新疆石人子沟古代人群基因组学研究

发布时间：2024-01-30 23:46

　　新疆位于中国的西北部,长期以来作为东西方联系的枢纽。自汉代(公元前207-220年)以来在新疆开辟的丝绸之路是联系中外的纽带,沟通东西方的桥梁。新疆地区的人群具有复杂的遗传历史。基于现代新疆人群的遗传学研究表明,该地区人群与欧亚大陆东部和西部人群都具有遗传联系。新疆早期人群的起源、迁徙及融合历史一直是学术界研究的热点。本论文以新疆东天山地区铁器时期石人子沟遗址发掘出的古代个体为研究对象。通过对其全基因组进行测序及遗传分析,揭示该人群的遗传组成,探讨该地区人群的起源及混合历史。我们从12个古代个体中成功获取了10个个体的全基因组数据,覆盖度为0.04x到0.75x。其中5个样本进行¹4C测年,其年代全属于铁器时代(公元前200-100年)。经性别鉴定,其中4例样本为女性,其余6例为男性。我们对这些样本的线粒体和Y染色体的单倍型类群进行了划分,得到U4、U5、H、A、D4和G3共六种线粒体单倍型类群,以及R1b和Q1a两种Y染色体单倍型类群。石人子沟古代人群在父系和母系遗传方面均存在欧亚大陆东西部谱系的混合。石人子沟人群常染色体基因组数据的遗传学分析同样表明该人群在遗...

【文章页数】：50 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.2样本颞骨岩部剖面图[44]1.3.2测序技术

[43]。颞骨岩部形状的剖面图见图1.2。

图3.2抽提后电泳检验图3.2.2DNA

PCR过程均需做空白对照，结果见图3.2。图3.2抽提后电泳检验图3.2.2古DNA建库结果用脂糖凝胶电泳对DNA目标片段进行检验，见图3.3。图3.3样本建库后电泳图用Qubit2.0进行DNA的定量测定，结果表明：本研究中的样本均符合上机

图3.5石人子沟古代个体DNA损伤模式

见图3.4和图3.5，符合古DNA序列的特征。同时片段长度呈现正态分布，平均长度均为60bp左右，也证明了样本数据的真实性。实验过程中所有步骤严格遵守古DNA实验标准，并进行重复验证，所有样本的线粒体单倍型与所接触过实验人员的线粒体单倍型对比并不相同，排除现代人的污染。mtDNA....

图3.6石人子沟个体之间亲缘关系的计算数值3.2.6线粒体和Y染色体单倍型类群划分10

10个样本进行了亲缘关系鉴定。本研究通过计算不同个体间基因组的错配概率来进行亲缘关系的判定。如图3.6所示：虚线表示给定关系（r）的预期成对错配率值。当r=1时两个样本可被认为来自同一个体，当r=0被认为两个体间没有任何关系，r=0.5为一级亲缘关系，r=0.25....

本文编号：3890573