异质环境对弯孢节丛孢群体分化及有性生殖的影响

发布时间：2024-09-17 15:12

　　有性生殖的维持和进化一直受到生物学家的关注,目前关于异质环境促进有性生殖进化的少量证据都是在实验室人工模拟的结果,因时间跨度不够长和环境成分简单而受到质疑。滇池是云南有名的淡水湖泊,该湖泊不仅受到严重的氮磷污染,同时重金属含量也高于云南省土壤背景值,是天然的异质环境。弯孢节丛孢Arthrobotrys musiformis属于子囊菌门Ascomycota圆盘菌科Orbiliaceae,圆盘菌属Orbilia的无性态,广泛分布于各种生境中,既能进行有性生殖,也能进行无性繁殖,是研究生境对真菌有性生殖影响的良好材料。本研究选取从滇池底泥(简称为DC)、滇池旁的西山农田土壤(XS)、圆盘菌属子囊孢子(S)分离的三个A.musiformis 群体为研究材料,从线粒体基因组多样性的角度揭示异质环境对A.musiformi 的遗传分化及有性生殖的影响。主要研究结果如下:1.A.musiforis 的系统发育分析联合ITS,RPB2和TEF三个片段,对48个A.musiformis 菌株进行系统学分析的结果显示,所有该种菌株都聚成一支,和同属的外群少孢节丛孢A.oligospora差异明显,证明所选菌...

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1.1 线粒体在群体遗传中学中的应用
        1.1.1 真菌线粒体基因组的研究概况
        1.1.2 线粒体DNA作为生物多样性标记原因
        1.1.3 真菌线粒体基因组的遗传多态性和进化速率
            1.1.3.1 基于RFLP标记的研究
            1.1.3.2 基于多位点序列的研究
            1.1.3.3 基于完整的线粒体基因组序列分析的研究
    1.2 捕食线虫真菌群体遗传学研究进展
    1.3 异质环境对真菌基因组多样性的影响
    1.4 真菌的交配型基因
    1.5 真菌有性生殖和异质环境的联系
    1.6 本研究的主要目标
第二章 实验材料与方法
    2.1 实验菌株
    2.2 实验材料
        2.2.1 实验试剂
        2.2.2 实验器材
        2.2.3 培养基
    2.3 试验方法
        2.3.1 实验菌株DNA的提取
        2.3.2 目的片段的扩增
            2.3.2.1 扩增引物
            2.3.2.2 扩增体系
            2.3.2.3 扩增程序
        2.3.3 数据分析
            2.3.3.1 PCR产物的检测及测序
            2.3.3.2 序列的拼接、比对
            2.3.3.3 系统发育分析
        2.3.4 MAT基因的获取
            2.3.4.1 数据获取
            2.3.4.2 数据组装及分析
        2.3.5 线粒体基因组的获取
            2.3.5.1 线粒体基因组的测序
            2.3.5.2 线粒体基因组序列拼接
            2.3.5.3 线粒体基因组注释
            2.3.5.4 线粒体基因组的提交
            2.3.5.5 线粒体基因组的分析
            2.3.5.6 基于线粒体基因组的系统发育分析
第三章 结果与分析
    3.1 多基因联合确定种
        3.1.1 三个基因的获得片段统计
        3.1.2 系统发育分析
        3.1.3 讨论
    3.2 交配型基因分析
        3.2.1 讨论
    3.3 弯孢节丛孢(A. musiformis)线粒体基因组结构
        3.3.1 A.musiformis YMF 1.01900 S
        3.3.2 A.musiformis YMF 1.03721 DC
        3.3.3 A.musiformis YMF 1.03753 XS
    3.4 三株A.musiformis线粒体基因组对比分析及讨论
        3.4.1 基于线粒体基因组的系统发育分析
        3.4.2 三株弯孢节丛孢线粒体基因组总览
            3.4.2.1 NADH1多位点核苷酸突变验证
            3.4.2.2 NADH5及NADH6内含子存在/缺失验证
        3.4.3 相对同义密码子使用对比(RSCU)
        3.4.4 线粒体基因组比对的可视化分析
        3.4.5 讨论
第四章 全文总结
参考文献
硕士学位期间完成的科研成果
致谢



本文编号：4005636