2018-2019年广西IBV分离株S1基因序列分析及4株代表性IBV变异株的免疫原性研究
发布时间：2021-08-05 12:38
鸡传染性支气管炎（infectious bronchitis,IB）是由鸡传染性支气管炎病毒（infectious bronchitis virus,IBV）引起的一种急性、高度接触性呼吸道传染病。IBV基因组极易发生变异,导致基因型、血清型、致病性和免疫原性多样化,不同基因型或血清型的毒株之间交叉保护效果不理想,生产上免疫失败时有发生,给养禽业带来较大经济损失。因此,及时了解掌握本地区IBV流行毒株的变异情况并筛选出具有良好免疫原性的毒株作为地方疫苗候选株,对IB防控具有很重要的现实意义。之前课题组完成了至2017年的广西IBV分离株的分子流行病学调查,以及对4株广西代表性IBV变异株致病性进行了研究,本研究在此基础上,继续对2018-2019年的广西IBV分离株进行跟踪研究,同时对此4株广西代表性IBV变异株的免疫原性进行研究,具体如下。一、2018-2019年广西IBV分离株S1基因序列分析应用鸡胚接种和RT-PCR技术对2018-2019年间广西疑似病鸡进行IBV的分离鉴定,并对分离株的S1基因进行扩增、测序以及相似性、进化树、重组、高变区、糖基化位点和S蛋白裂解位点分析。结果...
【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
9株IBV的二重RT-PCR电泳结果
.GX-BH180523;4.GX-LZ180820;5.GX-QZ181028;6.GX-NN180426;7.GX-GL181207;8.GX-YL190220;9.GX-NN190716;10.GX-QZ190726;11.GX-QZ190803;12.GX-NN190810;13.GX-GG190815;14.GX-GG190819;15.GX-NN190923;16.GX-NN191006;17.GX-YL191120;18.GX-YL191121;19.GX-NN191213;20.GX-NN191219;21.Negativecontrol2.3.2各分离株序列测定结果对19株IBV的S1基因进行RT-PCR扩增，均得到S1基因的特异性目的条带，扩增结果如图2-2所示。对所有IBV的S1基因进行序列测定，结果表明19株IBV的S1基因ORF为1611-1629bp，编码537-543个氨基酸。图2-219株IBV的SI基因RT-PCR结果注：M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.阴性对照Figure2-2ResultsofRT-PCRofSIgenein19IBVstrainsNote:M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.
广西大学兽医硕士学位论文2018-2019年广西IBV分离株S1基因序列分析及四株代表性IBV变异株的免疫原性研究16GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.Negativecontrol2.3.3相似性分析结果各毒株之间S1基因核苷酸序列相似性在66.2%-99.9%之间，推导氨基酸序列相似性在59.4%-99.8%之间。其中，GX-NN190923和GX-NN191006的核苷酸相似性为99.9%，氨基酸相似性为99.8%；19株IBV的S1基因序列与疫苗株4/91、H120、QX87、LDT3-A、LX4的核苷酸相似性分别为65.9%-78.9%、65.6%-83.2%、67.7%-96.0%、66.2%-99.1%、78.0%-99.1%（图2-3和图2-4）。图2-319株分离株与参考株核苷酸序列相似性分析结果Figure2-3Resultsofnucleotidesequencesimilarityanalysisbetween19isolatesandreferencestrains
【参考文献】：
期刊论文
[1]禽传染性支气管炎病毒江西分离株JX/WTF09全基因序列分析[J]. 先国兰,张连英,郭丽娜,刘启亮. 中国临床药理学杂志. 2020(04)
[2]河南省肉鸡4株禽传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析[J]. 李宛玉,许鑫,胡雯,吴永艳,阚云超,姚伦广,王新卫,冀君. 畜牧与兽医. 2020(01)
