白屈菜CmTLP基因克隆及植物转化载体构建
发布时间:2021-10-25 20:14
【目的】克隆白屈菜CmTLP基因并进行植物表达载体构建,为进一步研究CmTLP基因的功能及探索耐寒抗寒药用植物分子育种奠定基础。【方法】基于白屈菜转录组数据,分析得到白屈菜TLP基因开放阅读框,以18S RNA为内参基因,采用qRT-PCR法检测CmTLP基因在不同温度(20(CK),10,0,-7,-20℃)下白屈菜植株中的相对表达量。用RT-PCR法克隆该基因并构建植物表达载体,电击法转化根癌农杆菌。【结果】qRT-PCR结果表明,CmTLP基因在-7℃、12 h时,相对表达量最高;-7℃、24 h时,相对表达量最低。克隆白屈菜TLP基因,命名为CmTLP。该基因开放阅读框长度为696 bp,编码由231个氨基酸组成的肽链;分子质量为24.66 ku,为酸性蛋白。系统发育树表明,CmTLP基因与博落回、月季、胡桃的氨基酸序列有较高的同源性。构建了植物表达载体pRI201-AN-CmTLP,并成功转化根癌农杆菌。【结论】克隆了白屈菜CmTLP基因,构建植物表达载体pRI201-AN-CmTLP,并成功转化根癌农杆菌。
【文章来源】:西北农林科技大学学报(自然科学版). 2020,48(09)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
不同低温胁迫处理白屈菜CmTLP基因的相对表达量
将纯化的PCR产物与pMD19-T连接,从筛选出的阳性克隆培养物中提取质粒DNA,pMD19-T-CmTLP经Nde Ⅰ和Sac Ⅰ双酶切,在电泳图上可见2 600 bp和700 bp附近有条带,与载体pMD19-T和TLP片段大小一致,表明亚克隆载体构建完成(图2-b)。2.3 白屈菜CmTLP基因的生物信息学分析
用ProtParam预测TLP基因编码的蛋白质分子式为C1 081H1 631N295O333S18,分子质量为24.66 ku;等电点(pI)为4.80,是酸性蛋白;不稳定系数(Ⅱ)为26.74,属于稳定蛋白(不稳定指数>40为不稳定蛋白);平均亲水指数为-0.137,为亲水性蛋白。正电荷氨基酸残基(Arg+Lys)为14个,占6.06%;负电荷氨基酸残基(Asp+Glu)为18个,占7.79%;其开放阅读框长696 bp,可编码231个氨基酸(图3)。2.3.2 系统发育树
【参考文献】:
期刊论文
[1]白屈菜生物量与植株构件的生长规律研究[J]. 赵桐,于贺,胡冬雪,许萌,秦佳梅,宋金枝. 人参研究. 2018(06)
[2]植物类甜蛋白基因家族研究进展[J]. 刘潮,韩利红,王海波,高永,唐利洲. 生物技术通报. 2018(03)
[3]辣椒类甜蛋白基因家族鉴定及表达分析[J]. 刘潮,韩利红,宋培兵,王德琴,王海波,唐利洲. 江苏农业学报. 2018(01)
[4]基于网络药理学的白屈菜抗肿瘤分子机制研究[J]. 章亮,陈泽慧,陈韩英,王晓琴,张波. 中草药. 2018(03)
[5]绿豆类甜蛋白家族鉴定与生物信息学分析[J]. 刘潮,韩利红,王海波,宋培兵,唐利洲. 北方园艺. 2017(20)
[6]白菜型冬油菜类甜蛋白的筛选、克隆及其在低温胁迫下的表达[J]. 马骊,袁金海,孙万仓,刘自刚,曾秀存,武军艳,方彦,李学才,陈奇,许耀照,蒲媛媛,刘海卿,杨刚,刘林波. 作物学报. 2017(04)
[7]白屈菜生物碱作用研究进展[J]. 王雪,刘洪章,刘树英,刘一霏. 黑龙江畜牧兽医. 2016(14)
[8]湖北海棠类甜蛋白基因MhPR5的克隆与表达特性分析[J]. 张计育,渠慎春,乔玉山,章镇,郭忠仁. 植物资源与环境学报. 2013(02)
[9]植物抗冷性分子生物学研究进展(综述)[J]. 李美茹,刘鸿先,王以柔. 热带亚热带植物学报. 2000(01)
本文编号:3458093
【文章来源】:西北农林科技大学学报(自然科学版). 2020,48(09)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
不同低温胁迫处理白屈菜CmTLP基因的相对表达量
将纯化的PCR产物与pMD19-T连接,从筛选出的阳性克隆培养物中提取质粒DNA,pMD19-T-CmTLP经Nde Ⅰ和Sac Ⅰ双酶切,在电泳图上可见2 600 bp和700 bp附近有条带,与载体pMD19-T和TLP片段大小一致,表明亚克隆载体构建完成(图2-b)。2.3 白屈菜CmTLP基因的生物信息学分析
用ProtParam预测TLP基因编码的蛋白质分子式为C1 081H1 631N295O333S18,分子质量为24.66 ku;等电点(pI)为4.80,是酸性蛋白;不稳定系数(Ⅱ)为26.74,属于稳定蛋白(不稳定指数>40为不稳定蛋白);平均亲水指数为-0.137,为亲水性蛋白。正电荷氨基酸残基(Arg+Lys)为14个,占6.06%;负电荷氨基酸残基(Asp+Glu)为18个,占7.79%;其开放阅读框长696 bp,可编码231个氨基酸(图3)。2.3.2 系统发育树
【参考文献】:
期刊论文
[1]白屈菜生物量与植株构件的生长规律研究[J]. 赵桐,于贺,胡冬雪,许萌,秦佳梅,宋金枝. 人参研究. 2018(06)
[2]植物类甜蛋白基因家族研究进展[J]. 刘潮,韩利红,王海波,高永,唐利洲. 生物技术通报. 2018(03)
[3]辣椒类甜蛋白基因家族鉴定及表达分析[J]. 刘潮,韩利红,宋培兵,王德琴,王海波,唐利洲. 江苏农业学报. 2018(01)
[4]基于网络药理学的白屈菜抗肿瘤分子机制研究[J]. 章亮,陈泽慧,陈韩英,王晓琴,张波. 中草药. 2018(03)
[5]绿豆类甜蛋白家族鉴定与生物信息学分析[J]. 刘潮,韩利红,王海波,宋培兵,唐利洲. 北方园艺. 2017(20)
[6]白菜型冬油菜类甜蛋白的筛选、克隆及其在低温胁迫下的表达[J]. 马骊,袁金海,孙万仓,刘自刚,曾秀存,武军艳,方彦,李学才,陈奇,许耀照,蒲媛媛,刘海卿,杨刚,刘林波. 作物学报. 2017(04)
[7]白屈菜生物碱作用研究进展[J]. 王雪,刘洪章,刘树英,刘一霏. 黑龙江畜牧兽医. 2016(14)
[8]湖北海棠类甜蛋白基因MhPR5的克隆与表达特性分析[J]. 张计育,渠慎春,乔玉山,章镇,郭忠仁. 植物资源与环境学报. 2013(02)
[9]植物抗冷性分子生物学研究进展(综述)[J]. 李美茹,刘鸿先,王以柔. 热带亚热带植物学报. 2000(01)
本文编号:3458093
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3458093.html
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