基于蝙蝠算法的蛋白质网络功能模块检测方法研究

发布时间：2021-07-15 19:39

　　蛋白质相互作用网络（Protein-Protein Interaction Network,PPIN）是由一个生命有机体内所有蛋白质之间的相互作用组成的,具备高度复杂网络的特性。检测PPIN中的功能模块是蛋白质组学研究中的一个重要问题,不仅对揭示蛋白质功能、了解生物系统的组织结构有重大意义,而且为疾病的预知、未来药物标靶的发现提供理论依据。为了准确地识别PPIN功能模块,大量计算方法迅速兴起。其中,运用群集智能思想来检测功能模块已成为该领域的一个研究热点。本课题探索了一种新颖的群集智能算法——蝙蝠算法针对PPIN功能模块检测问题进行研究,并开展了以下两个方面的工作:（1）蝙蝠算法是一种全局搜索能力较强的群集智能算法,本课题提出了基于蝙蝠算法的蛋白质网络功能模块检测（BA-FMD）方法,以期在该领域取得不错的效果。首先,该方法结合PPIN中节点之间的拓扑信息和功能信息作为它们的相似性度量,利用相似性度量在搜索空间中随机初始化蝙蝠种群,每只蝙蝠所处位置代表一个候选功能模块划分;然后在种群优化阶段,设计了定向局部扰动、随机扰动、基于距离和频率的自适应变异、自然选择四种寻优机制来进行解的随机优... 

【文章来源】：北京工业大学北京市 211工程院校

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

酵母菌PPIN示意图

PPIN 数据库部分示例artial example of PPIN dat据库有以下几种：avin等人使用亲和纯了当时最大的以物理类复合体的个数，为n Protein）数据库[42记录实验确定的 PP完整的工具。该数据了工具，允许用户分的实验数据。n center for Protein之一，由慕尼黑蛋白

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3286335