湖北兴山大型子囊菌物种多样性和分子系统学研究
发布时间:2022-11-05 10:06
对于特定地区进行生物多样性调查研究,是开展生物多样性保护、物种生存状态评价和合理开发利用物种资源的重要基础性工作。大型子囊菌作为生物多样性的重要组成类群之一,对于特定区域的系统性调查研究却不多见。本研究对湖北省兴山县的大型子囊菌资源进行实地调查和评估,并根据获得的基因数据开展分子系统学研究,初步探究其遗传进化关系。本研究在兴山县6个乡镇20个地点进行调查和采集,横跨春夏秋三季,覆盖5种林型。采集共获得416份标本,隶属于4纲5目21科51属。鉴定到种的标本共339份,隶属于4纲5目20科48属96种,并编写兴山县大型子囊菌物种名录,鉴定到属、未鉴定到种的标本有77份。发现湖北省新记录40种;食用菌有10种,药用菌10种,食药兼用菌有4种,有毒菌有3种;土生、木生和虫生物种分别有44、43和10种。物种组成分析发现,物种数量最多的属为盘菌属Peziza,盘菌属Peziza是该县优势属。对兴山大型子囊菌地理分布分析发现,兴山县大型子囊菌物种发生多集中于海拔800~1600 m、具有典型的亚热带常绿落叶阔叶混交林的区域,最具有代表性的地点是龙门河、万朝山和榛子乡等生态林地。本次研究测序了所有...
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
符号说明
第一章 文献综述
1.1 大型子囊菌与生物多样性
1.2 大型子囊菌物种多样性研究进展
1.3 大型子囊菌分子系统学研究进展
1.4 湖北省大型子囊菌研究进展
1.5 湖北省兴山县大型子囊菌生长环境
1.6 大型子囊菌的遗传多样性
1.7 本研究的目的和技术路线
第二章 兴山县大型子囊菌物种多样性
2.1 实验材料
2.2 实验设备与仪器
2.2.1 野外调查所需试剂、仪器和工具
2.2.2 实验室观察所需试剂、仪器或工具
2.3 实验方法
2.3.1 野外调查采集
2.3.2 标本处理和保存
2.3.3 分类和鉴定
2.4 实验结果
2.4.1 组成成分分析
2.4.2 湖北省新记录种
2.4.3 物种经济价值
2.4.4 受威胁程度
2.4.5 兴山县地理分布
2.4.6 营养类型
2.4.7 生长季节
2.5 讨论
第三章 兴山县大型子囊菌分子系统学研究
3.1 实验材料
3.2 实验设备与仪器
3.2.1 试剂
3.2.2 主要仪器
3.2.3 所需试剂及培养基
3.3 实验方法
3.3.1 提取基因组DNA方法
3.3.2 DNA质量检测方法
3.3.3 rDNA扩增方法
3.3.4 PCR扩增产物质量检测
3.3.5 测序质量鉴定方法
3.3.6 克隆测序方法
3.4 系统发育分析方法
3.4.1 序列拼接
3.4.2 序列比对
3.4.3 模糊比对序列处理
3.4.4 替换饱和检验
3.4.5 进化模型的选择
3.4.6 建树及软件选择方法
3.4.7 系统树编辑和修饰
3.5 遗传多样性分析方法
3.6 研究结果
3.6.1 兴山县大型子囊菌系统发育树
3.6.2 兴山县盘菌属系统发育学研究
3.6.3 甜盘菌遗传多样性研究
3.7 讨论
3.7.1 兴山县大型子囊菌系统发育树
3.7.2 兴山县盘菌属系统发育学研究
3.7.3 甜盘菌遗传多样性研究
第四章 全文总结
附图
参考文献
在读期间发表的学术论文及研究成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]西藏马鞍菌属小志[J]. 徐阿生. 菌物系统. 2002(02)
[2]广东省大型真菌概况[J]. 章卫民,李泰辉,宋斌. 生态科学. 2001(04)
[3]DNA序列在植物系统学研究中的应用[J]. 田欣,李德铢. 云南植物研究. 2002(02)
[4]木材腐朽菌在森林生态系统中的功能[J]. 魏玉莲,戴玉成. 应用生态学报. 2004(10)
[5]兴山县天保工程资源监测及实施对策探讨[J]. 陈光羽,彭洪林. 湖北林业科技. 2006(06)
[6]丛赤壳科部分属之间的系统学关系(英文)[J]. 张向民,庄文颖. 菌物学报. 2006(01)
[7]虫草及相关真菌的次生代谢产物及其活性[J]. 胡丰林,李增智. 菌物学报. 2007(04)
[8]大型真菌标本的采集与制作[J]. 谢鑫. 生物学教学. 2005(04)
[9]宜昌市野生真菌资源调查初报[J]. 谭爱华,焦海涛,刘世玲. 食用菌学报. 2006(01)
[10]湖北省后河自然保护区的多孔菌(英文)[J]. 李娟,魏玉莲,戴玉成. 菌物研究. 2007(04)
博士论文
[1]中国南方4省区圆盘菌科分类研究[D]. 任艳玲.广西大学 2014
