矮鸢尾的亲缘地理学研究
发布时间：2021-05-15 12:22
第四纪冰期时,气候和环境的剧烈变化,对现今物种的分布格局产生了深远的影响。随着亲缘地理学的兴起和发展,为物种的谱系发育、冰期避难所等相关研究提供了更加便捷、高效的方法,对揭示现存物种的空间分布格局、群体遗传结构、多样性的形成机制等问题提供了新的手段,开启了崭新的研究领域。矮鸢尾（Iris kobayashii Kitagawa）是隶属于鸢尾科（Iridaceae）鸢尾属（Iris）的多年生草本植物,为我国特有物种,主要分布在松嫩草原、辽东半岛南端、山东半岛等地区。为了解第四纪气候波动对矮鸢尾种群进化历史的影响,本研究基于10个叶绿体DNA（cpDNA）片段和11个核微卫星（nSSR）位点,对采集于主要分布区的6个居群、65个矮鸢尾个体,开展了亲缘地理学研究,以期揭示矮鸢尾的亲缘地理模式、可能的遗传多样性中心,探究矮鸢尾的遗传多样性和种群遗传结构,进而揭示不同分布区矮鸢尾的起源。cpDNA遗传多样性分析和基于nSSR数据的分析表明,在区域水平上,大连南关岭地区的矮鸢尾居群具有最高的遗传多样性（NG:Hd=0.591,π=0.00086）,所拥有的单倍型最多（H3、H...
【文章来源】：东北师范大学吉林省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 第四纪冰期
1.1.1 第四纪冰期对生物分布的影响
1.2 冰期避难所
1.3 亲缘地理学
1.3.1 亲缘地理学简介
1.3.2 亲缘地理学的发展历史
1.3.3 概念模型
1.3.4 亲缘地理学的研究方法
1.4 矮鸢尾概况
1.4.1 矮鸢尾的生物学特征
1.4.2 相关研究进展
1.5 研究目的及意义
第二章 实验材料和方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.2.1 基因组DNA的提取
2.2.2 电泳检测基因组DNA
第三章 基于cp DNA基因的矮鸢尾亲缘地理学研究
3.1 cpDNA引物的筛选
3.1.1 筛选步骤
3.1.2 筛选结果
3.2 数据分析
3.2.1 数据比对和编辑
3.2.2 数据分析
3.3 结果与分析
3.3.1 遗传多样性分析
3.3.2 群体动态历史
3.3.3 遗传结构分析
3.3.3.1 SAMOVA分析
3.3.3.2 单倍型和亲缘地理关系分析
3.3.3.3 系统发育树的构建
第四章 基于nSSR标记的矮鸢尾亲缘地理学研究
4.1 矮鸢尾核微卫星引物的开发
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.2 数据分析
4.2.1 数据判读
4.2.2 数据分析
4.3 结果分析
4.3.1 遗传多样性分析
4.3.2 居群间的遗传结构分析
4.3.3 聚类分析
第五章 讨论
5.1 矮鸢尾的遗传多样性
5.2 矮鸢尾的遗传结构
5.3 冰期避难所
5.4 矮鸢尾的保护策略
第六章 结论与展望
6.1 结论
6.2 展望
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]鸢尾属观赏植物培养与园林造景利用探究[J]. 丁宪进,翁云峰. 现代园艺. 2017(04)
[2]滨海区黄花鸢尾的耐盐碱性及氮磷去除效果[J]. 陈广琳,陈友媛,孙萍,王翔宇,李胜玲,孙鹏鹏. 中国环境科学. 2015(11)
[3]基于SRAP的15种鸢尾的遗传多样性和亲缘关系分析[J]. 许玉凤,闫小风,邵美妮,关萍,陈旭辉,曲波. 沈阳农业大学学报. 2015(05)
[4]甘肃省鸢尾属植物资源及开发利用[J]. 张德祥. 特种经济动植物. 2015(03)
[5]青藏高原及其毗邻山区蒙古绣线菊谱系地理学研究[J]. 王久利,高庆波,付鹏程,GULZAR Khan,陈世龙,张发起. 西北植物学报. 2014(10)
[6]植物亲缘地理学的研究现状与发展趋势[J]. 白伟宁,张大勇. 生命科学. 2014(02)
[7]南方红豆杉谱系地理学研究[J]. 张雪梅,李德铢,高连明. 西北植物学报. 2012(10)
[8]中国大陆第四纪冰期潜在植物避难所研究进展[J]. 陈冬梅,康宏樟,刘春江. 植物研究. 2011(05)
[9]叶绿体基因组进化的速率和方式[J]. 唐萍,彭程. 生物学通报. 2010(06)
[10]SSR分子标记及其在植物遗传分析中的应用[J]. 谭月萍,黄建安,刘仲华,尹钟. 中国茶叶. 2009(03)
博士论文
[1]东北地区野生鸢尾属植物的分类与评价研究[D]. 郑洋.沈阳农业大学 2016
[2]东亚特有濒危植物黄山梅的亲缘地理学与群体遗传学研究[D]. 孙逸.浙江大学 2012
[3]基于cpDNA单倍型和SSR分析的银杏群体遗传结构和谱系地理学研究[D]. 闫小玲.浙江大学 2010
[4]马蔺繁殖生物学特性及遗传多样性研究[D]. 王育青.中国农业科学院 2010
[5]孑遗植物银杏的分子亲缘地理学研究[D]. 龚维.浙江大学 2007
硕士论文
[1]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒兰群体遗传结构及遗传多样性研究[D]. 江亚雯.南昌大学 2017
