三株原核微生物新属种的多相分类及不同营养因子对微生物新物种分离的影响

发布时间：2020-01-16 22:36

【摘要】：本论文共包括两部分研究内容,第一部分对本实验室分离自菊三七属植物的菌株HBUM179779T、HBUM179663T和分离自污泥的菌株3-BNT进行多相分类研究;第二部分通过在VL55基础培养基中添加6种不同的营养因子,利用常规稀释和大量稀释对土壤中的微生物新物种进行分离。获得以下成果:菌株HBUM179779T属于噬几丁质菌科(Chitinophagaceae)的一个新属,革兰氏阴性,细胞呈短杆状,具有周生鞭毛,大小为0.2-0.4μm×1.4-1.6μm。根据16S rRNA基因序列同源性比对,菌株HBUM179779T与根际假黄杆菌(Pseudoflavitalea rhizosphaerae)T16R-265T的亲缘关系最近,序列相似性为94.46%。基因组DNA(G+C)mol%含量为47.1%。甲基萘醌种类为MK-7。主要脂肪酸类型为iso-C15:1 G、iso-C15:0和iso-C17:0 3-OH。主要磷酸类脂有PE和两个未鉴定脂类。菌株HBUM179663T属于草药菌属(Herbiconiux)的一个新种,革兰氏阳性,细胞呈短杆状,无芽胞,无鞭毛,无运动性,大小为0.4-0.5μm×1.4-1.6μm。根据16S rRNA基因序列同源性比对,菌株HBUM179663T与马铃薯草药菌(Herbiconiux Solani)K134/01T的亲缘关系最近,序列相似性为96.65%。基因组DNA(G+C)mol%含量为75.7%。甲基萘醌种类为MK-11。主要脂肪酸是anteiso-C15:0、anteiso-C17:0和C16:0。主要磷酸类脂有PLS、PME、PE和DPG。菌株3-BNT属于伯克氏菌科(Burkholderiaceae)的一个新属,革兰氏阴性,细胞呈杆状,无芽孢,单端生鞭毛,大小为0.4-0.6μm×1.8-2.1μm。根据16S rRNA基因序列同源性比对,菌株3-BNT与乌汶伯克霍尔德氏菌(Burkholderia ubonensis)CIP 107078T的亲缘关系最近,序列相似性为92.83%。基因组DNA(G+C)mol%含量为42.4%。泛醌种类为UQ5、UQ6和UQ8。主要脂肪酸是C16:0、C18:1ω7c和cyclo C17:0。主要磷酸类脂有DPG、PE和PG。本实验通过在VL55培养基中添加6种不同的营养因子,利用常规稀释和大量稀释对采自河北、青海和云南三个地区的3份土壤样品进行微生物新物种的分离,共分离得到415株纯培养物。河北土样通过常规稀释分离得到的72株菌归属于14个属,大量稀释分离得到的52株菌归属于22个属;青海土样通过常规稀释分离得到的37株菌归属于9个属,大量稀释分离得到的50株菌归属于17个属;云南土样通过常规稀释分离得到的71株菌归属于23个属,通过大量稀释法分离得到的133株菌归属于15个属。其中,菌株HBUM200206是通过大量稀释从青海土样中分离得到的一株菌,与运动东菌(Dongia mobilis)LM22T的亲缘关系最近,序列相似性为94.58%,因此菌株HBUM200206可能是红螺菌科(Rhodospirillaceae)的一个潜在新属。菌株HBUM200161、HBUM200202、HBUM200239、HBUM200240、HBUM200352、HBUM200424、HBUM200427、HBUM200448、HBUM200452、HBUM200488、HBUM200497和HBUM200503与亲缘关系最近的模式菌株的16S rRNA基因序列相似性均小于98.65%,可能为潜在的新种。
【图文】：

磷酸类,薄板层析,样点

图 2.1 磷酸类脂双向薄板层析ig 2.1 Two way TLC of the phosph两个展层缸中，使缸内气体层至顶边 1.5cm 取板，展层风机逐行吹干 10-20min。再图 2.1 所示的 2 方向上行，，试剂薄雾喷洒，于 110℃烤至PME，与 GluNu 的磷酸类脂相或扫描。然后继续在 1401

系统发育树,菌株,多相分类,新属种

第 2 章三株原核微生物新属种的多相分类seudoflavitalea rhizosphaerae）T16R-265T亲缘关系最近，序列相似6%；菌株 HBUM179663T与马铃薯草药菌（Herbiconiux Solani）K134/系最近，序列相似性为 96.65%；菌株 3-BNT与乌汶伯克霍尔德urkholderia ubonensis）CIP 107078T序列相似性最近，序列相似性为 92 BioEdit 和 Mega5.0 软件构建的三株供试菌的 N-J 系统发育树，如图 2.4 所示。
【学位授予单位】：河北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：Q93

【参考文献】