不同季节杂色山雀肠道微生物组成及与免疫关系的研究

发布时间：2024-02-16 05:15

　　肠道微生物菌群结构是肠道微生物与宿主及环境共同进化的结果,了解鸟类肠道微生物结构,对探究鸟类生活史及健康状态具有重要意义。本研究采用高通量测序方法,分析冬季、春季、夏季三个季节杂色山雀肠道微生物结构差异并构建杂色山雀核心菌群,探究杂色山雀肠道微生物组成与个体免疫力之间的关系。主要结果如下:(1)本研究共得到杂色山雀肠道微生物1010167条有效序列,按照97%相似性对非重复序列进行OTU聚类,共得到3591个OTU的代表序列。Alpha多样性显示,不同季节间杂色山雀肠道微生物菌群多样性和丰富度无显著差异(F_2,21=1.01,P=0.38)。主坐标分析和相似性分析显示,杂色山雀冬季、春季和夏季的肠道微生物多样性无显著性差异。(2)研究共鉴定到37个门,85个纲,183个目,371个科,849个属,1574个种。在门水平上,主要由厚壁菌门(Firmicutes),变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)组成,核心菌属包括乳杆菌属(Lactobac...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图3-1三个季节OTU韦恩图

第3章研究结果14图3-1三个季节OTU韦恩图3.2.3测序深度分析绘制样品稀释曲线，如图3-2。稀释性曲线在测序量比较小时，随着测序量的增加OTU的数量显著增加，随着测序量的逐渐增大，新增OTU的数量逐渐变缓，并趋于平坦，在样品测序数据量达到30000条时，稀释曲线趋于平坦，说....

图3-224个样品的稀释性曲线

第3章研究结果14图3-1三个季节OTU韦恩图3.2.3测序深度分析绘制样品稀释曲线，如图3-2。稀释性曲线在测序量比较小时，随着测序量的增加OTU的数量显著增加，随着测序量的逐渐增大，新增OTU的数量逐渐变缓，并趋于平坦，在样品测序数据量达到30000条时，稀释曲线趋于平坦，说....

图3-324个样品的Pan/Core曲线图

第3章研究结果15随着样本量的逐渐增大，曲线趋于平缓，说明数据量已经达到所需水平。Core曲线图表明随着样本量的增大，核心OTU数目逐渐降低，当样本数量达到20时，其核心OTU数量为5，且随着样本数量的增加不再降低。图3-324个样品的Pan/Core曲线图3.3不同季节杂色山雀....

图3-4PCA分析

第3章研究结果17图3-4PCA分析3.4杂色山雀肠道微生物组成3.4.1杂色山雀肠道微生物组成分析杂色山雀肠道微生物菌群组成，共得到3591个OTU，鉴定出37个门，85个纲，183个目，371个科，849个属，1574个种。通过序列比对，冬、春、夏三个季节杂色山雀肠道微生物共....

本文编号：3900881