粘质沙雷氏菌膜结合葡萄糖酸脱氢酶的纯化、鉴定与表征
发布时间:2021-05-08 09:04
2-酮基-D-葡萄糖酸(2-keto-D-gluconic acid,2KGA)是抗氧化剂D-异抗坏血酸及其钠盐合成的前体物质,被广泛应用于食品、药品、化工等领域。膜结合葡萄糖酸脱氢酶(gluconate dehydrogenase,GADH)是2KGA生物合成过程中一种重要的氧化还原酶,为提高2KGA的生产效率,有必要对其进行深入研究。本论文以2KGA生产菌株粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)JUIM03为研究材料,利用Triton X-114两相分离技术和层析技术从该菌株中分离纯化膜结合GADH,随后采用SDS-PAGE、可见光吸收光谱和MALDI-TOF-MS技术对纯化的蛋白进行分析,同时利用高效液相色谱和红外光谱技术对其催化氧化葡萄糖酸的产物进行鉴定,并系统研究膜结合GADH的酶学特性。在此基础上,采用LA-PCR(long and accurate polymerase chain reaction)技术克隆膜结合GADH的基因,并利用生物信息学在线分析工具和相关软件明确膜结合GADH蛋白的生物学信息。主要研究结果如下:(1)通过超声破碎细胞、Triton...
【文章来源】:江苏大学江苏省
【文章页数】:95 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
英文缩略表
第一章 绪论
1.1 粘质沙雷氏菌的相关研究进展
1.1.1 粘质沙雷氏菌简介
1.1.2 粘质沙雷氏菌的葡萄糖代谢及其发酵工业中的应用
1.1.3 粘质沙雷氏菌的2KGA合成代谢
1.2 FAD依赖性膜结合葡萄糖酸脱氢酶相关研究进展
1.2.1 FAD依赖性膜结合GADH的来源与结构
1.2.2 FAD依赖性膜结合GADH的纯化
1.2.3 膜结合GADH的克隆表达
1.3 膜蛋白概述
1.3.1 膜蛋白的定义与分类
1.3.2 TritonX-114 两相分离膜蛋白
1.3.3 膜蛋白的纯化技术
1.4 立题背景及意义
1.5 研究的主要内容
第二章 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的分离纯化与初步鉴定
2.1 实验材料
2.1.1 菌株
2.1.2 实验材料与仪器设备
2.1.3 培养基
2.2 实验方法
2.2.1 粘质沙雷氏菌JUIM03 细胞生长曲线的测定
2.2.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的分离纯化
2.2.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的电泳检测
2.2.4 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的吸收光谱分析
2.2.5 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 MALDI-TOF-MS分析
2.2.6 粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化氧化D-葡萄糖酸所形成产物的分析
2.3 结果与讨论
2.3.1 粘质沙雷氏菌JUIM03 生长曲线的变化分析
2.3.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的分离纯化
2.3.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 SDS-PAGE分析
2.3.4 粘质沙雷氏菌膜结合膜结合GADH在可见光区的吸收光谱分析
2.3.5 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 MALDI-TOF-MS分析
2.3.6 粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化GA形成产物的鉴定
2.4 本章小结
第三章 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的酶学性质
3.1 实验材料和仪器
3.1.1 主要试剂和材料
3.1.2 主要仪器与设备
3.2 实验方法
3.2.1 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的制备及活性测定
3.2.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH最适反应温度的测定
3.2.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的热稳定性测定
3.2.4 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的最适反应pH及 pH稳定性测定
3.2.5 金属离子对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化反应活性的影响
3.2.6 变性剂和EDTA对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.2.7 有机酸对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.2.8 有机溶剂对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.2.9 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的底物特异性实验
3.2.10 粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化反应动力学常数的测定
3.3 结果与讨论
3.3.1 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的最适反应温度
3.3.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的热稳定性
3.3.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的最适反应pH
3.3.4 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 pH稳定性
3.3.5 金属离子对粘质沙雷氏菌膜结合GADH活性的影响