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[4]鸡传染性支气管炎综合防治[J]. 侯凤鸣. 畜牧兽医科学(电子版). 2019(23)
[5]2009-2017年广西地区鸡传染性支气管炎流行病学调查[J]. 董志华,范文胜,赵长润,张文,陈基明,韦天超,磨美兰,韦平. 中国兽医学报. 2019(09)
[6]2016～2017年广西鸡传染性支气管炎病毒S1基因进化分析[J]. 陈彤,刘金,封柯宇,王占新,鲁俊鹏,覃健萍,蔺文成,谢青梅. 中国家禽. 2019(12)
[7]当前优质鸡产业面临的挑战与发展机遇——论优质鸡产业发展九大议题[J]. 韦平. 中国家禽. 2019(11)
[8]应对日益严峻的挑战:中国禽传染性支气管炎研究[J]. 黄梦姣,张芸,薛春宜,曹永长. 微生物学通报. 2019(07)
[9]鸡传染性支气管炎病毒LN株基因组序列测定与致病性分析[J]. 阿依古丽·艾班,程晋龙,刘晓宇,张国中. 中国兽医杂志. 2018(12)
[10]鸡传染性支气管炎疫苗株与广西流行野毒株鉴别方法的建立[J]. 范文胜,王海勇,唐宁,董志华,韦天超,磨美兰,韦平. 动物医学进展. 2018(05)
博士论文
[1]鸡传染性支气管炎病毒山东株分离鉴定及其灭活疫苗制备与评价[D]. 苗立中.吉林大学 2018
[2]鸡传染性支气管炎病毒LX4株主要结构基因的研究[D]. 贺秀媛.西北农林科技大学 2002
[3]鸡传染性支气管炎病毒JS/95/03和SD/97/01株S1糖蛋白在昆虫细胞中的表达及其免疫原性评价[D]. 戴亚斌.南京农业大学 2001
硕士论文
[1]四株广西代表性IBV变异株的全基因组序列测定和生物信息学分析及致病性研究[D]. 董志华.广西大学 2019
[2]2015-2017年广西鸡传染性支气管炎病毒分离株结构基因序列分析与血清型鉴定[D]. 唐宁.广西大学 2018
[3]表达LX4型IBV流行毒株S1蛋白的重组新城疫病毒LaSota株的构建及免疫效力评价[D]. 赵冉.甘肃农业大学 2017
[4]三种常用IBV商品弱毒疫苗对广西主要流行毒株免疫保护作用的比较研究[D]. 李和鸣.广西大学 2016
[5]2012～2013年IBV广西分离株的基因序列分析和血清学鉴定[D]. 吴翠兰.广西大学 2015
[6]中国部分Massachusetts型鸡传染性支气管炎病毒的生物学特性[D]. 陈玲凤.中国农业科学院 2014
[7]鸡传染性支气管炎病毒广西分离株血清型的鉴定及免疫原性的研究[D]. 孙蓉.广西大学 2012
[8]鸡传染性支气管炎病毒基因型与血清型相关性初步研究[D]. 汪洋.中国兽医药品监察所 2011
[9]2006年—2010年山东省鸡传染性支气管炎病毒分离株基因型和血清型分析[D]. 任海松.山东农业大学 2011
本文编号：3323765
【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
9株IBV的二重RT-PCR电泳结果
.GX-BH180523;4.GX-LZ180820;5.GX-QZ181028;6.GX-NN180426;7.GX-GL181207;8.GX-YL190220;9.GX-NN190716;10.GX-QZ190726;11.GX-QZ190803;12.GX-NN190810;13.GX-GG190815;14.GX-GG190819;15.GX-NN190923;16.GX-NN191006;17.GX-YL191120;18.GX-YL191121;19.GX-NN191213;20.GX-NN191219;21.Negativecontrol2.3.2各分离株序列测定结果对19株IBV的S1基因进行RT-PCR扩增，均得到S1基因的特异性目的条带，扩增结果如图2-2所示。对所有IBV的S1基因进行序列测定，结果表明19株IBV的S1基因ORF为1611-1629bp，编码537-543个氨基酸。图2-219株IBV的SI基因RT-PCR结果注：M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.阴性对照Figure2-2ResultsofRT-PCRofSIgenein19IBVstrainsNote:M.DL2000PlusDNAMarker;1.GX-BH180202;2.GX-BH180523;3.
