谷子TCP基因家族成员序列特征及表达模式分析

发布时间：2023-05-24 21:57

　　为深入解析谷子TCP基因家族的功能,通过生物信息学方法对谷子TCP转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明:除第8染色体之外,从谷子基因组上其余8条染色体中共鉴定出26个TCP家族成员,并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名,其中分布在第3和第5染色体上的TCP家族成员数量最多,高达5个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异,范围为95 aa～451 aa。其中SiTCP21基因编码氨基酸残基数目最少为95个氨基酸;而SiTCP15最多为451个氨基酸残基。26个TCP家族成员的蛋白结构中均含有bHLH保守结构域。基因表达分析结果表明,31%的成员在穗中的表达量明显高于其他组织,因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究Si TCPs家族基因的功能奠定了基础,也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 谷子SiTCP转录因子家族的鉴定与分类
    1.2 谷子SiTCP基因的染色体分布
    1.3 谷子与拟南芥TCP家族蛋白系统进化树分析
    1.4 谷子TCP家族基因结构分析
    1.5 谷子TCP基因在不同组织中的表达模式
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 材料
    3.2 基因序列分析
    3.3 基因家族进化分析
    3.4 基因结构分析
    3.5 基因表达模式分析
作者贡献



本文编号：3822353