基于网络药理学的桃仁-红花联合叶酸抗冠状动脉粥样硬化作用机制的研究及其临床靶基因预测
发布时间：2021-03-29 10:15
目的动脉粥样硬化是血管病变的常见病理变化,发生部位、涉及系统都较多,可见心脑血管、颈部血管、下肢血管、肾脏血管等,而以冠状动脉粥样硬化为全民健康负担最重,患病率基数较高,病死率最高。心脏支架微创手术技术发展日趋完善,冠状动脉粥样硬化所致的急性心肌梗死治愈率较前明显提高,但仍有许多并发症待解决,从二级预防角度上延缓和防治冠状动脉粥样硬化,仍有进一步探索的意义。近年来中药与西药联用治疗冠状动脉粥样硬化的效果被证实较单一用药效果好,中药药对桃仁、红花是活血化瘀、行气止痛的要药,常用于冠状动脉粥样硬化的防治处方中,西药叶酸也是冠状动脉粥样硬化防治指南中的重要辅助用药。本课题拟从生物信息学角度通过基因表达谱分析冠状动脉粥样硬化风险预测靶点,从网络药理学的角度探索两者联用防治冠状动脉粥样硬化的作用靶点、作用通路,有助于进一步了解其具体分子机制。方法1.生物信息学靶基因预测在本研究中,我们从基因表达综合（GEO）数据库中获得了GSE90074的基因芯片数据。首先,通过病变组与正常组的比值分析并筛选差异表达基因（DEGs）,并且根据基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）进行功能聚类分...
【文章来源】：湖北中医药大学湖北省
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
火山图与热图
基于网络药理学的桃仁-红花联合叶酸抗冠状动脉粥样硬化作用机制的研究及其临床靶基因预测31图7叶酸的分子结构3.2叶酸与桃仁-红花药对有效活性成分的靶点叶酸对应人的有效靶点为63个基因，桃仁、红花有效活性成分对应的靶点基因分别为20个、103个。将三者的有效靶点利用R语言进行合并去重，得到166个靶点基因。3.3抗冠状动脉粥样硬化潜在靶点预测在GeneCards中以“冠状动脉粥样硬化”为关键词检索，得到相关基因2890个。在OMIM中检索“冠状动脉粥样硬化”可得到相关基因8个，然后利用R语言对两个数据库的疾病靶点进行合并去重，得到冠状动脉粥样硬化疾病相关靶点共2891个。利用R语言将冠状动脉粥样硬化疾病相关靶点与叶酸、桃仁、红花药物作用靶点取交集，得到预测叶酸联合桃仁、红花药物抗冠状动脉粥样硬化潜在靶点95个，如图8所示。Disease2796Drug7195图8桃仁、红花、叶酸药物靶点基因与冠状动脉粥样硬化疾病靶点基因的韦恩图注：红色表示药物靶点，青绿色表示疾病靶点。
湖北中医药大学2020届硕士学位论文323.4药物调控网络的构建利用STRING数据库构建叶酸、桃仁、红花药物作用靶点蛋白质相互作用，有166个节点，1215条连接边线，平均节点度为14.6，平均局部聚类系数为0.511，期望边数为525条，PPI富集p值小于1.0e-16。将STRING数据库构建的蛋白质相互作用文件输入到Cytoscape中构建药物调控网络，展现叶酸、桃仁、红花药物的靶基因与靶基因间相互作用网络关系，以及叶酸、桃仁、红花药物分别与靶基因的药效团关系，如图9所示。将预测叶酸联合桃仁、红花药物抗冠状动脉粥样硬化95个潜在靶点，输入到STRING数据库，构建蛋白质相互作用网络关系，有95个节点，955条连接边线，平均节点度为20.1，平均局部聚类系数为0.625，期望边数为296条，PPI富集p值小于1.0e-16，如图10所示。图9桃仁、红花、叶酸药物调控网络注：红线表示药物与靶点之间的关系，蓝线表示药物靶点与靶点之间的关系。
【参考文献】：
期刊论文
[1]冠状动脉粥样硬化性心脏病与缺血性脑卒中相关性研究进展[J]. 李清,杜祥颖. 中国动脉硬化杂志. 2019(10)
[2]平性药桃仁在寒、热不同血瘀证下入血成分差异研究[J]. 陈瑾,冯旭,宋舸,李扬,邓家刚,郝二伟. 时珍国医国药. 2019(09)
[3]红花黄色素注射液辅助治疗冠心病心绞痛的效果及对患者血液流变学的影响[J]. 房楷源,康建琴,丁志松,房耿浩. 慢性病学杂志. 2019(07)
[4]羟基红花黄色素A改善缺血性脑卒中机制的研究进展[J]. 马嘉翼,褚松龄. 中国现代应用药学. 2019(08)
[5]原发性高血压患者动态动脉硬化指数与颈动脉粥样硬化及早期肾损害的相关性研究[J]. 冯晓娟,杨香花,张晓玲,刘丽丽,温树彬. 现代生物医学进展. 2019(07)
[6]阮士怡从“脉中积”理论治疗冠心病冠状动脉粥样硬化经验[J]. 方子寒,张琴,谢盈彧,张军平. 中医杂志. 2018(21)