3.3.6 变性剂和EDTA对粘质沙雷氏菌膜结合GADH活性的影响
3.3.7 有机酸对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.3.8 有机溶剂对粘质沙雷氏菌膜结合GADH活性的影响
3.3.9 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的底物特异性
3.3.10 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的酶促反应动力学参数
3.3.11 不同微生物来源的膜结合 GADH 的比较
3.4 本章小结
第四章 粘质沙雷氏菌膜结合GADH基因的克隆与生物信息学分析
4.1 实验材料
4.1.1 菌株和质粒
4.1.2 生化试剂与溶液
4.1.3 主要仪器与设备
4.2 实验方法
4.2.1 粘质沙雷氏菌基因组DNA的提取
4.2.2 PCR引物的设计与合成
4.2.3 目的基因片段的扩增与回收
4.2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备
4.2.5 重组质粒的构建
4.2.6 大肠杆菌JM109 感受态细胞的转化
4.2.7 重组质粒的验证
4.2.8 粘质沙雷氏菌gad操纵子的生物信息学分析
4.3 实验结果及分析
4.3.1 粘质沙雷氏菌gad操纵子的克隆
4.3.2 重组质粒的构建与验证
4.3.3 粘质沙雷氏菌gad操作子结构基因的组分分析
4.3.4 粘质沙雷氏菌gad操作子中各结构基因的生物信息学分析
4.4 本章小结
第五章 结论与展望
5.1 主要结论
5.2 存在问题与展望
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表的论文
【参考文献】:
期刊论文
[1]结核分枝杆菌耐药性相关膜蛋白MmpL6的表达与纯化[J]. 崔克乐,李静,孙安源. 安徽医科大学学报. 2018(01)
[2]Serratia sp. NDW3 GADH小亚基基因ga2dh的克隆及表达分析[J]. 杨美英,卢冬雪,孙合美,武志海,岳胜天,付丽. 华南农业大学学报. 2017(02)
[3]猪心中细胞色素C的提取与鉴定[J]. 高小娥. 南方农机. 2016(10)
[4]一株产2-酮基-D-葡萄糖酸菌的筛选鉴定及其发酵优化[J]. 牛盼清,杨爱华,杨松鑫,刘立明,陈坚. 过程工程学报. 2012(06)
[5]葡萄糖红外溴化钾压片影响因素研究[J]. 石向群,徐秀景,魏山青,张扬,方莉. 九江学院学报(自然科学版). 2011(03)
[6]碘量法测定发酵液中2-酮基-D-葡萄糖酸[J]. 冯晓燕,周延政,孙文敬,王大明,余泗莲,刘敬泽. 食品科学. 2010(24)
[7]2-酮基-D-葡萄糖酸发酵生产研究进展[J]. 魏转,余泗莲,孙文敬,周强,李中兵. 食品科学. 2008(08)
[8]粘质沙雷氏菌产2,3-丁二醇培养基的优化[J]. 李元芳,徐勤,曹学,王学东,沈亚领,魏东芝. 工业微生物. 2007(03)
[9]亲和层析技术在现代蛋白质研究中的应用及新发展[J]. 李洪利,黄倢,周丽. 海洋湖沼通报. 2005(03)
[10]基质辅助激光解吸飞行时间质谱在生物大分子中的应用[J]. 刘益华,徐俊福. 中国生化药物杂志. 2004(03)
硕士论文
[1]变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸激酶基因的克隆表达及其在葡萄糖代谢中的作用研究[D]. 何小用.江苏大学 2017
[2]变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸代谢调控蛋白PtxS的克隆表达、分离纯化及鉴定[D]. 张晓飞.江苏大学 2016
[3]2-酮基-D-葡萄糖酸产生菌膜结合葡萄糖脱氢酶的分离纯化及性质[D]. 薛庆.河北师范大学 2015
本文编号:3175058
【文章来源】:江苏大学江苏省
【文章页数】:95 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
英文缩略表
第一章 绪论
1.1 粘质沙雷氏菌的相关研究进展
1.1.1 粘质沙雷氏菌简介
1.1.2 粘质沙雷氏菌的葡萄糖代谢及其发酵工业中的应用
1.1.3 粘质沙雷氏菌的2KGA合成代谢
1.2 FAD依赖性膜结合葡萄糖酸脱氢酶相关研究进展
1.2.1 FAD依赖性膜结合GADH的来源与结构
1.2.2 FAD依赖性膜结合GADH的纯化
1.2.3 膜结合GADH的克隆表达
1.3 膜蛋白概述
1.3.1 膜蛋白的定义与分类
1.3.2 TritonX-114 两相分离膜蛋白
1.3.3 膜蛋白的纯化技术
1.4 立题背景及意义
1.5 研究的主要内容
第二章 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的分离纯化与初步鉴定
2.1 实验材料
2.1.1 菌株
2.1.2 实验材料与仪器设备
2.1.3 培养基
2.2 实验方法
2.2.1 粘质沙雷氏菌JUIM03 细胞生长曲线的测定
2.2.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的分离纯化
2.2.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的电泳检测
2.2.4 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的吸收光谱分析
2.2.5 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 MALDI-TOF-MS分析
2.2.6 粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化氧化D-葡萄糖酸所形成产物的分析
2.3 结果与讨论
2.3.1 粘质沙雷氏菌JUIM03 生长曲线的变化分析
2.3.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的分离纯化
2.3.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 SDS-PAGE分析
2.3.4 粘质沙雷氏菌膜结合膜结合GADH在可见光区的吸收光谱分析
2.3.5 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 MALDI-TOF-MS分析
2.3.6 粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化GA形成产物的鉴定
