TVMV和PVX侵染本氏烟引发的m6A甲基化变化研究
发布时间：2021-11-24 00:54
6-甲基腺嘌呤[N6-methyl-adenosine（m6A）]是指发生于腺嘌呤（Adenine）的第6位氮原子（N）上的甲基化修饰,是近年来备受关注的RNA表观遗传调控方向的研究热点。m6A甲基化在人类RNA病毒（如HIV）和植物病毒（AMV和CMV）复制中也具有一定的调控作用。但关于植物病毒是否影响植物体内的m6A甲基化变化的报道很少。本论文研究了本氏烟（Nicotianabenthamiana）受到烟草脉斑驳病毒（TVMV）、马铃薯X病毒（PVX）侵染后对寄主RNA m6A甲基化的影响。研究结果如下:（1）通过比色法测定m6A甲基化水平,发现在病毒侵染本氏烟后,m6A甲基化水平与健康植株相比显著降低（P<0.5）,所检测到的m6A分别为0.0565%（健康植株）,0.0295%（TVMV）和 0.0205%（PVX）。（2）对侵染TVMV和PVX的样品中m6A甲基化峰进行了 MeRIP-Seq测序分析。结果也证实了病毒侵染后植株中m6A甲基化水平明显降低,健康植株中有33655个m6A甲基化峰,侵染TVMV的样品中有32556个m6A甲基化峰,侵染PVX的样品中有1888...
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１真核生物ｍＲＮＡ中常见化学修饰分布（引自⑴）??Ｆｉｇ．ｌ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｃｏｍｍｏｎ?ｃｈｅｍｉｃａｌ?ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ?ｉｎ?ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ?ｍＲＮＡ??
?内蒙古农业大学硕士学位：论文?１５??３结果与分析??３．１?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ侵染后本氏烟ｍ６Ａ甲基化水平??在本氏烟（ｉＶ．?执ａｍｉａｒｎｊ）上用机械摩擦接种的方法接种了?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ，１４??ｄ后观察病毒侵染症状，如图２所示，与健康本氏烟相比，被ＰＶＸ侵染的叶片表现??为轻型花叶，叶片上有大小不等、形状不规则的黄绿色斑驳；被ＴＶＭＶ侵染的叶片??表现为厚度不均匀的症状。在系统侵染的叶片中采用ＲＴ－ＰＣＲ方法分析验证了病毒的??积累量，如图３可知ＴＶＭＶ和ＰＶＸ都获得了相应的特异性扩增条带，说明本氏烟中??病毒的积累量达到要求，可以进行下一步实验。采用比色法（ＥｐｉＱｕｉｋｍ６ＡＲＮＡ甲基??化定量试剂盒）对病毒侵染的系统叶片进行测定ｍ６Ａ甲基化。结果如图４，检测到??健康植物、ＴＶＭＶ和ＰＶＸ侵染的样品中ｍ６Ａ甲基化分别为０．０５６５％，?０．０２９５％和??０．０２０５％。这表明这两种病毒侵染均导致寄主植物中总的ｍ６Ａ甲基化水平显著降低??（Ｐ＜０．５），??Ｈｅａｌｔｈｙ?ＴＶＭＶ?ＰＶＸ??＿＿＿??图２?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ在本氏烟上的侵染症状??Ｆｉｇ．２?Ｓｙｍｐｔｏｍｓ?ｏｆ?ＴＶＭＶ?ａｎｄ?ＰＶＸ?ｉｎｆｅｃｔｅｄ?Ｎ．?ｂｅｎｔｈａｍｉａｎａ??０．０７?ｉ??〇．〇ａ．??１５００ｈｐ?＇??｜?０．０４?－?Ｈ??＞〇〇?ａＱ２?■?■畜??雇ｂｐ?°＇°；丨■?■?■??１００?ｂｐ?Ｈｅａｌｔｈｙ?ＴＶＭＶ??图３?ＲＴ－ＰＣＲ方法检测ＴＶＭＶ和ＰＶＸ?图４病毒ｆｅ：染后的ｍ６Ａ甲基化水平??Ｆｉｇ．３?Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ＴＶＭＶ?ａｎｄ?Ｐ
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【参考文献】：
期刊论文
[1]m6A与mRNA代谢及其与恶性肿瘤关系的研究进展[J]. 孙善文,雍红梅,周学义. 现代肿瘤医学. 2020(10)
