多花黄精几丁质诱导赤霉素应答基因（CIGR）克隆及其功能

发布时间：2023-05-13 04:44

　　为探讨多花黄精几丁质诱导赤霉素应答基因(chitin-inducible gibberellin-responsive,CIGR)在不同光处理下的的作用机制,采用全长验证的方法获得多花黄精CIGR基因的cDNA序列、gDNA序列,并对其进行生物信息学分析,再对CIGR蛋白进行亚细胞定位观察,同时对不同光质和光周期处理下CIGR基因的表达模式进行分析.结果显示,多花黄精CIGR基因cDNA序列和gDNA全长序列一致,完整的开放阅读框(ORF)长度为1 770 bp,共编码589个氨基酸,CIGR基因无内含子结构.生物信息学分析表明CIGR具有一个GRAS结构域,属于GRAS家族,是植物特有的转录因子,为碱性蛋白,无信号肽;Motif分析表明,CIGR蛋白在物种间比较保守,保守区主要位于中部至3′末端;氨基酸序列进化分析表明,多花黄精与石刁柏的CIGR亲缘关系最近,同源性达81%.进一步亚细胞定位显示CIGR蛋白定位于细胞核,与预测结果一致.实时荧光定量PCR(qPCR)结果显示,多花黄精CIGR基因具有器官表达特异性,在叶中表达量最高.在不同光质和光周期处理下,CIGR基因在蓝光下表达量...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 总D N A、R N A的提取及c D N A的合成
        1.2.2 CIGR基因的筛选与克隆
        1.2.3 多花黄精gDNA克隆
        1.2.4 生物信息学分析
        1.2.5 多花黄精CIGR蛋白亚细胞定位
        1.2.6 多花黄精的光质及光周期处理
        1.2.7 多花黄精CIGR基因特异表达分析
2 结果与分析
    2.1 多花黄精CIGR基因cDNA及gDNA序列的获得及结构
    2.2 CIGR蛋白基本理化性质
    2.3 CIGR聚类分析
    2.4 CIGR蛋白保守结构域
    2.5 多花黄精CIGR蛋白的亚细胞定位
    2.6 CIGR在多花黄精不同组织部位中的表达
    2.7 在不同光质和光周期处理下多花黄精CIGR的表达
3 讨论与结论
    3.1 多花黄精CIGR基因及其编码蛋白特征
    3.2 CIGR基因可能受蓝光和短光照周期调控及表达特性



本文编号：3815327