基于叶绿体基因组的香青属分子系统学研究
发布时间：2022-01-25 06:26
香青属（Anaphalis DC）是菊科（Asteraceae/Compositae）鼠麴草族（Gnaphalieae）的一个大属,约有110余种。主要分布于亚洲热带和亚热带地区,以泛喜马拉雅地区为分布中心,少数分布于欧洲和北美。香青属属下类群多,叶形、头状花序、小花等形态性状变异非常复杂,在属下种间以及与近缘属之间性状存在交叉现象,且多数种类在形态上表现出多型性现象,存在杂交以及多倍化现象,其属内种间以及与近缘属间的系统学关系一直备受争议。植物叶绿体具有基因组较小,但包含大量的遗传信息;易提取分离;在分子水平上的差异明显等特点,被广泛用于物种系统发育研究。本研究利用高通量测序技术对香青属61个类群（隶属于47种）和3个拟鼠麴草属物种进行二代测序,利用生物信息学方法注释所有的叶绿体基因组序列,对其特征进行比较分析,并用叶绿体基因组序列和细胞核基因序列（ITS、ETS）构建系统发育树,结合形态学特征探究了香青属属下类群间及与近缘属间的系统发育关系。本研究的主要内容及结果如下:1.本研究通过高通量测序技术获得53个香青属类群和3个拟鼠麴草属类群的完整叶绿体基因组序列,以及8个不完整的香青属...
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：94 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
香青属在中国地理分布图（来自360地图）
23图 3.1 珠光香青叶绿体基因组图谱注：内圈基因顺时针方向转录，外圈基因顺序逆时针转录。不同的颜色表示基因不同的功能。内圈中的深灰色区域表示 GC 含量，而浅灰色表示基因组的 AT 含量。Figure 3.1 Gene map of the A. margaritaceae chloroplast genome.Note: Genes drawn inside the circle are transcribed clockwise, and those outside arecounterclockwise. The colored bars indicate different functional groups. The dark gray area in theinner circle corresponds to GC content while the light gray corresponds to theAT content of thegenome.
38图 3.3 菊科植物 trnT-GGU 比较Figure 3.3 Comparison of trnT-GGU sequences among Asteraceae species.
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序组装‘赤霞珠’叶绿体基因组及其特征分析[J]. 谢海坤,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,孙海生,刘崇怀. 中国农业科学. 2017(09)
[2]药用植物叶绿体基因组研究进展[J]. 倪梁红,赵志礼,米玛. 中药材. 2015(09)
[3]香青中农用抗菌活性研究[J]. 杨凌云,曹慧,高宁馨. 北京农业. 2015(09)
[4]茶树“龙井43"叶绿体基因组测序及其系统进化（英文）[J]. 叶晓倩,赵忠辉,朱全武,王营营,林张翔,叶楚玉,樊龙江,须海荣. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2014(04)
[5]光苞紫菊Notoseris macilenta的核型分析[J]. 关莉,陆阳,朱世新. 郑州师范教育. 2013(06)
[6]基于叶绿体DNA序列的Ceratotropis亚属遗传进化研究[J]. 刘岩,程须珍,王丽侠,王素华,白鹏. 作物学报. 2013(06)
[7]基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 药学学报. 2012(01)
[8]叶绿体系统发育基因组学的研究进展[J]. 张韵洁,李德铢. 植物分类与资源学报. 2011(04)
[9]14种高原植物抑制植物病原菌活性的初步研究[J]. 杨茜,王晶,达娃,杨从军,全鑫,陶科,侯太平. 四川大学学报(自然科学版). 2011(03)
[10]植物DNA条形码技术的发展及应用[J]. 刘宇婧,刘越,黄耀江,龙春林. 植物资源与环境学报. 2011(01)
博士论文
[1]基于高通量测序技术的小麦和紫茎泽兰基因组学初步研究[D]. 聂小军.西北农林科技大学 2013
[2]毛鳞菊属和细莴苣属的系统学研究[D]. 朱世新.中国科学院研究生院（植物研究所） 2004
硕士论文
[1]羊草叶绿体全基因组分析及分子标记开发[D]. 杨艳婷.扬州大学 2018
[2]十种报春花属植物的叶绿体基因组研究[D]. 任婷.西北大学 2018
[3]葡萄属叶绿体基因组分析及其系统发育研究[D]. 王义华.华中农业大学 2018
[4]地黄属植物叶绿体基因组研究[D]. 曾淑云.西北大学 2017
[5]泛喜马拉雅地区香青属植物系统分类学研究[D]. 许雪敏.郑州大学 2017
[6]百合属的比较叶绿体基因组学研究[D]. 毕彧.吉林农业大学 2017
[7]稗草叶绿体基因组测序及其分子标记开发与利用[D]. 林张翔.浙江大学 2015
[8]假福王草属Paraprenanthes（菊科—菊苣族）的系统学初步研究[D]. 陆阳.郑州大学 2013
[9]中国香青属植物系统分类学初步研究[D]. 张燕梅.郑州大学 2009
[10]青藏高原东缘高寒草甸传播体微形态特征研究[D]. 景国海.西北师范大学 2007
本文编号：3608052
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：94 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
香青属在中国地理分布图（来自360地图）
23图 3.1 珠光香青叶绿体基因组图谱注：内圈基因顺时针方向转录，外圈基因顺序逆时针转录。不同的颜色表示基因不同的功能。内圈中的深灰色区域表示 GC 含量，而浅灰色表示基因组的 AT 含量。Figure 3.1 Gene map of the A. margaritaceae chloroplast genome.Note: Genes drawn inside the circle are transcribed clockwise, and those outside arecounterclockwise. The colored bars indicate different functional groups. The dark gray area in theinner circle corresponds to GC content while the light gray corresponds to theAT content of thegenome.
