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常见益生菌在八大疾病队列肠菌中的潜在角色与肠道细菌库的构建

发布时间:2024-02-25 12:50
  益生菌因其具有调节肠道微生态、调节免疫、抗炎和抗肿瘤等益生功能广受消费者青睐,从而衍生出多种多样的益生菌产品,如酸奶和益生菌OTC制剂,其全球消费量巨大。尽管有些益生菌菌株已被广泛使用,但对菌株安全性,代谢能力差异,菌株之间复配的潜在互补性仍不够清楚,尤其涉及到常见益生菌在不同疾病人群肠道中的相对丰度差异及潜在角色的系统性研究甚少,研究者和生产者难以精准开发和生产益生菌产品,消费者也缺乏足够的依据去选择产品。高通量测序技术的发展促进了益生菌基因组和肠道菌群测序的普及,特别是宏基因组关联分析等方法对人类微生物群与许多非传染性疾病(如肥胖、糖尿病、肝病,神经退行性疾病甚至癌症)关系的研究,显示出肠道菌群具有成为新型益生菌来源库的巨大潜力。丰富的已公开发表的疾病队列肠道宏基因组测序数据、细菌基因组序列和先进的研究方法使得系统性地检测常见益生菌的相对丰度和相互作用关系进而评估它们在肠道微生物群落中的角色以及比较它们的安全性和功能差异性及互补性成为可能。因此,本研究在疾病队列的肠道细菌宏基因组数据和益生菌基因组数据的基础上,进行数据挖掘,同时结合肠道细菌的大规模分离培养实验和高通量单菌基因组测序...

【文章页数】:102 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

图3-3?ACVD队列病例组与对照组的reads分别对所有属于咕m沿和的菌株??的比对率??

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向的可靠性,本研究将ACVD队列的洁净数据直接分别比对到MTPS的15个菌(亚)种??的基因集上,采用非配对秩和检验方法,比较病例组与对照组reads比对率的差异。结果??如图3-2所示,ns表示病例组与对照组无显著差异,****表示病例组与对照组存在显著??(尸<0.00001....


图3-10在类风湿性关节炎病例组或对照组中显著富集的菌种的共丰度网络??--

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并将其与己发表[841的8株肠道细菌菌株的胆固醇降解能力进行初步比较。??3.2.1生长性能??由图3-11可知,嗜酸乳杆菌KLDS1.0卯1在接种后可迅速进入指数生长期,并在接种??后第20?h左右达到生长稳定期。表明接种后第20?h可作为后续胆固醇降解能力实验采集数??据的终....


图3-14?KLDS1.0901发酵液中胆固醇变化曲线??

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图3-17泛基因组指数与各个菌种内AAI?sd的相关性??

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东北农业大学工学博上学位论文??种内分离来源数呈弱正相关[相关系数(CC)?0.526,R平方0.221](图3-16)。PI与种内??AAI距离标准差呈弱正相关(AAI?sd,?CC?0.581,R平方0.287)(图3-17)。PI与种内基因??组个数呈弱正相关(CC?0.7....



本文编号:3910337

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