花椰菜转录因子ERF056的克

发布时间：2024-07-11 04:47

　　AP2/ERF转录因子在植物中广泛存在,其在植物生长发育及逆境应答过程中均发挥重要作用。但目前对花椰菜中AP2/ERF转录因子及其功能知之甚少。本研究利用前期花椰菜转录组数据,采用RT-PCR等方法从花椰菜中分离并克隆得到一个AP2/ERF转录因子:ERF056。基因序列及分子特征分析结果表明,花椰菜ERF056全长741 bp,编码246个氨基酸,具有一个AP2/ERF结构域,其编码产物为疏水性蛋白,无跨膜结构,内部以无规则卷曲和α-螺旋为主。聚类分析结果显示,花椰菜ERF056与油菜和甘蓝中相应转录因子具有较高相似性。转录表达谱分析结果显示,ERF056在花椰菜不同组织中均有表达,其中花球中表达量最高。盐胁迫表达特征分析表明,花椰菜ERF056在盐胁迫条件下呈下调表达,暗示其负向响应盐胁迫。相关研究为深入揭示花椰菜ERF056在盐胁迫应答中的功能及调控机制提供了帮助。

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【部分图文】：

图1花椰菜ERF056基因全长编码序列的PCR扩增

在NCBI的CDD数据库中对ERF056转录因子进行保守结构域预测，ERF056转录因子具有一个AP2/ERF保守结构域，该结果进一步证实花椰菜ERF056属于ERF亚家族(图2A)。使用在线分析软件ProtParam，对花椰菜ERF056进行一级结构预测，结果显示，花椰菜ERF....

图2花椰菜ERF056氨基酸序列分子特征分析

图1花椰菜ERF056基因全长编码序列的PCR扩增1.3花椰菜ERF056转录因子系统进化分析

图4不同物种ERF056转录因子motifs分析

目前已有多篇关于ERF在盐胁迫下的表达模式分析研究。研究表明：油菜BnaERF-B3-hyl5受盐、干旱、低温诱导表达，转BnaERF-B3-hyl5拟南芥抗冷冻能力提高(姜海华等,2010)；花生AhERF6在低温、干旱、高盐胁迫下均受到明显诱导，过表达AhERF6提高耐低温和....

图5不同物种ERF056转录因子系统进化分析

图4不同物种ERF056转录因子motifs分析3材料与方法

本文编号：4005272