从序列和基因功能网络水平研究植物印记基因

发布时间：2021-09-15 13:39

　　印记基因是一类受表观遗传调控并呈现出亲本来源特异性表达的基因。基因印记现象广泛存在于哺乳动物的胎盘组织以及高等植物的胚乳中,对动植物的正常生长、发育起着重要的调控作用。印记基因异常的等位基因表达不仅与人类的某些疾病息息相关,而且对于植物种子大小、淀粉含量的积累等具有重要影响。目前研究者通过高通量测序的手段已经在人类、小鼠以及不同高等植物中鉴定出数十个到数百个不等的印记基因。然而,除了少数印记基因的功能被实验证实外,绝大多数的印记基因,尤其是在植物中,其功能仍不清楚;另外,印记基因之间的功能关系也不得而知;更为重要的是,印记基因与非印记基因在序列特征、功能网络等方面的差异以及在进化过程中驱动印记基因的产生和丢失等原因仍没有被详细地报道过。因此,在序列水平以及基因功能网络水平通过对植物印记基因进行分析,可以为揭示基因印记的特点和基因印记机理等方面提供理论依据。本文以八种被子植物全基因组范围内鉴定到的印记基因为研究对象,通过生物信息学手段在序列水平,如序列长度、CpG岛、串联重复元件等方面进行了分析,比较了印记基因和非印记基因在序列特征方面的不同;对植物印记基因的跨物种保守情况进行了分析,探... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：124 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

基因印记示意图

第一章 文献综述E1。其中拟南芥的四个 PRC2 复合物的组分 MEA，央细胞中，在双受精前起到抑制中央细胞增殖的功A 和 FIS2 的母本和父本等位基因均受到 MET1 的 在中央细胞中表达并激活了 FWA 和 FIS2，这种母到甲基化抑制表达的现象一直持续到胚乳中，导致的，MEA 的母本等位基因由于 DME 发生去甲基化受 MET1 以及 H3K27me3 的甲基化抑制表达。受精2 复合物的形成，并通过 H3K27me3 抑制了 MEA 本等位基因的表达 (Huh et al., 2007)（图 1-2）。

第一章 文献综述基因的起源和假说记基因的起源和进化，在植物和动物中已鉴定出数百个印记基因 (Gehring, 2013; Morisonissig et al., 2011)，但关于印记基因的具体起源时间和进化模式备受争议因印记现象在高等植物和哺乳动物中独立起源，但有着趋同进化的Berger, 2007; Pires and Grossniklaus, 2014) （图 1-3）。在动物中，基因在于真兽亚纲和有袋类动物中，而在单孔目和非哺乳类动物（如鸟类nfree et al., 2009)。在植物中，基因印记则存在于单子叶和双子叶的胚中（少数）(Pires and Grossniklaus, 2014)，而在非开花植物如裸子植物不存在，暗示印记基因的产生是伴随着植物胚乳的产生而进化出来的


本文编号：3396180