于接合转移,鼠李糖脂基因 rhlAB 通过随机转座整合到 Pf-5/ pha 菌株的基因组上,最终获得 Pf-5/ pha-rhlAB。2.5 同源重组构建鼠李糖脂操纵子相关的表达载体2.5.1 构建重组载体 pBBR1-genta-Papra-RhlAB以载体 p15A-cm-apra 为模版,以 Papra-RhlAB-5'/Papra-RhlAB-3'为引物,扩增两端带有质粒 pBBR1-genta-RhlAB 上 rhlAB 原始启动子两侧同源臂的 apra+rbs(1011 bp)线性载体片段。将得到的 apra+rbs 线性片段与质粒载体 pBBR1-genta-RhlAB 一起电转入通过 L-阿拉伯糖诱导剂诱导的 E. coli GB05-red,在重组酶的作用下发生细胞内同源重组,apra+rbs 线性片段与质粒载体 pBBR1-genta-RhlAB 经同源臂退火杂交结合成环状,从而形成重组载体 pBBR1-genta-Papra-RhlAB,如图 2-1。

质粒载体,重组载体,载体,线性


从而形成重组载体 pBBR1-kan-Ptac-RhlAB,如图2-2。图 2-2 通过线环重组构建质粒 pBBR1-kan-Ptac-RhlABFigure 2-2 Constructions of pBBR1-kan-Ptac-RhlAB by LCHR2.5.3 构建重组载体 pBBR1-kan-PrhaB-RhlAB以载体 pBBR1-kan-PrhaB为模版,以引物 Rha-RhlAB-5'/Rha-RhlAB-3'扩增两端带有质粒 pBBR1-kan-Ptac-RhlAB 上 Ptac启动子两侧同源臂的 kan+rhaS+rhaR+PrhaB(3321 bp)线性载体片段。将获得的 kan+rhaS+rhaR+PrhaB线性片段与质粒载体 pBBR1-kan-Ptac-RhlAB一起电转入通过 L-阿拉伯糖诱导剂诱导的 E. coli GB05-red,在重组酶的作用下发生细胞内同源重组,kan+rhaS+rhaR+PrhaB线性片段与质粒载体 pBBR1-kan-Ptac-RhlAB 经同源臂退火杂交结合成环状,从而形成重组载体 pBBR1-kan-PrhaB-Rhl-AB,如图 2-3。

流程图,假单胞菌,鼠李糖脂,表达载体


图 2-3 通过线环重组构建质粒 pBBR1-kan-PrhaB-RhlABFigure 2-3 Constructions of pBBR1-kan-PrhaB-RhlAB by LCHR2.6 鼠李糖脂表达载体转化入防御假单胞菌 Pf-5将测序正确的重组质粒 pBBR1-genta-RhlAB,pBBR1-genta-Papra-RhlAB,pBBR1-kan-Ptac-RhlAB,pBBR1-kan-PrhaB-RhlAB 通过常温电转化法转入防御假单胞菌 Pf-5 中,图 2-4 为本研究中构建 Pf-5 重组工程菌流程图。

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本文编号:2760477

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