[2]高效液相色谱-串联质谱法测定芒果中六种链格孢霉毒素残留[J]. 张子庚,张爱芝,邢家溧,承海,张书芬,郑睿行,戴贤君. 食品工业科技. 2020(20)
[3]RNA甲基化修饰m6A在动物中的研究进展[J]. 何波,周小枫,蒋瑶,曹浩男,袁晓龙,张哲,张豪,李加琪. 畜牧与兽医. 2020(03)
[4]m6A修饰在人类相关致病病毒中的作用与研究进展[J]. 吴芳,成文召,赵飞媛,范大梦,刁勇,许瑞安,唐明青. 病毒学报. 2019(05)
[5]病毒基因组中m6A甲基化修饰调控机制及研究进展[J]. 巩沅鑫,王超,李晋涛. 病毒学报. 2018(05)
[6]RNA修饰分布特征概述[J]. 韩潇,孙宝发. 生命科学. 2018(04)
[7]mRNA修饰研究概况及展望[J]. 孙文举,周克任,杨建华,周惠,屈良鹄. 生命科学. 2016(05)
[8]拟南芥m6A甲基化组的系统鉴定和功能分析[J]. 骆观正,Alice MacQueen,郑冠群,段红超,Louis C.Dore,卢志科,刘君,陈凯,贾桂芳,Joy Bergelson,何川. 遗传. 2015(03)
[9]人类疱疹病毒8型基因甲基化的研究进展[J]. 吴曹英,普雄明. 中国麻风皮肤病杂志. 2012 (09)
博士论文
[1]RNA m6A修饰及其催化基因METTL14在肝癌发生发展中的作用及机制研究[D]. 马金召.第二军医大学 2017
[2]mRNA m6A位点预测及其功能的系统生物学研究[D]. 向书念.清华大学 2017
[3]RNA N6-甲基腺嘌呤（m6A）位点形成机制及功能研究[D]. 郝亚娟.中国科学院北京基因组研究所 2016
硕士论文
[1]高脂对小鼠肝脏基因RNA甲基化的影响[D]. 罗祖朋.广西大学 2019
本文编号：3514966
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：48 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１真核生物ｍＲＮＡ中常见化学修饰分布（引自⑴）??Ｆｉｇ．ｌ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｃｏｍｍｏｎ?ｃｈｅｍｉｃａｌ?ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ?ｉｎ?ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ?ｍＲＮＡ??
?内蒙古农业大学硕士学位：论文?１５??３结果与分析??３．１?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ侵染后本氏烟ｍ６Ａ甲基化水平??在本氏烟（ｉＶ．?执ａｍｉａｒｎｊ）上用机械摩擦接种的方法接种了?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ，１４??ｄ后观察病毒侵染症状，如图２所示，与健康本氏烟相比，被ＰＶＸ侵染的叶片表现??为轻型花叶，叶片上有大小不等、形状不规则的黄绿色斑驳；被ＴＶＭＶ侵染的叶片??表现为厚度不均匀的症状。在系统侵染的叶片中采用ＲＴ－ＰＣＲ方法分析验证了病毒的??积累量，如图３可知ＴＶＭＶ和ＰＶＸ都获得了相应的特异性扩增条带，说明本氏烟中??病毒的积累量达到要求，可以进行下一步实验。采用比色法（ＥｐｉＱｕｉｋｍ６ＡＲＮＡ甲基??化定量试剂盒）对病毒侵染的系统叶片进行测定ｍ６Ａ甲基化。结果如图４，检测到??健康植物、ＴＶＭＶ和ＰＶＸ侵染的样品中ｍ６Ａ甲基化分别为０．０５６５％，?０．０２９５％和??０．０２０５％。这表明这两种病毒侵染均导致寄主植物中总的ｍ６Ａ甲基化水平显著降低??（Ｐ＜０．５），??Ｈｅａｌｔｈｙ?ＴＶＭＶ?ＰＶＸ??＿＿＿??图２?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ在本氏烟上的侵染症状??Ｆｉｇ．２?Ｓｙｍｐｔｏｍｓ?ｏｆ?ＴＶＭＶ?ａｎｄ?ＰＶＸ?ｉｎｆｅｃｔｅｄ?Ｎ．?ｂｅｎｔｈａｍｉａｎａ??０．０７?ｉ??〇．〇ａ．??１５００ｈｐ?＇??｜?０．０４?－?Ｈ??＞〇〇?ａＱ２?■?■畜??雇ｂｐ?°＇°；丨■?■?■??１００?ｂｐ?Ｈｅａｌｔｈｙ?ＴＶＭＶ??图３?ＲＴ－ＰＣＲ方法检测ＴＶＭＶ和ＰＶＸ?图４病毒ｆｅ：染后的ｍ６Ａ甲基化水平??Ｆｉｇ．３?Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ＴＶＭＶ?ａｎｄ?Ｐ
