棉花色素腺体发育相关基因GhNAC201的克隆与表达分析

发布时间：2024-04-17 21:13

　　为了探究GhNAC201在棉花色素腺体发育中的作用,应用RT-PCR的方法克隆了有腺体棉花中棉所12中GhNAC201基因的编码区序列,并进行生物信息学分析。利用荧光定量PCR对有腺体和无腺体棉花材料不同生育时期、不同组织部位和不同激素处理下GhNAC201基因的表达情况进行分析。结果显示,GhNAC201编码区为948 bp,编码315个氨基酸。GhNAC201蛋白分子量为36.8 ku,理论pI 5.97,二级结构预测存在27.94%的α-螺旋、5.40%的β-转角、18.10%的延伸链和48.57%的无规则卷曲。三维结构预测表明,GhNAC201的26-190氨基酸与水稻胁迫应答NAC1蛋白序列高度匹配,模型维度为X:55.229?,Y:36.150?,Z:46.112?。GhNAC201在30-163氨基酸处存在1个NAM结构域,预测有5个苏氨酸、6个丝氨酸和4个酪氨酸磷酸化位点位于NAM结构域内。亚细胞定位预测GhNAC201可能位于分泌通路或除线粒体、叶绿体之外的其他亚细胞结构。不同物种中GhNAC201同源蛋白序列的相似性较高,存在5个高度保守的基序。GhNAC201与亚...

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【部分图文】：

图1GhNAC201编码区的扩增

利用RT-PCR技术克隆了中12中Gh-D06G2096的CDS序列(图1),经测序验证,与TM-1中参考序列(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)完全一致,参考Sun等[13]对陆地棉NAC基因的编号,命名为GhNAC201(GenBank登录号:MN2....

图2GhNAC201蛋白三维结构预测

图1GhNAC201编码区的扩增图3GhNAC201磷酸化位点预测

图3GhNAC201磷酸化位点预测

图2GhNAC201蛋白三维结构预测表2GhNAC201亚细胞定位预测Tab.2PredictionofsubcellularlocationofGhNAC201序列名称Sequencename长度Length叶绿体Chloroplast线粒体Mitoc....

图4GhNAC201同源蛋白的进化(A)及保守基序(B)分析

GhNAC201在有腺体棉各个组织的表达均极显著高于无腺体棉,且有腺体棉的种子、苗期根、苗期茎、苗期叶和花后26d幼胚中GhNAC201丰度较高。2个无腺体棉材料中,GhNAC201仅在苗期根中表达量较高,在其他组织部位不表达或表达量很低(图5-A)。在有腺体棉中12中,GhN....

本文编号：3956933