38图 3.3 菊科植物 trnT-GGU 比较Figure 3.3 Comparison of trnT-GGU sequences among Asteraceae species.
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序组装‘赤霞珠’叶绿体基因组及其特征分析[J]. 谢海坤,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,孙海生,刘崇怀. 中国农业科学. 2017(09)
[2]药用植物叶绿体基因组研究进展[J]. 倪梁红,赵志礼,米玛. 中药材. 2015(09)
[3]香青中农用抗菌活性研究[J]. 杨凌云,曹慧,高宁馨. 北京农业. 2015(09)
[4]茶树“龙井43"叶绿体基因组测序及其系统进化（英文）[J]. 叶晓倩,赵忠辉,朱全武,王营营,林张翔,叶楚玉,樊龙江,须海荣. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2014(04)
[5]光苞紫菊Notoseris macilenta的核型分析[J]. 关莉,陆阳,朱世新. 郑州师范教育. 2013(06)
[6]基于叶绿体DNA序列的Ceratotropis亚属遗传进化研究[J]. 刘岩,程须珍,王丽侠,王素华,白鹏. 作物学报. 2013(06)
[7]基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 药学学报. 2012(01)
[8]叶绿体系统发育基因组学的研究进展[J]. 张韵洁,李德铢. 植物分类与资源学报. 2011(04)
[9]14种高原植物抑制植物病原菌活性的初步研究[J]. 杨茜,王晶,达娃,杨从军,全鑫,陶科,侯太平. 四川大学学报(自然科学版). 2011(03)
[10]植物DNA条形码技术的发展及应用[J]. 刘宇婧,刘越,黄耀江,龙春林. 植物资源与环境学报. 2011(01)
博士论文
[1]基于高通量测序技术的小麦和紫茎泽兰基因组学初步研究[D]. 聂小军.西北农林科技大学 2013
[2]毛鳞菊属和细莴苣属的系统学研究[D]. 朱世新.中国科学院研究生院（植物研究所） 2004
硕士论文
[1]羊草叶绿体全基因组分析及分子标记开发[D]. 杨艳婷.扬州大学 2018
[2]十种报春花属植物的叶绿体基因组研究[D]. 任婷.西北大学 2018
[3]葡萄属叶绿体基因组分析及其系统发育研究[D]. 王义华.华中农业大学 2018
[4]地黄属植物叶绿体基因组研究[D]. 曾淑云.西北大学 2017
[5]泛喜马拉雅地区香青属植物系统分类学研究[D]. 许雪敏.郑州大学 2017
[6]百合属的比较叶绿体基因组学研究[D]. 毕彧.吉林农业大学 2017
[7]稗草叶绿体基因组测序及其分子标记开发与利用[D]. 林张翔.浙江大学 2015
[8]假福王草属Paraprenanthes（菊科—菊苣族）的系统学初步研究[D]. 陆阳.郑州大学 2013
[9]中国香青属植物系统分类学初步研究[D]. 张燕梅.郑州大学 2009
[10]青藏高原东缘高寒草甸传播体微形态特征研究[D]. 景国海.西北师范大学 2007
本文编号：3608052
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3608052.html
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