木霉菌基因组热激转录因子家族基因特性

发布时间：2022-01-06 04:08

　　木霉（Trichoderma）是一种良好的生防因子,为揭示木霉热激转录因子（Heat shock transcription factor）基因的功能并为木霉菌种的改良提供基础数据,通过生物信息学分析方法,在7种9株木霉全基因组水平上鉴定出27个HSTF基因,并选取酿酒酵母中的5个HSTF基因作为对照,对它们的系统发育关系、序列特征、表达情况以及蛋白结构进行详细分析;通过克隆链格孢属（Alternaria alternata）真菌胁迫下HSTFTas基因并分析其表达量。研究结果表明:每株木霉含有3个HSTF基因家族成员,分子质量56.1～81.1 kD,等电点（PI）5.50～8.98。HSTF基因序列特征和系统进化分析将木霉的热激转录因子分为3个分支（Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ）。3类热激转录因子的蛋白质三级结构差异较大,总共含有7～8种保守基序。棘孢木霉（T.asperellum） CBS 433.97的3类HSTF基因在链格孢致病毒素胁迫下均有响应,其表达量分别在诱导24 h、24 h和2 h时提高了1.5、2.6和1.7倍。木霉热激转录因子基因家族有较高保守性,木霉与病原菌互作过程中,木霉的H... 

【文章来源】：吉林农业大学学报. 2020,42(06)北大核心CSCD

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【部分图文】：

7种9株木霉的27个HSTF基因的内含子和外显子结构图

为了解不同种木霉菌中的HSTF基因是否具有相同或相似的序列特征,使用27个木霉HSTF蛋白的完整氨基酸序列、5个酿酒酵母HSTF蛋白氨基酸序列和4个拟南芥HSTF蛋白氨基酸序列构建了进化树(图4)。结果表明,木霉HSTF基因家族被分成3个分支(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),且3个分支在亲缘关系上较远,其中每个分支都包含9个HSTFs基因。处于进化树末端的同源基因的序列特征相似度较高,如HSTF-Ⅰ类基因中的9个直系同源基因分支可靠程度较高,支持率数值均约为90。相比于HSTF-Ⅰ基因,HSTF-Ⅱ和HSTF-Ⅲ类基因中的直系同源基因分支可靠程度较低。酿酒酵母的HSTF1Sac, HSTF4Sac和HSTF2Sac,HSTF5Sac基因分别与木霉的HSTF-Ⅱ类和HSTF-Ⅲ类基因相似,而HSTF3Sac基因与木霉的HSTF基因在进化程度上有较大差异。图3 木霉菌HSTF多序列比对

木霉菌HSTF多序列比对

【参考文献】：
期刊论文
[1]黄瓜全基因组热激转录因子（HSFs）的鉴定与表达分析[J]. 陈先知,王燕,史建磊,朱隆静,王克磊,徐坚.  遗传. 2014(04)
[2]植物热激转录因子在非生物逆境中的作用[J]. 翁锦周,洪月云.  分子植物育种. 2006(01)



本文编号：3571699