原生动物八肋游仆虫NMD途径UPF因子的功能分析
发布时间：2020-12-22 22:20
基因的准确表达对于机体细胞正常的生理活动至关重要,它受到了细胞中多种不同分子机制的调控。其中,无义介导的mRNA降解途径（nonsense-mediated mRNA decay,NMD）,它作为一种真核生物基因表达质量控制机制,能够识别并降解那些含有提前终止密码子（premature termination codons,PTCs）的无义mRNA。mRNA降解依赖于细胞内蛋白质翻译过程,目前已知可以调节植物、动物、真菌和纤毛虫中转录物的表达水平。无义mRNA的识别是NMD机制的核心,UPF（up-frameshift）蛋白质是识别和降解无义mRNA的一类关键因子。前期研究表明,在八肋游仆虫（Euplotes octocarinatus）细胞中仅有UPF1和UPF2两种UPF蛋白质,没有发现存在于人和酵母等细胞中的UPF3。生物信息学分析显示,八肋游仆虫的UPF2（EoUPF2）包含三个串联的MIF4G（middle domain of translation initiation factor 4G）结构域和一个C末端UPF1的结合区域。大多数真核生物共享核心NMD因子,而NMD途径...
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
异常终止过程
1.2 NMD 途径的底物[2]一些 mRNAs，包含一个或多个上游开放阅读框（upstream open reading framFs）（图 1.2C），由于 EJC 不会被翻译过程中的核糖体从 mRNA 上解离，导 介导的 NMD 途径，但是也不是所有的 uORFs 都会被 NMD 降解[11]，如血素（thrombopoietin, TPO）就是这样一个例子。
图 1.3 NMD 中两种复合体结构[37]1.3.3 EJC 复合体外显子连接复合体（EJC），沉积在 mRNA 外显子连接处上游[22,38]，大约 20-24个核苷酸的位置[21,31,34]，形成拼接的 mRNA 核糖核蛋白颗粒（mRNAribonucleoprotein[39]
【参考文献】：
期刊论文
[1]UPF2介导八肋游仆虫NMD途径SURF和EJC的耦联[J]. 柴杨丽,吕佳,周宝春,梁爱华,柴宝峰. 山西大学学报(自然科学版). 2019(03)
[2]长链非编码RNAGAS5抑制内皮细胞功能[J]. 孙玉聪,楚海荣,李宏,官秀梅,张晓芸,崔晓栋,成敏. 中国生物化学与分子生物学报. 2018(08)
[3]八肋游仆虫NMD通路的初步研究[J]. 石文鑫,王美,柴杨丽,吕佳,张志云,王刚,柴宝峰. 中国细胞生物学学报. 2018(06)
[4]SMG1-UPF1-eRF1-eRF3复合体参与贾第虫无义介导的mRNA降解激活[J]. 王美,吕佳,石文鑫,柴杨丽,文建凡,张西臣,柴宝峰. 中国生物化学与分子生物学报. 2018(05)
[5]千金藤素对乳腺癌细胞MDA-MB-231自噬降解的影响[J]. 邓琴,傅若秋,高宁. 第三军医大学学报. 2017(24)
[6]酿酒酵母TORC1通路上游调控元件以及在核糖体合成中的作用[J]. 张文哲,李万杰. 中国细胞生物学学报. 2017(11)
[7]无义mRNA降解途径的机制与进化[J]. 柴宝峰,王美,石文鑫,柴杨丽,吕佳. 山西大学学报(自然科学版). 2017(03)
[8]9种发热伴出疹病原体基因芯片检测方法的建立[J]. 徐胜平,刘琪琦,张严峻,王升启. 军事医学. 2017(02)
[9]SYBR Green II荧光定量PCR结合熔解曲线鉴别不同亚型兔病毒性出血症病毒方法的建立[J]. 谭永贵,刘腾,朱杰,郭慧敏,吴巧梅,李琦,缪秋红,陈宗艳,李传峰,刘光清. 中国动物传染病学报. 2017(01)
[10]镉胁迫下黑点青鳉(Oryzias melastigma)肝脏金属硫蛋白mRNA性别差异性表达研究[J]. 谢晴,薄军,郑榕辉,洪幅坤,张玉生. 生态毒理学报. 2016(06)
博士论文
[1]F9基因无义突变导致重型血友病的分子机制[D]. 王刚.山西大学 2013
[2]mTOR抑制剂Rapamycin联合RNAi沉默STAT3基因诱导BEL-7402肝癌细胞凋亡的实验研究[D]. 张毅.吉林大学 2012
