急性髓系白血病患者骨髓间充质干细胞衰老相关基因的生物信息学分析及验证

发布时间：2021-01-02 08:51

　　目的:通过生物信息学方法筛选急性髓系白血病（AML）患者骨髓间充质干细胞（BM-MSC）衰老相关的差异表达基因并予以验证,为AML的科研和临床提供新的分子标志物。方法:应用血液病医院AML患者BMMSC制作基因表达谱芯片并参考从NCBI数据库GEO中选取的芯片GSE84881,综合地进行数据分析并筛选差异表达基因。运用DAVID分析软件进行基因本体论（GO）富集分析和KEGG通路富集分析,筛选出与AML患者BM-MSC衰老相关的差异表达基因。收集病人及健康供者的骨髓样本,体外扩增MSC并应用RT-PCR技术检测衰老相关基因表达水平与芯片的一致性,辅以衰老相关β-半乳糖苷酶染色实验和MTT细胞增殖实验对AML患者BM-MSC表型和功能进行验证。结果:筛选出247个差异表达基因,其中有132个基因表达上调,115个基因表达下调。侧重分析6个衰老相关基因,包括表达上调基因COL3A1（P=0.025）、CRYAB（P=0.0003）、DCN（P=0.0368）以及表达下调基因CCL2（P=0.0256）、CTSC（P=0.0001）、IL6（P=0.0482）。RT-PCR实验结果提示,上述... 

【文章来源】：中国实验血液学杂志. 2019年02期 北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
材料和方法
    试剂与仪器
    基因芯片样本
    细胞实验样本
    基因芯片的分析和差异表达基因的筛选
    衰老相关差异表达基因的RT-PCR检测
    衰老表型的衰老相关β-半乳糖苷酶 （senescenceassociatedβ-Galactosidase, SA-β-Gal） 的染色实验检测
    AML患者BM-MSC增殖能力的MTT检测
    统计学分析
结果
    基因芯片分析结果
    差异表达基因的GO分析、KEGG分析以及衰老相关基因的筛选
    RT-PCR检测结果
    细胞增殖能力的MTT检测结果
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]间充质干细胞在造血调控中的作用[J]. 霍思维,张毅.  中国实验血液学杂志. 2006(01)



本文编号：2953053