广西大学兽医硕士学位论文2018-2019年广西IBV分离株S1基因序列分析及四株代表性IBV变异株的免疫原性研究16GX-LZ180820;4.GX-QZ181028;5.GX-NN180426;6.GX-GL181207;7.GX-YL190220;8.GX-NN190716;9.GX-QZ190726;10.GX-QZ190803;11.GX-NN190810;12.GX-GG190815;13.GX-GG190819;14GX-NN190923;15.GX-NN191006;16.GX-YL191120;17.GX-YL191121;18.GX-NN191213;19.GX-NN191219;20.Negativecontrol2.3.3相似性分析结果各毒株之间S1基因核苷酸序列相似性在66.2%-99.9%之间，推导氨基酸序列相似性在59.4%-99.8%之间。其中，GX-NN190923和GX-NN191006的核苷酸相似性为99.9%，氨基酸相似性为99.8%；19株IBV的S1基因序列与疫苗株4/91、H120、QX87、LDT3-A、LX4的核苷酸相似性分别为65.9%-78.9%、65.6%-83.2%、67.7%-96.0%、66.2%-99.1%、78.0%-99.1%（图2-3和图2-4）。图2-319株分离株与参考株核苷酸序列相似性分析结果Figure2-3Resultsofnucleotidesequencesimilarityanalysisbetween19isolatesandreferencestrains
【参考文献】：
期刊论文
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[8]应对日益严峻的挑战:中国禽传染性支气管炎研究[J]. 黄梦姣,张芸,薛春宜,曹永长. 微生物学通报. 2019(07)
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[10]鸡传染性支气管炎疫苗株与广西流行野毒株鉴别方法的建立[J]. 范文胜,王海勇,唐宁,董志华,韦天超,磨美兰,韦平. 动物医学进展. 2018(05)
博士论文
[1]鸡传染性支气管炎病毒山东株分离鉴定及其灭活疫苗制备与评价[D]. 苗立中.吉林大学 2018
[2]鸡传染性支气管炎病毒LX4株主要结构基因的研究[D]. 贺秀媛.西北农林科技大学 2002
[3]鸡传染性支气管炎病毒JS/95/03和SD/97/01株S1糖蛋白在昆虫细胞中的表达及其免疫原性评价[D]. 戴亚斌.南京农业大学 2001
硕士论文
[1]四株广西代表性IBV变异株的全基因组序列测定和生物信息学分析及致病性研究[D]. 董志华.广西大学 2019
[2]2015-2017年广西鸡传染性支气管炎病毒分离株结构基因序列分析与血清型鉴定[D]. 唐宁.广西大学 2018
[3]表达LX4型IBV流行毒株S1蛋白的重组新城疫病毒LaSota株的构建及免疫效力评价[D]. 赵冉.甘肃农业大学 2017
[4]三种常用IBV商品弱毒疫苗对广西主要流行毒株免疫保护作用的比较研究[D]. 李和鸣.广西大学 2016
[5]2012～2013年IBV广西分离株的基因序列分析和血清学鉴定[D]. 吴翠兰.广西大学 2015
[6]中国部分Massachusetts型鸡传染性支气管炎病毒的生物学特性[D]. 陈玲凤.中国农业科学院 2014
[7]鸡传染性支气管炎病毒广西分离株血清型的鉴定及免疫原性的研究[D]. 孙蓉.广西大学 2012
[8]鸡传染性支气管炎病毒基因型与血清型相关性初步研究[D]. 汪洋.中国兽医药品监察所 2011
[9]2006年—2010年山东省鸡传染性支气管炎病毒分离株基因型和血清型分析[D]. 任海松.山东农业大学 2011
本文编号：3323765
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