花花柴抗逆相关转录因子WRKY的鉴定及分析

发布时间：2021-06-08 16:41

　　WRKY转录因子作为参与生物或非生物胁迫应答的重要基因家族,在植物逆境胁迫的响应过程中起着重要作用。花花柴作为沙漠植物,具有极强的广谱抗逆性,发掘并应用花花柴的抗逆基因资源对研究植物逆境生物学及抗逆性分子育种具有重要意义。本研究通过对沙漠植物花花柴的转录组学分析,筛选出与高温胁迫相关的15个差异表达的WRKY基因。并将这15个基因与拟南芥、水稻的WRKY基因构建系统发育树,通过对同亚族同源性较高的基因功能及其顺式作用元件的功能预测,推测花花柴WRKY基因可能参与了极端温度、干旱、高盐、病原菌等逆境胁迫响应,并对与高温胁迫响应相关的2个花花柴WRKY基因进行表达模式分析。该结果将为荒漠植物及其基因资源的发掘利用提供一定的参考价值。 

【文章来源】：塔里木大学学报. 2020,32(01)

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

花花柴与拟南芥、水稻WRKY基因系统发育树

从15个差异表达的WRKY基因中筛选两个表达趋势相反的基因：CL4493.Contig1＿All、CL4998.Contig1＿All进行表达模式分析。由图4可以看出基因CL4493.Contig1＿All在未处理时有较少量的表达，高温处理2 h后表达量降低，在处理4 h后表达量明显升高，在处理8 h后表达量较4 h低，但较未处理时高，在处理12 h后表达量在整个处理时间中最高。基因CL4998.Contig1＿All在处理4 h前表达量均较低，在处理4 h后表达量增加，但是在8 h后表达量降低，在处理12 h后表达量增加在整个处理过程中达到最高。3 讨论

通过MEME软件比对分析（如图2），发现15个WRKY蛋白均含有WRKY家族绝对保守的氨基酸残基WRKYGQK，有时也可采用WRKYGKK的形式[9]，该结构是WRKY结构域中的核心序列。除WRKYGQK(WRKYGKK）序列具有高保守性，在第5位的D（天冬氨酸Asp）、第24位的R（精氨酸Arg）、第26位的Y（酪氨酸Tyr）、第29位的C（半胱氨酸）同样具有高保守性。图2 花花柴WRKY家族保守结构域序列比对

【参考文献】：
期刊论文
[1]低温胁迫下油棕WRKY转录因子基因的表达特性分析[J]. 周丽霞,曹红星.  南方农业学报. 2018(08)
[2]盐胁迫下陆地棉耐盐相关WRKY基因的表达分析[J]. 蔡继鸿,徐鹏,张香桂,郭琪,徐珍珍,沈新莲.  江苏农业科学. 2018(18)
[3]盐胁迫应答基因GmWRKY6的克隆及转基因百脉根的抗盐分析[J]. 柯丹霞,彭昆鹏,夏远君,朱玉莹,张丹丹.  草业学报. 2018(08)
[4]AtWRKY40参与拟南芥干旱胁迫响应过程[J]. 车永梅,孙艳君,卢松冲,赵方贵,侯丽霞,刘新.  植物生理学报. 2018(03)
[5]干旱、高盐及低温胁迫下植物生理及转录因子的应答调控[J]. 王冰,程宪国.  植物营养与肥料学报. 2017(06)
[6]沙漠植物花花柴幼苗对高温耐受性评价[J]. 王彦芹,石新建,李志军.  生物技术通报. 2017(04)
[7]柑橘4个WRKY转录因子基因的克隆及其响应柑橘溃疡病菌侵染的表达分析[J]. 周鹏飞,贾瑞瑞,陈善春,许兰珍,彭爱红,雷天刚,李强,陈敏,白晓晶,邹修平,何永睿.  园艺学报. 2017(03)
[8]棉花逆境应答GhWRKY2基因的结构与功能预测[J]. 司爱君,余渝,陈红,田琴.  农业生物技术学报. 2017(02)
[9]WRKY转录因子家族调控植物逆境胁迫响应[J]. 孙淑豪,余迪求.  生物技术通报. 2016(10)
[10]水稻OsWRKY7基因的表达研究[J]. 李茹,周洁,李冬月,王栩鸣,杨勇,余初浪,程晔,严成其,陈剑平.  中国水稻科学. 2015(06)



本文编号：3218803