2.4 本章小结
第三章 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的酶学性质
3.1 实验材料和仪器
3.1.1 主要试剂和材料
3.1.2 主要仪器与设备
3.2 实验方法
3.2.1 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的制备及活性测定
3.2.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH最适反应温度的测定
3.2.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的热稳定性测定
3.2.4 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的最适反应pH及 pH稳定性测定
3.2.5 金属离子对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化反应活性的影响
3.2.6 变性剂和EDTA对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.2.7 有机酸对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.2.8 有机溶剂对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.2.9 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的底物特异性实验
3.2.10 粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化反应动力学常数的测定
3.3 结果与讨论
3.3.1 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的最适反应温度
3.3.2 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的热稳定性
3.3.3 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的最适反应pH
3.3.4 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的 pH稳定性
3.3.5 金属离子对粘质沙雷氏菌膜结合GADH活性的影响
3.3.6 变性剂和EDTA对粘质沙雷氏菌膜结合GADH活性的影响
3.3.7 有机酸对粘质沙雷氏菌膜结合GADH催化活性的影响
3.3.8 有机溶剂对粘质沙雷氏菌膜结合GADH活性的影响
3.3.9 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的底物特异性
3.3.10 粘质沙雷氏菌膜结合GADH的酶促反应动力学参数
3.3.11 不同微生物来源的膜结合 GADH 的比较
3.4 本章小结
第四章 粘质沙雷氏菌膜结合GADH基因的克隆与生物信息学分析
4.1 实验材料
4.1.1 菌株和质粒
4.1.2 生化试剂与溶液
4.1.3 主要仪器与设备
4.2 实验方法
4.2.1 粘质沙雷氏菌基因组DNA的提取
4.2.2 PCR引物的设计与合成
4.2.3 目的基因片段的扩增与回收
4.2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备
4.2.5 重组质粒的构建
4.2.6 大肠杆菌JM109 感受态细胞的转化
4.2.7 重组质粒的验证
4.2.8 粘质沙雷氏菌gad操纵子的生物信息学分析
4.3 实验结果及分析
4.3.1 粘质沙雷氏菌gad操纵子的克隆
4.3.2 重组质粒的构建与验证
4.3.3 粘质沙雷氏菌gad操作子结构基因的组分分析
4.3.4 粘质沙雷氏菌gad操作子中各结构基因的生物信息学分析
4.4 本章小结
第五章 结论与展望
5.1 主要结论
5.2 存在问题与展望
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间发表的论文
【参考文献】:
期刊论文
[1]结核分枝杆菌耐药性相关膜蛋白MmpL6的表达与纯化[J]. 崔克乐,李静,孙安源. 安徽医科大学学报. 2018(01)
[2]Serratia sp. NDW3 GADH小亚基基因ga2dh的克隆及表达分析[J]. 杨美英,卢冬雪,孙合美,武志海,岳胜天,付丽. 华南农业大学学报. 2017(02)
[3]猪心中细胞色素C的提取与鉴定[J]. 高小娥. 南方农机. 2016(10)
[4]一株产2-酮基-D-葡萄糖酸菌的筛选鉴定及其发酵优化[J]. 牛盼清,杨爱华,杨松鑫,刘立明,陈坚. 过程工程学报. 2012(06)
[5]葡萄糖红外溴化钾压片影响因素研究[J]. 石向群,徐秀景,魏山青,张扬,方莉. 九江学院学报(自然科学版). 2011(03)
[6]碘量法测定发酵液中2-酮基-D-葡萄糖酸[J]. 冯晓燕,周延政,孙文敬,王大明,余泗莲,刘敬泽. 食品科学. 2010(24)
[7]2-酮基-D-葡萄糖酸发酵生产研究进展[J]. 魏转,余泗莲,孙文敬,周强,李中兵. 食品科学. 2008(08)
[8]粘质沙雷氏菌产2,3-丁二醇培养基的优化[J]. 李元芳,徐勤,曹学,王学东,沈亚领,魏东芝. 工业微生物. 2007(03)
[9]亲和层析技术在现代蛋白质研究中的应用及新发展[J]. 李洪利,黄倢,周丽. 海洋湖沼通报. 2005(03)
[10]基质辅助激光解吸飞行时间质谱在生物大分子中的应用[J]. 刘益华,徐俊福. 中国生化药物杂志. 2004(03)
硕士论文
[1]变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸激酶基因的克隆表达及其在葡萄糖代谢中的作用研究[D]. 何小用.江苏大学 2017
[2]变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸代谢调控蛋白PtxS的克隆表达、分离纯化及鉴定[D]. 张晓飞.江苏大学 2016
[3]2-酮基-D-葡萄糖酸产生菌膜结合葡萄糖脱氢酶的分离纯化及性质[D]. 薛庆.河北师范大学 2015
本文编号:3175058
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3175058.html
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