?内蒙古农业大学硕士学位：论文?１５??３结果与分析??３．１?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ侵染后本氏烟ｍ６Ａ甲基化水平??在本氏烟（ｉＶ．?执ａｍｉａｒｎｊ）上用机械摩擦接种的方法接种了?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ，１４??ｄ后观察病毒侵染症状，如图２所示，与健康本氏烟相比，被ＰＶＸ侵染的叶片表现??为轻型花叶，叶片上有大小不等、形状不规则的黄绿色斑驳；被ＴＶＭＶ侵染的叶片??表现为厚度不均匀的症状。在系统侵染的叶片中采用ＲＴ－ＰＣＲ方法分析验证了病毒的??积累量，如图３可知ＴＶＭＶ和ＰＶＸ都获得了相应的特异性扩增条带，说明本氏烟中??病毒的积累量达到要求，可以进行下一步实验。采用比色法（ＥｐｉＱｕｉｋｍ６ＡＲＮＡ甲基??化定量试剂盒）对病毒侵染的系统叶片进行测定ｍ６Ａ甲基化。结果如图４，检测到??健康植物、ＴＶＭＶ和ＰＶＸ侵染的样品中ｍ６Ａ甲基化分别为０．０５６５％，?０．０２９５％和??０．０２０５％。这表明这两种病毒侵染均导致寄主植物中总的ｍ６Ａ甲基化水平显著降低??（Ｐ＜０．５），??Ｈｅａｌｔｈｙ?ＴＶＭＶ?ＰＶＸ??＿＿＿??图２?ＴＶＭＶ和ＰＶＸ在本氏烟上的侵染症状??Ｆｉｇ．２?Ｓｙｍｐｔｏｍｓ?ｏｆ?ＴＶＭＶ?ａｎｄ?ＰＶＸ?ｉｎｆｅｃｔｅｄ?Ｎ．?ｂｅｎｔｈａｍｉａｎａ??０．０７?ｉ??〇．〇ａ．??１５００ｈｐ?＇??｜?０．０４?－?Ｈ??＞〇〇?ａＱ２?■?■畜??雇ｂｐ?°＇°；丨■?■?■??１００?ｂｐ?Ｈｅａｌｔｈｙ?ＴＶＭＶ??图３?ＲＴ－ＰＣＲ方法检测ＴＶＭＶ和ＰＶＸ?图４病毒ｆｅ：染后的ｍ６Ａ甲基化水平??Ｆｉｇ．３?Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ＴＶＭＶ?ａｎｄ?Ｐ
【参考文献】：
期刊论文
[1]m6A与mRNA代谢及其与恶性肿瘤关系的研究进展[J]. 孙善文,雍红梅,周学义. 现代肿瘤医学. 2020(10)
[2]高效液相色谱-串联质谱法测定芒果中六种链格孢霉毒素残留[J]. 张子庚,张爱芝,邢家溧,承海,张书芬,郑睿行,戴贤君. 食品工业科技. 2020(20)
[3]RNA甲基化修饰m6A在动物中的研究进展[J]. 何波,周小枫,蒋瑶,曹浩男,袁晓龙,张哲,张豪,李加琪. 畜牧与兽医. 2020(03)
[4]m6A修饰在人类相关致病病毒中的作用与研究进展[J]. 吴芳,成文召,赵飞媛,范大梦,刁勇,许瑞安,唐明青. 病毒学报. 2019(05)
[5]病毒基因组中m6A甲基化修饰调控机制及研究进展[J]. 巩沅鑫,王超,李晋涛. 病毒学报. 2018(05)
[6]RNA修饰分布特征概述[J]. 韩潇,孙宝发. 生命科学. 2018(04)
[7]mRNA修饰研究概况及展望[J]. 孙文举,周克任,杨建华,周惠,屈良鹄. 生命科学. 2016(05)
[8]拟南芥m6A甲基化组的系统鉴定和功能分析[J]. 骆观正,Alice MacQueen,郑冠群,段红超,Louis C.Dore,卢志科,刘君,陈凯,贾桂芳,Joy Bergelson,何川. 遗传. 2015(03)
[9]人类疱疹病毒8型基因甲基化的研究进展[J]. 吴曹英,普雄明. 中国麻风皮肤病杂志. 2012 (09)
博士论文
[1]RNA m6A修饰及其催化基因METTL14在肝癌发生发展中的作用及机制研究[D]. 马金召.第二军医大学 2017
[2]mRNA m6A位点预测及其功能的系统生物学研究[D]. 向书念.清华大学 2017
[3]RNA N6-甲基腺嘌呤（m6A）位点形成机制及功能研究[D]. 郝亚娟.中国科学院北京基因组研究所 2016
硕士论文
[1]高脂对小鼠肝脏基因RNA甲基化的影响[D]. 罗祖朋.广西大学 2019
本文编号：3514966
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3514966.html
教材专著
