烟草TIR-NBS基因家族的生物信息学分析

发布时间：2022-11-07 20:43

　　TIR-NBS基因是一类与植物抗病调节和生长发育密切相关的基因,其特征解析有助于对植物免疫和发育调节的认识。该研究通过生物信息学分析方法,从基因鉴定、染色体分布、基因结构、蛋白性质和结构、信号肽、亚细胞定位和顺式作用元件等方面,对烟草TIR-NBS基因家族进行了鉴定和分子特性分析。结果表明:烟草TIR-NBS基因家族含有30条成员,分布在21条染色体上,含有3～8个保守基序;编码蛋白均为不稳定蛋白,无信号肽,主要分布于细胞核、细胞质和叶绿体中,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要构成元件;进化时主要受纯化选择作用,与番茄的TIR-NBS基因亲缘关系最近;顺式作用元件分析表明其可能受光照、温度以及生长素、茉莉酸甲酯、脱落酸、水杨酸、赤霉素等激素调控。该研究结果为进一步探究TIR-NBS基因的生物学功能及提高植物产量和品质提供了依据。 

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 TIR-NBS基因家族鉴定
    1.2 染色体定位分析
    1.3 基因结构与motif分析
    1.4 蛋白结构与亚细胞定位分析
    1.5 TIR-NBS蛋白的理化性质分析
    1.6 进化选择压力分析
    1.7 系统发育分析
    1.8 顺式作用元件分析
2 结果与分析
    2.1 TIR-NBS基因家族成员
    2.2 TIR-NBS基因家族的染色体分布
    2.3 TIR-NBS基因的结构组成
    2.4 TIR-NBS蛋白结构特点、细胞位置和信号肽
    2.5 TIR-NBS蛋白的理化性质
    2.6 TIR-NBS基因的进化选择
    2.7 TIR-NBS基因家族的系统发育树
    2.8 TIR-NBS基因家族的顺式作用元件组成
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3704367