[3]IUGR猪的生长与肠道发育及L-精氨酸和大豆卵磷脂的营养调控研究[D]. 王远孝.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]eRF1的C端结构域在终止密码子识别过程中的功能[D]. 闫静.山西大学 2017
[2]日本血吸虫性相关Tsunagi基因的克隆、表达及初步鉴定[D]. 王晓楠.安徽医科大学 2008
本文编号：2932534
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
异常终止过程
1.2 NMD 途径的底物[2]一些 mRNAs，包含一个或多个上游开放阅读框（upstream open reading framFs）（图 1.2C），由于 EJC 不会被翻译过程中的核糖体从 mRNA 上解离，导 介导的 NMD 途径，但是也不是所有的 uORFs 都会被 NMD 降解[11]，如血素（thrombopoietin, TPO）就是这样一个例子。
图 1.3 NMD 中两种复合体结构[37]1.3.3 EJC 复合体外显子连接复合体（EJC），沉积在 mRNA 外显子连接处上游[22,38]，大约 20-24个核苷酸的位置[21,31,34]，形成拼接的 mRNA 核糖核蛋白颗粒（mRNAribonucleoprotein[39]
【参考文献】：
期刊论文
[1]UPF2介导八肋游仆虫NMD途径SURF和EJC的耦联[J]. 柴杨丽,吕佳,周宝春,梁爱华,柴宝峰. 山西大学学报(自然科学版). 2019(03)
[2]长链非编码RNAGAS5抑制内皮细胞功能[J]. 孙玉聪,楚海荣,李宏,官秀梅,张晓芸,崔晓栋,成敏. 中国生物化学与分子生物学报. 2018(08)
[3]八肋游仆虫NMD通路的初步研究[J]. 石文鑫,王美,柴杨丽,吕佳,张志云,王刚,柴宝峰. 中国细胞生物学学报. 2018(06)
[4]SMG1-UPF1-eRF1-eRF3复合体参与贾第虫无义介导的mRNA降解激活[J]. 王美,吕佳,石文鑫,柴杨丽,文建凡,张西臣,柴宝峰. 中国生物化学与分子生物学报. 2018(05)
[5]千金藤素对乳腺癌细胞MDA-MB-231自噬降解的影响[J]. 邓琴,傅若秋,高宁. 第三军医大学学报. 2017(24)
[6]酿酒酵母TORC1通路上游调控元件以及在核糖体合成中的作用[J]. 张文哲,李万杰. 中国细胞生物学学报. 2017(11)
[7]无义mRNA降解途径的机制与进化[J]. 柴宝峰,王美,石文鑫,柴杨丽,吕佳. 山西大学学报(自然科学版). 2017(03)
[8]9种发热伴出疹病原体基因芯片检测方法的建立[J]. 徐胜平,刘琪琦,张严峻,王升启. 军事医学. 2017(02)
[9]SYBR Green II荧光定量PCR结合熔解曲线鉴别不同亚型兔病毒性出血症病毒方法的建立[J]. 谭永贵,刘腾,朱杰,郭慧敏,吴巧梅,李琦,缪秋红,陈宗艳,李传峰,刘光清. 中国动物传染病学报. 2017(01)
[10]镉胁迫下黑点青鳉(Oryzias melastigma)肝脏金属硫蛋白mRNA性别差异性表达研究[J]. 谢晴,薄军,郑榕辉,洪幅坤,张玉生. 生态毒理学报. 2016(06)
博士论文
[1]F9基因无义突变导致重型血友病的分子机制[D]. 王刚.山西大学 2013
[2]mTOR抑制剂Rapamycin联合RNAi沉默STAT3基因诱导BEL-7402肝癌细胞凋亡的实验研究[D]. 张毅.吉林大学 2012
[3]IUGR猪的生长与肠道发育及L-精氨酸和大豆卵磷脂的营养调控研究[D]. 王远孝.南京农业大学 2011
硕士论文
[1]eRF1的C端结构域在终止密码子识别过程中的功能[D]. 闫静.山西大学 2017
[2]日本血吸虫性相关Tsunagi基因的克隆、表达及初步鉴定[D]. 王晓楠.安徽医科大学 2008
本文编号：2932534
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/2932534.html
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