3种鼩鼱线粒体基因组分析及鼩鼱属分类探讨
发布时间：2021-08-03 21:26
食虫目（Insectivora）鼩鼱科（Soricidae）物种是现今为止人们发现的最小的一类哺乳动物,广泛分布于亚、非、欧及南北美洲。现分为鼩鼱亚科（Soricinae）和麝鼩亚科（Crocidurinae）两类。鼩鼱属（Sorex）隶属于鼩鼱亚科。该类动物体型小且隐蔽性强,因此较难捕获,迄今国内相关文献资料相对较少。随着分子生物学的发展,越来越多的学者开始将传统的形态学和系统发育学技术整合在一起并实际应用于物种鉴别,极大程度地加强了对鼩鼱科的分类学研究,并且在鼩鼱科发现新物种和重新描述等研究方面也受到了热烈的关注。然而,由于缺乏线粒体基因组数据,鼩鼱属的亲缘关系和物种分类状况无法在线粒体基因组水平上进行探索。基于2013年至今积累的鼩鼱科标本为基础,本文对扁颅鼩鼱（S.roboratus）、远东鼩鼱（S.isodon）及中鼩鼱（S.caecutiens）以传统形态学和系统发育学相结合,互相印证从而完成物种鉴定。即先利用标本外部形态与头骨特征的对比、描述与测量进行形态学物种鉴定,再利用mt DNA中Cytb单基因完成系统发育树重建,通过计算样本间的遗传距离进行分子生物学物种鉴定,最终...
【文章来源】：牡丹江师范学院黑龙江省
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线图
牡丹江师范学院硕士学位-16-图3-1鼩鼱属3个物种头骨图（a:上颌背面；b:上颌腹面;C:下颌齿侧面;d:上颌齿侧面)Fig.3-1Skullof3typesSorexspecies(a:Dorsalviewofthemaxilla;b:Ventralviewofthemaxilla;c:Lateralaspectoftoothofthemandible;d:Lateralaspectoftoothofthemaxilla)表3-23种鼩鼱形态学指标测量数据Table.3-2Morphologicalindexmeasurementdataof3typesSorex扁颅鼩鼱S.roboratus远东鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens体重BW（g）10.237.824.49头体长HB（mm）62.4959.8051.33尾长TL（mm）35.9042.6536.38尾长/头体长TL/HB0.570.710.71后足长HF（mm）11.6612.4410.73耳长EL（mm）3.442.452.35颅全长GLS（mm）20.7719.5518.21颅基长CIL（mm）17.7718.1217.41基长BL（mm）16.5416.8815.40脑颅宽CB（mm）9.709.618.86脑颅高BH（mm）5.955.885.61眶间宽IOB（mm）2.792.932.61上齿列长UTRL（mm）8.678.107.21下齿列长LTRL（mm）7.597.936.78腭前部宽FWP（mm）2.622.322.05腭后部宽HWP（mm）3.193.122.86扁颅鼩鼱S.roboratus远东鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens
第三章结果与分析-17-结合近缘物种和东北亚地区分布的其它物种，根据表2-3中的序列以ML法和NJ法分别构建系统发生树并计算样本间的遗传距离。结果显示：同种鼩鼱的遗传距离为0.00-0.04，鼩鼱属物种间的遗传距离为0.1-0.14，鼩鼱属所有物种与大麝鼩的遗传距离为0.21-0.25（表3-3）；相同物种的序列都聚在一个小的分支上，并且表现出种内与种间明显的系统分化（图3-2，图3-3）。物种的聚类分析结果与形态学分类一致，进一步证明了物种的形态学鉴定结果。图3-2基于Cytb基因构建的3种鼩鼱ML系统发育树Fig.3-2Phylogenetictreeof3typesSorexinferredfromMLbasedontheCytbgene
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于Cyt b基因全序列鼩鼱属分子系统学分析——我国东北地区鼩鼱属物种的系统发生地位[J]. 张隽晟,刘铸,董明,杜建宇,杨茜,金志民. 野生动物学报. 2019(01)
[2]中国东北地区鼩鼱科动物分类与分布[J]. 刘铸,张隽晟,白薇,刘欢,解瑞雪,杨茜,金志民. 兽类学报. 2019(01)
[3]我国东北地区发现姬鼩鼱分布[J]. 刘铸,张隽晟,孙悦欣,杨茜,金志民. 动物学杂志. 2017(03)
[4]扁颅鼩鼱（Sorex roboratus）在中国分布的证实[J]. 刘铸,杨茜,解瑞雪,刘欢,金志民,张新鹏. 兽类学报. 2016(04)
[5]黑龙江省横道河子地区发现细鼩鼱（食虫目:鼩鼱科）[J]. 刘铸,解瑞雪,刘欢,金志民. 动物学杂志. 2016(03)
[6]隐种及其在两栖动物中的研究进展[J]. 黄华,郑荣泉,张加勇,陈雯,于晓云,陈平. 生命科学. 2012(05)
[7]鸟类分子系统地理学研究进展[J]. 董路,张雁云. 生态学报. 2011(14)
