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蛋白质转运过程中易位子通道结构变化的分子动力学模拟研究

发布时间:2020-12-06 13:38
  蛋白质的转运必须要借助一个引导通道来完成,该引导通道称为易位子(Sec)。Sec辅助新生肽插入到膜中或分泌到膜外的过程,是所有生物细胞中普遍存在且必不可少的。真核细胞中的易位子是Sec61,该分子是一个由α,β和γ三个亚基组成的三聚体,Sec61α亚基是由10个跨膜(transmembrane,TM)螺旋构成的一个通道结构,其中TM2和TM7螺旋构成了一个侧门。在Sec61α通道中,如果新生肽是整合膜蛋白,则侧门打开,允许其通过侧门插入到膜中,否则侧门不打开,新生肽被分泌到膜外。在插入过程中,Sec61α通道结构的变化对新生肽的膜插入和维持膜的渗透性屏障至关重要。近些年来,虽然对Sec61α通道结构的研究已取得一些进展,但对Sec61α通道构象转变过程中,结构恢复能力,侧门、孔环、栓塞间的联动机制仍不清楚。阐明Sec61α通道辅助蛋白质插入膜过程的分子机制一直是生物化学领域的研究热点。由于实验手段所限,计算机模拟成为该领域研究的有力工具。此外,Sec61α辅助蛋白质进行膜插入过程需要很多相关分子共同完成,膜插入过程极其复杂,其时空尺度跨度很大,传统的全原子模拟不能达到此过程所需的时空尺... 

【文章来源】:广西民族大学广西壮族自治区

【文章页数】:68 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

蛋白质转运过程中易位子通道结构变化的分子动力学模拟研究


细胞膜的结构.

示意图,载体蛋白,运输机,离子通道


图 1-2 载体蛋白和通道蛋白运输机制示意图[4].1.1.1 离子通道和水通道目前发现的通道蛋白已经有 100 多种。离子通道(ion channel)位于细胞膜上,是由

示意图,插入膜,螺旋,过程


图 1-3 TM 螺旋插入膜的过程示意图[15].位的机制需要知道 Sec 结构的详细信息。Hanein[20]n[24]等人通过单颗粒电子显微镜获得低分辨率分离的结合的复合物结构。Breyton[25]等人根据二维晶体的电

【参考文献】:
期刊论文
[1]介观模拟研究温度对DPPC磷脂双层膜结构的影响[J]. 尹倩倩,史新元,丁海欧,戴幸星,乔延江.  计算机与应用化学. 2015(05)
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博士论文
[1]分子动力学模拟在几类重要蛋白研究中的应用[D]. 吴云剑.吉林大学 2014
[2]一类非平衡分子动力学模拟中优化方法的研究[D]. 杨坤.大连理工大学 2009

硕士论文
[1]新型多肽基人工离子通道的设计、合成及性质研究[D]. 谭思.河南师范大学 2017



本文编号:2901469

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