[2]中国炭角菌科几个属的分类与分子系统学研究[D]. 马海霞.吉林农业大学 2011
硕士论文
[1]辽宁仙人洞国家级自然保护区大型真菌多样性研究[D]. 张清洋.吉林农业大学 2014
[2]海棠山国家级自然保护区大型真菌物种多样性和生态系统多样性研究[D]. 徐济责.吉林农业大学 2013
[3]湖北省大型真菌资源初步研究[D]. 徐江.华中农业大学 2012
[4]辽宁关门山国家森林公园枫叶林大型真菌多样性研究[D]. 陈俊良.吉林农业大学 2012
本文编号:3702409
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
符号说明
第一章 文献综述
1.1 大型子囊菌与生物多样性
1.2 大型子囊菌物种多样性研究进展
1.3 大型子囊菌分子系统学研究进展
1.4 湖北省大型子囊菌研究进展
1.5 湖北省兴山县大型子囊菌生长环境
1.6 大型子囊菌的遗传多样性
1.7 本研究的目的和技术路线
第二章 兴山县大型子囊菌物种多样性
2.1 实验材料
2.2 实验设备与仪器
2.2.1 野外调查所需试剂、仪器和工具
2.2.2 实验室观察所需试剂、仪器或工具
2.3 实验方法
2.3.1 野外调查采集
2.3.2 标本处理和保存
2.3.3 分类和鉴定
2.4 实验结果
2.4.1 组成成分分析
2.4.2 湖北省新记录种
2.4.3 物种经济价值
2.4.4 受威胁程度
2.4.5 兴山县地理分布
2.4.6 营养类型
2.4.7 生长季节
2.5 讨论
第三章 兴山县大型子囊菌分子系统学研究
3.1 实验材料
3.2 实验设备与仪器
3.2.1 试剂
3.2.2 主要仪器
3.2.3 所需试剂及培养基
3.3 实验方法
3.3.1 提取基因组DNA方法
3.3.2 DNA质量检测方法
3.3.3 rDNA扩增方法
3.3.4 PCR扩增产物质量检测
3.3.5 测序质量鉴定方法
3.3.6 克隆测序方法
3.4 系统发育分析方法
3.4.1 序列拼接
3.4.2 序列比对
3.4.3 模糊比对序列处理
3.4.4 替换饱和检验
3.4.5 进化模型的选择
3.4.6 建树及软件选择方法
3.4.7 系统树编辑和修饰
3.5 遗传多样性分析方法
3.6 研究结果
3.6.1 兴山县大型子囊菌系统发育树
3.6.2 兴山县盘菌属系统发育学研究
3.6.3 甜盘菌遗传多样性研究
3.7 讨论
3.7.1 兴山县大型子囊菌系统发育树
3.7.2 兴山县盘菌属系统发育学研究
3.7.3 甜盘菌遗传多样性研究
第四章 全文总结
附图
参考文献
在读期间发表的学术论文及研究成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]西藏马鞍菌属小志[J]. 徐阿生. 菌物系统. 2002(02)
[2]广东省大型真菌概况[J]. 章卫民,李泰辉,宋斌. 生态科学. 2001(04)
[3]DNA序列在植物系统学研究中的应用[J]. 田欣,李德铢. 云南植物研究. 2002(02)
[4]木材腐朽菌在森林生态系统中的功能[J]. 魏玉莲,戴玉成. 应用生态学报. 2004(10)
[5]兴山县天保工程资源监测及实施对策探讨[J]. 陈光羽,彭洪林. 湖北林业科技. 2006(06)
[6]丛赤壳科部分属之间的系统学关系(英文)[J]. 张向民,庄文颖. 菌物学报. 2006(01)
[7]虫草及相关真菌的次生代谢产物及其活性[J]. 胡丰林,李增智. 菌物学报. 2007(04)
[8]大型真菌标本的采集与制作[J]. 谢鑫. 生物学教学. 2005(04)
[9]宜昌市野生真菌资源调查初报[J]. 谭爱华,焦海涛,刘世玲. 食用菌学报. 2006(01)
[10]湖北省后河自然保护区的多孔菌(英文)[J]. 李娟,魏玉莲,戴玉成. 菌物研究. 2007(04)
博士论文
[1]中国南方4省区圆盘菌科分类研究[D]. 任艳玲.广西大学 2014
[2]中国炭角菌科几个属的分类与分子系统学研究[D]. 马海霞.吉林农业大学 2011
硕士论文
[1]辽宁仙人洞国家级自然保护区大型真菌多样性研究[D]. 张清洋.吉林农业大学 2014
[2]海棠山国家级自然保护区大型真菌物种多样性和生态系统多样性研究[D]. 徐济责.吉林农业大学 2013
[3]湖北省大型真菌资源初步研究[D]. 徐江.华中农业大学 2012
[4]辽宁关门山国家森林公园枫叶林大型真菌多样性研究[D]. 陈俊良.吉林农业大学 2012
本文编号:3702409
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3702409.html