[8]苔原鼩鼱（Sorex tundrensis）在中国分布的首次证实[J]. 刘洋,王昊,刘少英. 兽类学报. 2010(04)
[9]动物线粒体基因与进化研究进展[J]. 刘银梅. 山西农业科学. 2007(01)
[10]线粒体基因组全序列研究与动物分子系统发生的关系[J]. 李耀东,邵嘉会. 青海医学院学报. 2006(01)
硕士论文
[1]鸫属九种鸟线粒体基因组全序列比较及系统发生关系[D]. 江波.兰州大学 2018
[2]仓鼠属物种线粒体基因组特征及系统发生[D]. 丁励.兰州大学 2017
本文编号：3320364
【文章来源】：牡丹江师范学院黑龙江省
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线图
牡丹江师范学院硕士学位-16-图3-1鼩鼱属3个物种头骨图（a:上颌背面；b:上颌腹面;C:下颌齿侧面;d:上颌齿侧面)Fig.3-1Skullof3typesSorexspecies(a:Dorsalviewofthemaxilla;b:Ventralviewofthemaxilla;c:Lateralaspectoftoothofthemandible;d:Lateralaspectoftoothofthemaxilla)表3-23种鼩鼱形态学指标测量数据Table.3-2Morphologicalindexmeasurementdataof3typesSorex扁颅鼩鼱S.roboratus远东鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens体重BW（g）10.237.824.49头体长HB（mm）62.4959.8051.33尾长TL（mm）35.9042.6536.38尾长/头体长TL/HB0.570.710.71后足长HF（mm）11.6612.4410.73耳长EL（mm）3.442.452.35颅全长GLS（mm）20.7719.5518.21颅基长CIL（mm）17.7718.1217.41基长BL（mm）16.5416.8815.40脑颅宽CB（mm）9.709.618.86脑颅高BH（mm）5.955.885.61眶间宽IOB（mm）2.792.932.61上齿列长UTRL（mm）8.678.107.21下齿列长LTRL（mm）7.597.936.78腭前部宽FWP（mm）2.622.322.05腭后部宽HWP（mm）3.193.122.86扁颅鼩鼱S.roboratus远东鼩鼱S.isodon中鼩鼱S.caecutiens
第三章结果与分析-17-结合近缘物种和东北亚地区分布的其它物种，根据表2-3中的序列以ML法和NJ法分别构建系统发生树并计算样本间的遗传距离。结果显示：同种鼩鼱的遗传距离为0.00-0.04，鼩鼱属物种间的遗传距离为0.1-0.14，鼩鼱属所有物种与大麝鼩的遗传距离为0.21-0.25（表3-3）；相同物种的序列都聚在一个小的分支上，并且表现出种内与种间明显的系统分化（图3-2，图3-3）。物种的聚类分析结果与形态学分类一致，进一步证明了物种的形态学鉴定结果。图3-2基于Cytb基因构建的3种鼩鼱ML系统发育树Fig.3-2Phylogenetictreeof3typesSorexinferredfromMLbasedontheCytbgene
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于Cyt b基因全序列鼩鼱属分子系统学分析——我国东北地区鼩鼱属物种的系统发生地位[J]. 张隽晟,刘铸,董明,杜建宇,杨茜,金志民. 野生动物学报. 2019(01)
[2]中国东北地区鼩鼱科动物分类与分布[J]. 刘铸,张隽晟,白薇,刘欢,解瑞雪,杨茜,金志民. 兽类学报. 2019(01)
[3]我国东北地区发现姬鼩鼱分布[J]. 刘铸,张隽晟,孙悦欣,杨茜,金志民. 动物学杂志. 2017(03)
[4]扁颅鼩鼱（Sorex roboratus）在中国分布的证实[J]. 刘铸,杨茜,解瑞雪,刘欢,金志民,张新鹏. 兽类学报. 2016(04)
[5]黑龙江省横道河子地区发现细鼩鼱（食虫目:鼩鼱科）[J]. 刘铸,解瑞雪,刘欢,金志民. 动物学杂志. 2016(03)
[6]隐种及其在两栖动物中的研究进展[J]. 黄华,郑荣泉,张加勇,陈雯,于晓云,陈平. 生命科学. 2012(05)
[7]鸟类分子系统地理学研究进展[J]. 董路,张雁云. 生态学报. 2011(14)
[8]苔原鼩鼱（Sorex tundrensis）在中国分布的首次证实[J]. 刘洋,王昊,刘少英. 兽类学报. 2010(04)
[9]动物线粒体基因与进化研究进展[J]. 刘银梅. 山西农业科学. 2007(01)
[10]线粒体基因组全序列研究与动物分子系统发生的关系[J]. 李耀东,邵嘉会. 青海医学院学报. 2006(01)
硕士论文
[1]鸫属九种鸟线粒体基因组全序列比较及系统发生关系[D]. 江波.兰州大学 2018
[2]仓鼠属物种线粒体基因组特征及系统发生[D]. 丁励.兰州大学 2017
本文编号：3320364
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3320364.html
