成人与新生儿来源的间充质干细胞circRNAs差异表达谱分析及功能预测

发布时间：2021-02-22 16:27

　　目的筛选成人与新生儿来源的间充质干细胞（mesenchymal stem cells,MSCs）的差异表达circRNAs,为进一步探究circRNAs在增龄调控MSCs细胞命运中的作用及机制提供理论基础。方法通过对微阵列数据GSE122178中的3例成人骨髓来源的间充质干细胞样本、3例围生期新生儿脐带血来源的间充质干细胞样本进行生物信息学分析,筛选差异表达的circRNAs,并预测其生物学功能和作用机制。结果新生儿脐带血来源的间充质干细胞与成人骨髓来源的间充质干细胞相比,66个circRNAs表达显著上调,107个circRNAs表达显著下调。其中hsa_circ₀080170表达上调最显著,hsa_circ₀060055表达下调最显著。hsa_circ₀080170具有6个下游miRNAs结合位点,714个靶基因;hsa_circ₀060055具有28个下游miRNAs结合位点,591个靶基因。KEGG分析显示,hs... 

【文章来源】：解放军医学院学报. 2020,41(10)

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【部分图文】：

hsa-miR370和hsa-miR203a的预测靶基因的前10条重要KEGG通路

图 5 hsa-miR370和hsa-miR203a的预测靶基因的前10条重要KEGG通路近年来,已有多项研究表明,增龄至少会影响MSCs的部分功能。Du等[14]发现,源自18 ～ 20岁、30 ～ 35岁、45 ～ 50岁三个不同年龄段捐赠者的牙周膜干细胞之间,细胞集落形成率、细胞周期和凋亡情况以及碱性磷酸酶活性存在显著差异。随着年龄的增长,牙周膜干细胞的集落形成能力下降,G2/S期细胞减少,细胞凋亡增加,成骨分化能力下降。此外,陈裕浩等[15]发现,与源于幼年雄性猕猴的骨髓间充质干细胞相比,源于老年雄性猕猴的骨髓间充质干细胞形态呈宽大、扁平形,细胞增殖缓慢,成骨、成软骨及成脂分化能力下降,伴随着IL-1β、IL-4、IL-6和TNF-α等细胞因子表达降低。然而,目前关于circRNAs在增龄对于MSCs细胞命运的调控机制中发挥的作用少有研究。

图1 3例成人骨髓来源的间充质干细胞样本(GSM3457280、GSM3457281、GSM3457282)和3例围生期新生儿脐带血来源的间充质干细胞样本(GSM3457283、GSM3457284、GSM3457285)的circRNAs表达谱图2 hsa-miR230a、hsa-miR370、hsa-miR197和hsa-miR1225-5p各自的miRDB和Targetscan数据库的下游靶基因预测结果及韦恩分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]年龄对猕猴骨髓间充质干细胞体外分化和细胞因子水平的影响[J]. 陈裕浩,朱向情,郭德镔,林庆铿,何志旭,潘兴华.  中国组织工程研究. 2017(25)



本文编号：3046257