[7]红花黄色素类化合物的药代动力学研究进展[J]. 黄明丽,宋慧鹏,庞汉青,高雯,闻晓东. 药学与临床研究. 2018(04)
[8]桃仁中脂肪酸、氨基酸含量分析[J]. 黄丽萍,尹蓉,张倩茹,杨萍,杜海燕. 农学学报. 2017(11)
[9]王焕禄辨治冠状动脉粥样硬化性心脏病学术经验总结[J]. 匡武. 环球中医药. 2016(12)
[10]从气虚血瘀论治冠状动脉粥样硬化性心脏病[J]. 张世亮,陈蕾,刘妹芹. 中西医结合心血管病电子杂志. 2016(24)
本文编号：3107388
【文章来源】：湖北中医药大学湖北省
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
火山图与热图
基于网络药理学的桃仁-红花联合叶酸抗冠状动脉粥样硬化作用机制的研究及其临床靶基因预测31图7叶酸的分子结构3.2叶酸与桃仁-红花药对有效活性成分的靶点叶酸对应人的有效靶点为63个基因，桃仁、红花有效活性成分对应的靶点基因分别为20个、103个。将三者的有效靶点利用R语言进行合并去重，得到166个靶点基因。3.3抗冠状动脉粥样硬化潜在靶点预测在GeneCards中以“冠状动脉粥样硬化”为关键词检索，得到相关基因2890个。在OMIM中检索“冠状动脉粥样硬化”可得到相关基因8个，然后利用R语言对两个数据库的疾病靶点进行合并去重，得到冠状动脉粥样硬化疾病相关靶点共2891个。利用R语言将冠状动脉粥样硬化疾病相关靶点与叶酸、桃仁、红花药物作用靶点取交集，得到预测叶酸联合桃仁、红花药物抗冠状动脉粥样硬化潜在靶点95个，如图8所示。Disease2796Drug7195图8桃仁、红花、叶酸药物靶点基因与冠状动脉粥样硬化疾病靶点基因的韦恩图注：红色表示药物靶点，青绿色表示疾病靶点。
湖北中医药大学2020届硕士学位论文323.4药物调控网络的构建利用STRING数据库构建叶酸、桃仁、红花药物作用靶点蛋白质相互作用，有166个节点，1215条连接边线，平均节点度为14.6，平均局部聚类系数为0.511，期望边数为525条，PPI富集p值小于1.0e-16。将STRING数据库构建的蛋白质相互作用文件输入到Cytoscape中构建药物调控网络，展现叶酸、桃仁、红花药物的靶基因与靶基因间相互作用网络关系，以及叶酸、桃仁、红花药物分别与靶基因的药效团关系，如图9所示。将预测叶酸联合桃仁、红花药物抗冠状动脉粥样硬化95个潜在靶点，输入到STRING数据库，构建蛋白质相互作用网络关系，有95个节点，955条连接边线，平均节点度为20.1，平均局部聚类系数为0.625，期望边数为296条，PPI富集p值小于1.0e-16，如图10所示。图9桃仁、红花、叶酸药物调控网络注：红线表示药物与靶点之间的关系，蓝线表示药物靶点与靶点之间的关系。
【参考文献】：
期刊论文
[1]冠状动脉粥样硬化性心脏病与缺血性脑卒中相关性研究进展[J]. 李清,杜祥颖. 中国动脉硬化杂志. 2019(10)
[2]平性药桃仁在寒、热不同血瘀证下入血成分差异研究[J]. 陈瑾,冯旭,宋舸,李扬,邓家刚,郝二伟. 时珍国医国药. 2019(09)
[3]红花黄色素注射液辅助治疗冠心病心绞痛的效果及对患者血液流变学的影响[J]. 房楷源,康建琴,丁志松,房耿浩. 慢性病学杂志. 2019(07)
[4]羟基红花黄色素A改善缺血性脑卒中机制的研究进展[J]. 马嘉翼,褚松龄. 中国现代应用药学. 2019(08)
[5]原发性高血压患者动态动脉硬化指数与颈动脉粥样硬化及早期肾损害的相关性研究[J]. 冯晓娟,杨香花,张晓玲,刘丽丽,温树彬. 现代生物医学进展. 2019(07)
[6]阮士怡从“脉中积”理论治疗冠心病冠状动脉粥样硬化经验[J]. 方子寒,张琴,谢盈彧,张军平. 中医杂志. 2018(21)
[7]红花黄色素类化合物的药代动力学研究进展[J]. 黄明丽,宋慧鹏,庞汉青,高雯,闻晓东. 药学与临床研究. 2018(04)
[8]桃仁中脂肪酸、氨基酸含量分析[J]. 黄丽萍,尹蓉,张倩茹,杨萍,杜海燕. 农学学报. 2017(11)
[9]王焕禄辨治冠状动脉粥样硬化性心脏病学术经验总结[J]. 匡武. 环球中医药. 2016(12)
[10]从气虚血瘀论治冠状动脉粥样硬化性心脏病[J]. 张世亮,陈蕾,刘妹芹. 中西医结合心血管病电子杂志. 2016(24)
本文编号：3107388
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