基于转录组测序花烟草响应盐胁迫活性氧清除相关基因的挖掘

发布时间：2021-09-30 03:11

　　为了鉴定参与花烟草盐胁迫响应的活性氧清除相关基因,用200 mmol/L NaCl处理花烟草幼苗,并在处理后12 h采集其幼苗样本,提取总RNA,采用高通量测序技术,进行转录组测序。基于差异表达基因GO及KEGG分析的基础上,对参与其中的活性氧清除基因进行挖掘,利用qRT-PCR的方法验证转录组测序结果。结果表明,盐处理后,花烟草基因表达量变化在2倍以上的基因有7 239个（P<0.01）,其中,上调表达基因4 037个,下调表达基因3 162个,将其功能归类于生物过程、细胞组分及分子功能三大类159个GO条目,并显著富集在12条KEGG代谢通路中。同时,在盐胁迫下,花烟草有45个活性氧清除相关基因的表达发生了显著改变,其中,上调表达基因28个,下调表达基因17个。此结果说明,活性氧的清除是花烟草抵御盐胁迫的重要机制之一。 

【文章来源】：生物技术通报. 2020,36(12)北大核心CSCD

【文章页数】：12 页

【部分图文】：

样品各重复之间的相关性分析

抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)及谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)是2个构成植物抗氧化系统的关键酶类。APX是一类在高等植物中广泛存在的亚铁血红素蛋白,包括了4个不同的亚型,即叶绿体APX(sAPX)、类囊体APX(tAPX)、微体APX(mbAPX)和胞质APX(cAPX)[22]。APX的表达受生物及非生物胁迫因子的广泛诱导。研究表明,在盐胁迫下,碱蓬的SsAPX[23]及白桦的APX[24]的表达均显着升高;拟南芥APX[25]及枣树ZjAPX[26]的过表达,则显著增强了转基因植株的耐盐能力。图3 花烟草响应高盐胁迫的抗氧化基因

花烟草响应高盐胁迫的抗氧化基因

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3415008