植物腐生、病原及内生真菌中CAZymes的比较基因组学分析

发布时间：2021-03-02 15:43

　　作为真核生物中的一个庞大类群,真菌在自然界物质循环中扮演着不可或缺的地位。不同类型真菌在物质循环中发挥不同的作用,例如某些蕈类真菌可供人类食用,但一些真菌却对农作物具有侵染、破坏作用,如植物病原真菌。因此,如何更好地利用真菌成为了近年来真菌学的研究方向。真菌可以产生大量的碳水化合物活性酶（carbohydrate active enzymes,CAZymes）,该类物质是真菌生长发育过程中极为突出的蛋白家族,与真菌的生活方式可能紧密相关,同时也是降解木质纤维素,解决能源危机绿色生物平台搭建的重要酶类系统。本研究通过比较基因组学分析腐生、病原及内生真菌三种不同营养生活模式的真菌中CAZymes组成及含量,从而了解编码CAZymes基因的数量及多样性与真菌营养方式的关系并揭示三种类型真菌对木质纤维素的不同降解能力,为后期找到高效降解生物质的微生物提供可行性。本文主要的研究内容和结果如下:1.首先,本研究对课题组中9株内生真菌的原始序列进行组装拼接、基因预测等分析,在此基础上,同时和数据库中已知序列的88株真菌一起进行CAZymes筛选。结果发现,在囊括腐生、病原及内生真菌多种不同营养生活模... 

【文章来源】：江西师范大学江西省

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-19株真菌中蛋白数量Fig.2-1Numberofproteinsinninefungi

图 3-1 腐生、病原及内生真菌中 CAZymes 数量比较3-1 Comparison of CAZymes in saprophytic, pathogenic and endophyti图 3-2 腐生、病原及内生真菌中 CAZymes 数量差异性分析fference analysis of CAZymes in saprophytic、pathogenic and endophy

而病原真菌与腐生真菌中的碳水化合物物活性酶数量不存在差异（图3-2）。图 3-1 腐生、病原及内生真菌中 CAZymes 数量比较Fig. 3-1 Comparison of CAZymes in saprophytic, pathogenic and endophytic fungi图 3-2 腐生、病原及内生真菌中 CAZymes 数量差异性分析Fig. 3-2 Difference analysis of CAZymes in saprophyti

【参考文献】：
期刊论文
[1]半纤维素在植物细胞壁中分布的研究进展[J]. 马静,张逊,周霞,吉喆,许凤.  林产化学与工业. 2015(06)
[2]高效降解纤维素菌系的筛选分离及复合菌系的构建（英文）[J]. 尚婷婷,李全宏,邓尚贵.  Agricultural Science & Technology. 2015(04)
[3]木质素结构分析方法研究进展[J]. 武小芬,苏小军,陈亮,陈静萍,王克勤.  可再生能源. 2015(02)
[4]碳水化合物活性酶数据库（CAZy）及其研究趋势[J]. 王帅,陈冠军,张怀强,王禄山.  生物加工过程. 2014(01)
[5]木质素的结构研究与应用[J]. 路瑶,魏贤勇,宗志敏,陆永超,赵炜,曹景沛.  化学进展. 2013(05)
[6]菌物生物多样性及其资源研发前景——献给《菌物研究》创刊10周年[J]. 魏江春.  菌物研究. 2012(03)
[7]木质纤维素类生物质制取燃料及化学品的研究进展[J]. 余强,庄新姝,袁振宏,亓伟,王琼,谭雪松,许敬亮,张宇,徐慧娟,马隆龙.  化工进展. 2012(04)
[8]中国大型真菌分类学研究进展[J]. 王多,文涛.  安徽农业科学. 2011(34)
[9]真菌降解木质纤维素的功能基因组学研究进展[J]. 田朝光,马延和.  生物工程学报. 2010(10)
[10]转录因子相关数据库[J]. 陈鸿飞,王进科.  遗传. 2010(10)



本文编号：3059519