MORC基因家族的鉴定及其在绿色植物中的进化研究

发布时间：2021-07-21 21:14

　　MORC（Microrchidia）基因是一类高度保守的核蛋白编码基因,它作为一种新型的表观调控因子,参与了植物转录水平的基因沉默和免疫防御调控过程。通常,MORC蛋白的N端含有一个保守的GHKL-type（Gyrase，Hsp90，Histidine kinase，MutL）ATPase模块,它能够影响基因的表达调控过程。目前,MORC蛋白在动物和植物中均已鉴定出,其中在人类和拟南芥中分别鉴定出了4个和7个典型的MORC家族成员。为了深入探究MORC基因家族的系统演化过程,本研究利用生物信息学和系统发生学等手段对动植物中MORC基因家族的进化历史、分类关系和MORC蛋白的序列特征等进行了全面的研究。本研究从27和60个代表性动物和植物的基因组中分别鉴定出了83和356个MORC蛋白的候选基因。同时,基于转录组的蛋白序列信息,还从56个非开花植物中鉴定出了154个候选MORC蛋白序列。对这些MORC蛋白序列进行保守motif的分析发现,MORC蛋白的N端含有一段连续的保守motif组成,将其定义为MORC结构域。MORC结构域的序列保守,含有一些典型的蛋白序列二级结构元件,可以作为MO... 

【文章来源】：福建农林大学福建省

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

部分物种中M之刀之C基因的系统发育树和保守切

图３－４?ＭＯＲＣ?

过大片段复制或全基因组复制的方式产生拷贝数的加倍，可以看出相对于近期发??生的复制事件，那些发生在较为古老的Ｙ事件中的物种之间的共线性关系则显得??相对较差（见图３－７），表明它们在长期的进化过程中发生了一定的分化。同时，??在单子叶植物Ｇｒｏｕｐ?ＩＩ－ｃ分支中基因大多都有两个及以上拷贝，表明??基因在单子叶植物中也发生了一定的扩增，甚至可能经历了一次禾本科近??期发生的全基因组复制ｐ事件。??２４??


本文编号：3295789