北京地区豹猫种群遗传多样性及肠道菌群构成初步研究

发布时间：2023-10-11 23:41

　　猫科动物作为占据较高营养级的捕食者,在生态系统中发挥着重要功能,受到环境变化的影响较大。随着栖息地适宜性降低、野生猎物减少,一些猫科动物处于濒临灭绝的境地。豹猫(Prionailurus bengalensis)是一种在我国广泛分布的小型猫科动物,对其受到栖息地破碎化的影响、遗传分化及种群构成的研究较少。本研究通过非损伤途径,借助微卫星和线粒体控制区分子标记及高通量测序技术,对北京地区豹猫种群的遗传现状及其与赤狐(Vulpes Vulpes)的生态竞争关系进行评估。豹猫种群的遗传多样性、遗传结构及肠道菌群多样性分析的主要研究内容和结论如下。1.在松山、云蒙山、云峰山、小龙门和百花山自然保护区共收集到601份疑似豹猫的粪便样品。对样品进行DNA提取后,扩增食肉动物ATP 6区段进行物种识别,使用锌指基因进行性别鉴定,利用筛选的6对微卫星引物扩增的等位基因进行个体鉴定。共识别到112只豹猫个体,其中松山有53只(33雌、20雄),云蒙山17只(10雌、7雄),云峰山17只(14雌、3雄),小龙门13只(10雌、3雄),百花山12只(9雌、3雄)。2.6个微卫星位点共检测到31个等位基因,5...

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摘要
abstract
1.引言
    1.1.豹猫的研究现状
        1.1.1.豹猫
        1.1.2.豹猫的遗传学研究
        1.1.3.豹猫的食物构成分析
        1.1.4.豹猫的宏观生态学研究
    1.2.保护遗传学的应用
        1.2.1.种群遗传多样性及分化
        1.2.2.微卫星分子标记
        1.2.3.线粒体分子标记
    1.3.肠道菌群
        1.3.1.肠道菌群的研究方法
        1.3.2.高通量测序
        1.3.3.肠道菌群分析在动物中的应用
    1.4.本研究的目的和内容
    1.5.本研究的技术路线
2.豹猫种群的遗传多样性研究
    2.1.实验材料
        2.1.1.实验样品
        2.1.2.实验试剂与药品
        2.1.3.实验工具与仪器
    2.2.实验方法
        2.2.1.粪便样品总DNA提取
        2.2.2.DNA质量检测
        2.2.3.粪便DNA物种识别
        2.2.4.豹猫粪便DNA性别鉴定
        2.2.5.豹猫微卫星位点的筛选及扩增
        2.2.6.豹猫线粒体控制区扩增
        2.2.7.数据分析
    2.3.研究结果
        2.3.1.DNA检测
        2.3.2.粪便物种识别
        2.3.3.豹猫样品性别鉴定
        2.3.4.豹猫种群微卫星遗传多样性分析
        2.3.5.豹猫种群微卫星遗传分化分析
        2.3.6.豹猫种群线粒体控制区遗传多样性
        2.3.7.豹猫种群线粒体控制区遗传分化
    2.4.讨论
        2.4.1.北京地区豹猫种群个体识别及性别构成
        2.4.2.北京地区豹猫种群微卫星遗传多样性
        2.4.3.北京地区豹猫种群线粒体控制区遗传多样性
        2.4.4.北京地区豹猫种群遗传分化
3.豹猫肠道菌群构成分析
    3.1.实验材料
        3.1.1.实验样品
        3.1.2.实验试剂与药品
        3.1.3.实验仪器
    3.2.实验方法
        3.2.1.细菌16S r RNA扩增和Miseq测序
        3.2.2.数据分析
    3.3.研究结果
        3.3.1.16 SrRNA测序数据分析
        3.3.2.豹猫肠道微生物组成分析
        3.3.3.北京地区豹猫肠道微生物α-多样性分析
        3.3.4.北京地区豹猫肠道微生物β-多样性分析
        3.3.5.北京地区豹猫肠道微生物类群差异性分析
        3.3.6.豹猫和赤狐生态竞争关系
    3.4.讨论
        3.4.1.豹猫肠道微生物核心群
        3.4.2.不同地区豹猫种群肠道微生物多样性及差异分析
        3.4.3.豹猫和赤狐肠道微生物构成及差异
4.结论
参考文献
个人简介
导师简介
致谢



本文编号：3853021