柳树NAC基因的克隆与表达模式分析

发布时间：2021-10-20 22:52

　　【目的】研究柳树重要抗逆转录因子基因家族,为揭示柳树抗逆分子机制提供理论依据。【方法】以‘苏柳2345’的转录组测序数据为基础,克隆了柳树NAC家族,并分析其序列结构、组织表达特异性以及不同胁迫条件下的表达模式。【结果】克隆的两个柳树NAC转录因子基因分别命名为Sl NAC1和Sl NAC2。生物信息学分析表明:Sl NAC1序列全长为1 126 bp,编码产物含343个氨基酸残基,为稳定的亲水蛋白,定位于细胞核; Sl NAC2序列全长为1 139 bp,编码产物含291个氨基酸残基,为稳定的亲水蛋白,定位于叶绿体。两个基因均具有典型的NAM结构域及A、B、C、D、E 5个亚结构域,还包括共同的LPPG、YPNG和DEE保守基序及NAC抑制结构域。系统进化树分析显示,Sl NAC1基因与木薯亲缘关系最近,Sl NAC2基因与茄子亲缘关系最近。定量PCR结果显示Sl NAC1和Sl NAC2均在叶片表达,根中没有表达,为叶片特异性转录因子。定量PCR结果显示Sl NAC1基因在脱落酸（ABA）和赤霉素（GA）处理24 h后显著上调,Sl NAC2基因在聚乙二醇（PEG）、ABA和GA胁... 

【文章来源】：南京林业大学学报(自然科学版). 2020,44(01)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料和处理方法
    1.2 反转录PCR与NAC基因的克隆
    1.3 生物信息学分析
    1.4 基因表达分析
2 结果与分析
    2.1 柳树NAC基因与蛋白序列分析
    2.2 柳树NAC家族蛋白结构及进化树分析
    2.3 NAC基因表达模式分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]桃PpNAC72的克隆及表达分析[J]. 武肖琦,冯涛,刘艳军,焦思鹏,孙攀,杨静慧.  生物技术通报. 2019(06)
[2]沙冬青AmNAC6基因的克隆与功能初步分析[J]. 唐宽刚,任美艳,张文君,庞新跃,薛敏,王茅雁.  植物科学学报. 2018(05)
[3]木薯NAC转录因子Rd26基因克隆及表达[J]. 丁泽红,颜彦,付莉莉,黄猛,铁韦韦,胡伟.  南方农业学报. 2016(11)
[4]番茄NAC基因家族的系统进化及表达分析[J]. 姜秀明,牛义岭,许向阳.  分子植物育种. 2016(08)
[5]茄子SmNAC1基因的克隆与表达分析[J]. 邵帅,徐岭贤,王绍辉,赵福宽.  园艺学报. 2014(05)
[6]花生NAC转录因子AhNAC2和AhNAC3的克隆及转录特征[J]. 刘旭,李玲.  作物学报. 2009(03)



本文编号：3447740