枸杞LbCO基因的克隆与生物信息学分析

发布时间：2021-04-10 14:20

　　CONSTANS （CO）基因是高等植物叶片中光周期途径的关键成分,生物钟及光信号控制CO基因的表达。本研究以宁夏枸杞（Lycium barbarum L.）品种之一‘宁杞7号’叶片为实验材料,通过转录组测序结果筛选,利用RT-PCR技术扩增得到‘宁杞7号’的CO基因cDNA全长序列,命名为LbCO。利用生物信息学手段对所获得的序列进行结果及功能预测,结果显示:LbCO基因的cDNA序列全长1 224 bp,编码407个氨基酸,分子质量为44.83 k D,理论等电点pI=5.58,不稳定指数为39.66,是一种稳定的非分泌蛋白。该蛋白亚细胞定位于细胞核,二级结构中无规则卷曲占比最高（54.48%）,其次为α-螺旋（28.99%）。系统进化分析表明枸杞LbCO蛋白与其它物种的CO蛋白具有较高的同源性,其中与辣椒属CO蛋白亲缘关系最近。本研究为后续进一步探讨该基因编码的蛋白在调控枸杞花期研究方面提供理论参考。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(01)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

‘宁杞7号’枸杞LbCO基因的cDNA序列

枸杞LbCO蛋白跨膜结构域预测分析

通过Swiss-Model对LbCO编码的蛋白建立三级结构空间模型预测(图8)，结果显示其蛋白三维结构主要以无规则卷曲及α-螺旋为主。图8 枸杞Lb CO编码蛋白三级结构预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]水稻生物钟相关基因的表达特征鉴定及其功能预测分析[J]. 董昭桐,雷雅琪,陈淼林,余婧,朱璐,许杰.  基因组学与应用生物学. 2016(03)
[2]不同产地宁夏枸杞土壤和果实中重金属含量比较研究[J]. 齐国亮,郑国琦,张磊,王俊,王彩艳,张艳.  北方园艺. 2014(15)



本文编号：3129792