小鼠下丘脑和海马组织神经干细胞的蛋白质组学分析
发布时间:2021-09-27 23:28
目的:采用蛋白质组学法探讨C57BL/6J小鼠下丘脑和海马组织中神经干细胞(NSCs)中蛋白质表达差异,阐明不同来源(区域) NSCs中蛋白表达谱不同的原因,为下丘脑和海马组织NSCs的基础研究和移植治疗提供参考。方法:提取出生24 h内C57BL/6J小鼠原代下丘脑和海马组织NSCs,经传代进行扩增和纯化。观察细胞形态表现,免疫荧光法检测NSCs中Nestin和Sox2的表达,采用串联质谱标签(TMT)蛋白质组学法分析下丘脑和海马组织NSCs中的差异表达蛋白质,对得到的差异蛋白质进行生物信息学分析。结果:形态表现检测,下丘脑和海马组织NSCs均表现出不透明和折光率高的典型神经球形态。免疫荧光检测,下丘脑和海马组织NSCs中Nestin和Sox2阳性表达率随培养代数增加而升高,在第4代达到98%以上,但下丘脑和海马组织NSCs比较差异无统计学意义(P>0.05)。蛋白质组学分析,与海马组织比较,下丘脑组织NSCs中有6种蛋白表达水平明显升高(P<0.05和P<0.01),4种蛋白表达水平明显降低(P<0.05和P<0.01)。基因本体(GO)分析,差异蛋白...
【文章来源】:吉林大学学报(医学版). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
小鼠来源的P0代下丘脑和海马组织中NSCs形形态态表表现现(Bar=200μm)
P2~P4代下丘脑和海马组织中NSCs中Nestin和Sox2的阳性表达率随着代数的增加而增加,但下丘脑和海马组织NSCs中Nestin和Sox2的表达阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05)。当传代培养到P2代,下丘脑组织NSCs中Sox2阳性表达率为(76.87±5.65)%(Sox2+/DPAI),海马组织NSCs中Sox2阳性表达率为(80.75±10.76)%;下丘脑组织NSCs中Nestin阳性表达率为(74.66±9.40)%(Nestin+/DPAI),海马组织NSCs中Nestin阳性表达率为(80.72±12.71)%,见图3。当传代培养到P4代,下丘脑组织NSCs中Sox2阳性表达率为(98.35±2.58)%,海马组织NSCs中Sox2阳性表达率为(99.48±1.06)%;下丘脑组织NSCs中Nestin阳性表达率为(98.73±1.81)%,海马组织NSCs中Nestin阳性表达率为(99.48±1.06)%,见图4(插页三)和图5,即传代培养可以提升下丘脑和海马组织NSCs的纯化率,因此,本课题组选择具有较高纯度的P4代下丘脑和海马组织的NSCs用于后续研究,较高的NSCs比例为蛋白质组学的分析提供了保证。2.4 下丘脑和海马组织中NSCs质谱分析
通过TMT标记联合LC-MS/MS分析共匹配到131 016个质谱图,鉴定到42 456个肽段,38 195个特异性肽段和5 593种蛋白,对鉴定到的蛋白质进行统计学分析显示:在下丘脑和海马组织NSCs中最终得到10种差异蛋白,其中相对于海马NSCs上调的蛋白有6种,相对于海马NSCs下调的蛋白有4种。见表1。2.5 差异蛋白质的GO和KEEG通路分析
本文编号:3410814
【文章来源】:吉林大学学报(医学版). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
小鼠来源的P0代下丘脑和海马组织中NSCs形形态态表表现现(Bar=200μm)
P2~P4代下丘脑和海马组织中NSCs中Nestin和Sox2的阳性表达率随着代数的增加而增加,但下丘脑和海马组织NSCs中Nestin和Sox2的表达阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05)。当传代培养到P2代,下丘脑组织NSCs中Sox2阳性表达率为(76.87±5.65)%(Sox2+/DPAI),海马组织NSCs中Sox2阳性表达率为(80.75±10.76)%;下丘脑组织NSCs中Nestin阳性表达率为(74.66±9.40)%(Nestin+/DPAI),海马组织NSCs中Nestin阳性表达率为(80.72±12.71)%,见图3。当传代培养到P4代,下丘脑组织NSCs中Sox2阳性表达率为(98.35±2.58)%,海马组织NSCs中Sox2阳性表达率为(99.48±1.06)%;下丘脑组织NSCs中Nestin阳性表达率为(98.73±1.81)%,海马组织NSCs中Nestin阳性表达率为(99.48±1.06)%,见图4(插页三)和图5,即传代培养可以提升下丘脑和海马组织NSCs的纯化率,因此,本课题组选择具有较高纯度的P4代下丘脑和海马组织的NSCs用于后续研究,较高的NSCs比例为蛋白质组学的分析提供了保证。2.4 下丘脑和海马组织中NSCs质谱分析
通过TMT标记联合LC-MS/MS分析共匹配到131 016个质谱图,鉴定到42 456个肽段,38 195个特异性肽段和5 593种蛋白,对鉴定到的蛋白质进行统计学分析显示:在下丘脑和海马组织NSCs中最终得到10种差异蛋白,其中相对于海马NSCs上调的蛋白有6种,相对于海马NSCs下调的蛋白有4种。见表1。2.5 差异蛋白质的GO和KEEG通路分析
本文编号:3410814
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