[2]基于叶绿体DNA的兴安杜鹃遗传结构与亲缘地理学研究[D]. 姜楠.东北师范大学 2016
[3]中国特有珍稀植物天目木姜子遗传多样性与亲缘地理学研究[D]. 孙林.南京大学 2014
[4]东亚针刺菝葜的系统发育学及亲缘地理学研究[D]. 马炜炜.浙江大学 2012
[5]基于多基因组的鸢尾属部分种的系统分类研究[D]. 仲轶.东北林业大学 2010
本文编号：3187624
【文章来源】：东北师范大学吉林省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 第四纪冰期
1.1.1 第四纪冰期对生物分布的影响
1.2 冰期避难所
1.3 亲缘地理学
1.3.1 亲缘地理学简介
1.3.2 亲缘地理学的发展历史
1.3.3 概念模型
1.3.4 亲缘地理学的研究方法
1.4 矮鸢尾概况
1.4.1 矮鸢尾的生物学特征
1.4.2 相关研究进展
1.5 研究目的及意义
第二章 实验材料和方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.2.1 基因组DNA的提取
2.2.2 电泳检测基因组DNA
第三章 基于cp DNA基因的矮鸢尾亲缘地理学研究
3.1 cpDNA引物的筛选
3.1.1 筛选步骤
3.1.2 筛选结果
3.2 数据分析
3.2.1 数据比对和编辑
3.2.2 数据分析
3.3 结果与分析
3.3.1 遗传多样性分析
3.3.2 群体动态历史
3.3.3 遗传结构分析
3.3.3.1 SAMOVA分析
3.3.3.2 单倍型和亲缘地理关系分析
3.3.3.3 系统发育树的构建
第四章 基于nSSR标记的矮鸢尾亲缘地理学研究
4.1 矮鸢尾核微卫星引物的开发
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.2 数据分析
4.2.1 数据判读
4.2.2 数据分析
4.3 结果分析
4.3.1 遗传多样性分析
4.3.2 居群间的遗传结构分析
4.3.3 聚类分析
第五章 讨论
5.1 矮鸢尾的遗传多样性
5.2 矮鸢尾的遗传结构
5.3 冰期避难所
5.4 矮鸢尾的保护策略
第六章 结论与展望
6.1 结论
6.2 展望
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]鸢尾属观赏植物培养与园林造景利用探究[J]. 丁宪进,翁云峰. 现代园艺. 2017(04)
[2]滨海区黄花鸢尾的耐盐碱性及氮磷去除效果[J]. 陈广琳,陈友媛,孙萍,王翔宇,李胜玲,孙鹏鹏. 中国环境科学. 2015(11)
[3]基于SRAP的15种鸢尾的遗传多样性和亲缘关系分析[J]. 许玉凤,闫小风,邵美妮,关萍,陈旭辉,曲波. 沈阳农业大学学报. 2015(05)
[4]甘肃省鸢尾属植物资源及开发利用[J]. 张德祥. 特种经济动植物. 2015(03)
[5]青藏高原及其毗邻山区蒙古绣线菊谱系地理学研究[J]. 王久利,高庆波,付鹏程,GULZAR Khan,陈世龙,张发起. 西北植物学报. 2014(10)
[6]植物亲缘地理学的研究现状与发展趋势[J]. 白伟宁,张大勇. 生命科学. 2014(02)
[7]南方红豆杉谱系地理学研究[J]. 张雪梅,李德铢,高连明. 西北植物学报. 2012(10)
[8]中国大陆第四纪冰期潜在植物避难所研究进展[J]. 陈冬梅,康宏樟,刘春江. 植物研究. 2011(05)
[9]叶绿体基因组进化的速率和方式[J]. 唐萍,彭程. 生物学通报. 2010(06)
[10]SSR分子标记及其在植物遗传分析中的应用[J]. 谭月萍,黄建安,刘仲华,尹钟. 中国茶叶. 2009(03)
博士论文
[1]东北地区野生鸢尾属植物的分类与评价研究[D]. 郑洋.沈阳农业大学 2016
[2]东亚特有濒危植物黄山梅的亲缘地理学与群体遗传学研究[D]. 孙逸.浙江大学 2012
[3]基于cpDNA单倍型和SSR分析的银杏群体遗传结构和谱系地理学研究[D]. 闫小玲.浙江大学 2010
[4]马蔺繁殖生物学特性及遗传多样性研究[D]. 王育青.中国农业科学院 2010
[5]孑遗植物银杏的分子亲缘地理学研究[D]. 龚维.浙江大学 2007
硕士论文
[1]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒兰群体遗传结构及遗传多样性研究[D]. 江亚雯.南昌大学 2017
[2]基于叶绿体DNA的兴安杜鹃遗传结构与亲缘地理学研究[D]. 姜楠.东北师范大学 2016
[3]中国特有珍稀植物天目木姜子遗传多样性与亲缘地理学研究[D]. 孙林.南京大学 2014
[4]东亚针刺菝葜的系统发育学及亲缘地理学研究[D]. 马炜炜.浙江大学 2012
[5]基于多基因组的鸢尾属部分种的系统分类研究[D]. 仲轶.东北林业大学 2010
本文编号：3187624
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3187624.html
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