细胞分化的DNA复制时序和染色质三维结构的动态调控
发布时间：2021-09-18 14:41
真核生物细胞周期是一个复杂而又高度有序的过程。包括细胞的生长、遗传物质的复制,以及将复制产生的染色体分离到其子细胞等过程。DNA复制是该过程的核心事件。细胞分化是单一细胞系经过复杂生命活动产生一系列结构功能有明显差异细胞系的过程。在分化过程中基因的选择性表达需要特异性的转录程序,而DNA的复制时序与基因的转录调控存在密切联系。细胞在分化过程中通过改变DNA复制时序使得分化后细胞的生物功能顺利实现,这一动态变化可能与染色质的序列、表观特征以及结构密切相关。为了验证这一假设,我们利用染色体构像捕获（Hi-C）等实验技术得到的高通量测序数据,根据胚胎干细胞与体细胞间复制时序的差异将基因组分为4类:在5类细胞中复制时序保守的早复制域,称为CE;5类细胞中复制时序保守的晚复制域,称为CL;在干细胞中晚复制而在4类体细胞中早复制的区域,称为LtoE;在干细胞中早复制而在4类体细胞中晚复制的区域,称为EtoL。我们从染色质的序列特征、表观特征和染色质结构特征三方面分析在分化中复制时序改变和保守区域的染色质特性。首先在染色质序列特征层面上,保守的复制域表现出与其复制时序相对应的染色质特征:早复制域是基...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
细胞周期中DNA复制起点的空间结构变化（Rivera-MuliaandGilbert2016）
华中农业大学 2019 届硕士研究生学位（毕业）论文传物质分子量。主要是 Repli-chip 以及 Repli-seq 技tani et al 2008, Ryba et al 2011)主要是使用 5-溴-2-脱氧的 DNA，根据 S 期的不同时期利用荧光激活细胞分选用 BrdU 分离出目标时间点合成的 DNA，最后通过微nsen 等人又对从 BrdU 标记和 FACS 分选获得的 DNA Repli-seq 技术(Hansen et al 2010)。通过将 S 期划分为是 6 个时期（G1、S1、S2、S3、S4、G2）计算早 S 期比。Repli-chip与Repli-seq数据在平滑和标准化后具有较
华中农业大学 2019 届硕士研究生学位（毕业）论文染色体构象捕获是一种用于研究细胞中染色体交互模式的生物技术，而 H术(Lieberman-Aiden et al 2009) (High-through chromosome conformation captu以细胞核结构为研究对象，利用高通量测序技术获得高分辨率的染色质相互作谱，结合生物信息学分析方法探索染色质的相互关系（图 1.3）。
本文编号：3400323
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
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【学位级别】：硕士
【部分图文】：
细胞周期中DNA复制起点的空间结构变化（Rivera-MuliaandGilbert2016）
华中农业大学 2019 届硕士研究生学位（毕业）论文传物质分子量。主要是 Repli-chip 以及 Repli-seq 技tani et al 2008, Ryba et al 2011)主要是使用 5-溴-2-脱氧的 DNA，根据 S 期的不同时期利用荧光激活细胞分选用 BrdU 分离出目标时间点合成的 DNA，最后通过微nsen 等人又对从 BrdU 标记和 FACS 分选获得的 DNA Repli-seq 技术(Hansen et al 2010)。通过将 S 期划分为是 6 个时期（G1、S1、S2、S3、S4、G2）计算早 S 期比。Repli-chip与Repli-seq数据在平滑和标准化后具有较
华中农业大学 2019 届硕士研究生学位（毕业）论文染色体构象捕获是一种用于研究细胞中染色体交互模式的生物技术，而 H术(Lieberman-Aiden et al 2009) (High-through chromosome conformation captu以细胞核结构为研究对象，利用高通量测序技术获得高分辨率的染色质相互作谱，结合生物信息学分析方法探索染色质的相互关系（图 1.3）。
本文编号：3400323
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