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拟南芥RNA编辑因子(MORF2)和线粒体RNA聚合酶(RPOTm)结构与功能研究

发布时间:2021-01-02 08:25
  RNA编辑是一种转录后修饰过程,通过碱基的插入、删除或替换可以改变RNA分子的遗传信息。RNA编辑通常发生在植物的质体和线粒体中,会改变编码的核苷酸,引入新的启动子和终止子,具有校正和调控翻译等生物学意义。目前为止已经鉴定出许多RNA编辑因子。2005年,发现了第一个RNA编辑因子CRR4,它是PLS型五肽重复(PPR)蛋白家族的成员。随后又发现许多其他PLS型PPR蛋白参与植物RNA编辑。事实上,所有研究的PPR蛋白都位于质体或线粒体中。一般认为PPR蛋白是一类参与RNA编辑的反式作用因子,作为RNA结合蛋白起作用。还有一类非PPR蛋白质对开花植物叶绿体和线粒体中的RNA编辑也是必须的,它们被称为MORF蛋白或RIP蛋白家族。MORF蛋白是一个小蛋白家族,在拟南芥中有10个成员。其中MORF2和MORF9位于质体中,MORF1和MORF3-7位于线粒体中,MORF8则是定位于两个细胞器中,MORF10则被认为不参与RNA编辑。通过酵母双杂交实验以及pull down实验表明,MORF蛋白之间存在相互作用,能形成同源或异源聚合体,说明MORF蛋白可能需要共同作用来参与编辑。在本篇论文中... 

【文章来源】:安徽大学安徽省 211工程院校

【文章页数】:99 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

拟南芥RNA编辑因子(MORF2)和线粒体RNA聚合酶(RPOTm)结构与功能研究


图1-2.拟南芥PPR蛋白的基序结构.(Lurin,Andres?e/“/.,2004)??Figure?1-2.?Motif?structure?of?PPR?proteins?involved?in?Arabidopsis?thaliana.??

拟南芥,假基因,突变体,蛋白


Motifs??P?□?LI?□?L2?■?S?□?E?L?.」E+lH?DYWl?1??图1-2.拟南芥PPR蛋白的基序结构.(Lurin,Andres?e/“/.,2004)??Figure?1-2.?Motif?structure?of?PPR?proteins?involved?in?Arabidopsis?thaliana.??(Lurin,Andres?el?^/.,2004)??大部分PPR蛋白只影一个或是两个编辑位点,如cvt28的突变体有两个编??辑位点受到影响、〇妒82突变体有两个、突变体有一个和突变体中仅??仅也只有一个编辑位点受到了影响。但是也有一部分PPR蛋白能影响6至8个??编辑位点,甚至更多。如PDM1,它能影响大约27个编辑位点I66]。但是分析这??4??

晶体结构,复合物,残基,基序


它们在MORF家族中的确切作用很大程度上仍然未知。??一系列研宄表明,MORF蛋白可与PLS型PPR蛋白结合173],最近己经确定??了?MORF9和PLS型PPR蛋白复合物中的晶体结构,如图1-5。清楚地观察到??—个(PLS)3PPR结合三个M0RF9分子,每个M0RF9与接近其凹面的PLS三??联体相互作用|7(11。该相互作用主要涉及MORF9的D164和来自PLS三联体的??L型基序的K29,在这两个残基中的任一处的单个突变都会完全消除了相互作用。??此外,从M0RF9的残基W160、L162和L-和S-型基序的相关残基观察到广泛??的疏水相互作用l7u】。??a?M0RF9?^?^??'-集??着%.??b??ISO?182?1?DT4?r?L162?^?W160??、L19?5165?A?S'*?Vr4i:16.??¥玲,26?Y17^'?S?Lt^^3Vv23"??1?123?<29^?_?<?t?丨、??.?、I?'?—?i::—??图1-5.?(PLS)3PPR和MORF9复合物的晶体结构。??(Yan,Zhang?et?al.,2017)??Figure?1-5.?Crystal?structure?of?(PLShPPR?in?complex?with?MORF9.??(Yan


本文编号:2953015

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