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位于可变内含子区域microRNA的特征分析

发布时间:2021-11-14 17:36
  MicroRNA(简称miRNA)是一类长度为22nt的编码小分子RNA,在基因表达调控中发挥重要作用。miRNA在基因组中存在位置偏好性,一部分miRNA位于基因间区,而另一些miRNA基因位于蛋白质编码基因的内含子中,少数位于外显子中,称之为基因内miRNA。可变剪接(也称选择性剪接,alternative splicing,AS)是指对同一基因的mRNA前体的不同剪接方式,即一种基因能产生多种mRNA。研究发现,miRNA与基因的选择性剪接密切相关,有些miRNA位于基因的可变剪接区域。论文利用生物信息学方法对位于可变剪接区域miRNA特征进行分析。 

【文章来源】:中小企业管理与科技(中旬刊). 2020,(01)

【文章页数】:2 页

【文章目录】:
1 引言
2 材料与方法
    2.1 数据收集
    2.2 可变剪接区序列特征分析
    2.3 可变剪接区剪接调控功能元件预测
    2.4 可变内含子miRNA作用靶基因预测及功能分析
3 结果与分析
    3.1 可变内含子区域miRNA的鉴定
    3.2 位于可变剪接区域miRNA及可变剪接基因特征分析
    3.3 可变剪接区域序列GC含量、Cp G岛及SNP分布特征分析
    3.4 可变剪接区域参与的剪接调控的功能元件及剪接因子的作用位点预测
    3.5 可变内含子miRNA靶标基因预测及功能分析
4 结论



本文编号:3495061

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