小鼠行为学自动化分析系统
发布时间:2021-11-09 07:51
在大部分的哺乳动物中基本上都有自发的活动和社会行为等特征。由于小鼠的行为和活动能够定量的反映出小鼠对于外界环境和药物的反应。所以自发性活动和社会行为的统计信息,对于生物医学等领域有着重要的意义。早期的动物行为学的研究主要是依赖人工的标记,这样会导致实验的大部分时间在进行重复的标记工作,并且人工标记具有一定的主观性和偏差,对于参数定量化也存在着困难。近几年随着计算机视觉和图形学技术的发展,在小鼠监控和活动行为的自动检测识别上面有了很大的进步。可以通过图像处理的方法,自动的处理视频中小鼠的行为和活动。神经网络模型经过10几年的不断完善和改进,在图像识别、自然语言处理、视频处理等方便都有了突破性的进展。本文主要采用了传统的图像预处理方法和YOLO模型相结合的方法,对小鼠的运动和行为的视频信息进行自动化处理。使用了分割算法对小鼠的轮廓信息进行提取,并通过小鼠的身体部位信息,进行整合并判断小鼠的所发生的行为。通过小鼠转圈实验来对小鼠的前庭损伤进行定量的分析。并且对程序进行优化,让程序进行并行化处理,大幅度的增快了处理的速度。这样在处理量巨大的情况下,也可以在很短的时间内得到实验结果,加快了实验进...
【文章来源】:哈尔滨工业大学黑龙江省 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图21分析系统组成
哈尔滨工业大学工程硕士学位论文模块分析模块,主要是通过对破坏了前庭功能的小鼠进行析小鼠的倾听受损情况,以此来对普通的小鼠进行对比行为和多只小鼠的相互行为进行跟踪,来对小鼠的生理分析过程 块都会用到经过图片预处理和神经网络的目标定位识以通过不同小鼠的身体部位坐标,来对小鼠的的行为进连接小鼠的头部 身体重心和尾部,来测量小鼠的身体
2.3 本章小结本章主要介绍了拍摄环境和自动化处理程序之间的流程关系,详细介绍了鼠笼环境的搭建,相机和灯光的选择 小鼠的活动空间大概为 43cm*33cm,空间范围足以让四只小鼠自由活动不受影响 红外摄像头可以清楚的拍摄到整个底部和 1/3 的墙壁 这样就保证了即使小鼠爬墙,也可以拍摄到 不透光黑布的包裹,可以保证小鼠不会受到外部灯光的影响,增强实验的准确度
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于轮廓的小鼠悬尾实验行为分析算法研究[J]. 李松柏,张卫华,胡光亮. 计算机技术与发展. 2018(08)
[2]栀子厚朴汤对小鼠抗抑郁作用研究[J]. 初云海,来杰,贾静丽,国紫薇,田明. 中医药学报. 2017(06)
[3]饮用水中添加脂多糖对小鼠能量代谢及行为的影响[J]. 袁业现,余璐璐,廖正睿,朱灿俊,蔡兴才,朱晓彤,江青艳,束刚,高萍. 华南农业大学学报. 2017(06)
[4]实验小鼠运动参数的模板匹配及粒子滤波提取方法[J]. 张继文,梁桐,张淑平. 自动化学报. 2018(01)
[5]Shank3基因敲除自闭症小鼠的焦虑样行为分析[J]. 刘加强,胡敏,郭保霖,谢育英,武胜昔,王文挺. 神经解剖学杂志. 2016(05)
[6]基于人计算的小鼠行为识别[J]. 刘景,邓莎莎,童晶,陈正鸣. 计算机应用. 2014(02)
[7]小鼠动物实验方法系列专题(七)旷场实验在小鼠行为分析中的应用[J]. 王维刚,刘震泽,吴文婷,万颖寒,严惠敏. 中国细胞生物学学报. 2011(11)
[8]基于轮廓曲率和谱系聚类的大鼠体态自动识别[J]. 张敏,张恒义,郑筱祥. 浙江大学学报(工学版). 2006(03)
本文编号:3484927
【文章来源】:哈尔滨工业大学黑龙江省 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图21分析系统组成
哈尔滨工业大学工程硕士学位论文模块分析模块,主要是通过对破坏了前庭功能的小鼠进行析小鼠的倾听受损情况,以此来对普通的小鼠进行对比行为和多只小鼠的相互行为进行跟踪,来对小鼠的生理分析过程 块都会用到经过图片预处理和神经网络的目标定位识以通过不同小鼠的身体部位坐标,来对小鼠的的行为进连接小鼠的头部 身体重心和尾部,来测量小鼠的身体
2.3 本章小结本章主要介绍了拍摄环境和自动化处理程序之间的流程关系,详细介绍了鼠笼环境的搭建,相机和灯光的选择 小鼠的活动空间大概为 43cm*33cm,空间范围足以让四只小鼠自由活动不受影响 红外摄像头可以清楚的拍摄到整个底部和 1/3 的墙壁 这样就保证了即使小鼠爬墙,也可以拍摄到 不透光黑布的包裹,可以保证小鼠不会受到外部灯光的影响,增强实验的准确度
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于轮廓的小鼠悬尾实验行为分析算法研究[J]. 李松柏,张卫华,胡光亮. 计算机技术与发展. 2018(08)
[2]栀子厚朴汤对小鼠抗抑郁作用研究[J]. 初云海,来杰,贾静丽,国紫薇,田明. 中医药学报. 2017(06)
[3]饮用水中添加脂多糖对小鼠能量代谢及行为的影响[J]. 袁业现,余璐璐,廖正睿,朱灿俊,蔡兴才,朱晓彤,江青艳,束刚,高萍. 华南农业大学学报. 2017(06)
[4]实验小鼠运动参数的模板匹配及粒子滤波提取方法[J]. 张继文,梁桐,张淑平. 自动化学报. 2018(01)
[5]Shank3基因敲除自闭症小鼠的焦虑样行为分析[J]. 刘加强,胡敏,郭保霖,谢育英,武胜昔,王文挺. 神经解剖学杂志. 2016(05)
[6]基于人计算的小鼠行为识别[J]. 刘景,邓莎莎,童晶,陈正鸣. 计算机应用. 2014(02)
[7]小鼠动物实验方法系列专题(七)旷场实验在小鼠行为分析中的应用[J]. 王维刚,刘震泽,吴文婷,万颖寒,严惠敏. 中国细胞生物学学报. 2011(11)
[8]基于轮廓曲率和谱系聚类的大鼠体态自动识别[J]. 张敏,张恒义,郑筱祥. 浙江大学学报(工学版). 2006(03)
本文编号:3484927
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