人肠癌细胞外泌体磷酸化蛋白质组中新磷酸化位点的发现

发布时间：2017-12-25 06:02

  本文关键词：人肠癌细胞外泌体磷酸化蛋白质组中新磷酸化位点的发现　出处：《暨南大学》2017年博士论文　论文类型：学位论文

  更多相关文章： 外泌体 磷酸化蛋白质组 新磷酸化位点 以染色体为中心的人类蛋白质组计划 信号通路

【摘要】：全面了解蛋白质的翻译后修饰是以染色体为中心的人类蛋白质组计划(ChromosomeCentric Human Proteome Project,C-HPP)的主要目标之一。已知外泌体(exosome)可携带磷酸化蛋白质,并在肿瘤微环境中扮演重要角色。但由于大量外泌体提纯、微量磷酸化肽段富集等难题,尚未见外泌体磷酸化蛋白质组的报道。我们认为外泌体中可能存在人类新的磷酸化蛋白质形式。本研究中,我们实现了高纯度SW620外泌体的大量提取,优化了微量磷酸化蛋白质组的质谱分析。我们整合了磷酸化位点数据库dbPTM、PhosphoSitePlus?和SubPhosDB,得到包含42,143个蛋白质(及其变体)和184,804个磷酸化位点的多磷酸化蛋白质数据库。以该数据库为参照,经严格的数据质控,共鉴定到高可信度的313个SW620外泌体磷酸化蛋白质及其上的924个磷酸化位点,其中202个为新磷酸化位点。我们发现外泌体磷酸化蛋白质显著富集于11号染色体,与细胞磷酸化蛋白质具显著不同的染色体分布特征。另外,SW620外泌体的酪氨酸(Y)-磷酸化位点占6.4%,高于细胞组分10倍以上;进而,我们以HCT116细胞为验证,得到相同趋势。通路分析表明,外泌体Y-磷酸化蛋白质不仅显著调控外泌体的生命周期,并可显著调控ephrin通路引导的细胞骨架重塑及细胞紧密连接。综上,本研究报道了首个高覆盖度的人细胞外泌体磷酸化蛋白质组,提供符合C-HPP标准的高可信的新磷酸化位点和蛋白质磷酸化形式。本研究证明了外泌体是重要的磷酸化信号转运者,并可携带人类新磷酸化蛋白质。
【学位授予单位】：暨南大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R3416

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 段春燕;皮爽;何涛;景莉;郑小莉;;急性淋巴细胞白血病白细胞磷酸化蛋白质分析方法的建立[J];泸州医学院学报;2008年03期

2 张丽君,刘银坤,朱运松;磷酸化蛋白质的检测技术进展[J];国外医学.临床生物化学与检验学分册;2005年05期

3 黎永明,陈腾祥,杨丽萍,刘亚伟,姜勇;小鼠肝脏磷酸化蛋白质组的二维液相色谱分离[J];第一军医大学学报;2005年09期

4 吴海燕;唐圣松;;酸性核糖体磷酸化蛋白P(0-2)的研究进展[J];南华大学学报(医学版);2006年05期

5 段春燕;何涛;王松;郑小莉;景莉;;急性淋巴细胞白血病白细胞磷酸化蛋白质分析方法的建立及初步分析[J];中国组织工程研究与临床康复;2007年07期

6 赵丽艳;刘金凤;蔡芸;钱小红;马守栋;程艳芹;纪松岗;李明春;;一种磷酸化蛋白质组定性定量分析方法的考察[J];热带医学杂志;2012年12期

7 夏高晓;李红梅;陈丽;赵明哲;胡水旺;王继刚;孙明晶;邓鹏;刘靖华;姜勇;;小鼠肝细胞核磷酸化蛋白质组的提取和双向电泳分离[J];热带医学杂志;2009年05期

8 黎永明;陈腾祥;杨丽萍;刘亚伟;姜勇;;小鼠肝脏磷酸化蛋白质组的二维液相色谱分离(英文)[J];解放军医学杂志;2005年12期

9 王会信,Jose,Sy;酵母细胞分裂周期突变株中磷酸化蛋白的变化[J];生物化学杂志;1988年03期

10 高辉;张悦;肖志坚;;核仁磷酸化蛋白基因与血液系统恶性肿瘤[J];白血病.淋巴瘤;2007年02期

相关会议论文 前10条

1 黄方可;贺煜;郭林;;固相磷酸螯合金属亲和色谱富集磷酸化肽段方法的优化[A];湖北省暨武汉市生物化学与分子生物学学会第八届第十七次学术年会论文汇编[C];2007年

2 任思琳;杨明坤;张峰;陈卓;张珈;李斯捧;葛峰;汪世华;;黄曲霉的磷酸化蛋白组学分析[A];中国菌物学会第六届会员代表大会（2014年学术年会）暨贵州省食用菌产业发展高峰论坛会议摘要[C];2014年

3 张锴;何锡文;;质谱技术鉴定激酶中非磷酸化蛋白修饰[A];第十届中国化学会分析化学年会暨第十届全国原子光谱学术会议论文摘要集[C];2009年

4 王京兰;郭立海;张养军;蔡耘;钱小红;;人胎肝细胞膜提取蛋白质的磷酸化蛋白质组分析[A];中国蛋白质组学第二届学术大会论文摘要论文集[C];2004年

5 宁德利;刘科辉;刘昌财;沈卓;王柏臣;;玉米黄化苗复绿过程中磷酸化蛋白质组的研究[A];2012年全国玉米遗传育种学术研讨会暨新品种展示观摩会论文及摘要集[C];2012年

6 刘亚伟;戴兵;梅长林;张岩;熊锡山;;常染色体显性多囊肾病患者与正常成人肾组织磷酸化蛋白质的比较蛋白质组学研究[A];2007年浙沪两地肾脏病学术年会资料汇编[C];2007年

7 刘亚伟;戴兵;梅长林;张岩;熊锡山;;常染色体显性多囊肾病患者与正常成人肾组织磷酸化蛋白质的比较蛋白质组学研究[A];中华医学会肾脏病学分会2006年学术年会论文集[C];2006年

8 王蔚;刘芸;康瑞霞;陈丽;夏高晓;邓鹏;姜勇;;细胞氧化应激过程中MK2调控磷酸化蛋白的鉴定[A];中国病理生理学会受体、肿瘤和免疫专业委员会联合学术会议论文汇编[C];2010年

9 李祺福;石松林;王三英;孔海燕;路锟;;核仁磷酸化蛋白NPM在肿瘤细胞增殖分化过程中的表达与调控作用研究[A];“细胞活动 生命活力”——中国细胞生物学学会全体会员代表大会暨第十二次学术大会论文摘要集[C];2011年

10 章晓鹏;肖志强;李萃;李建玲;余艳辉;欧阳咏梅;冯雪萍;张鹏飞;陈主初;;分析喉癌相关基因(LCRG1)抑瘤作用相关的磷酸化蛋白质[A];中国蛋白质组学第三届学术大会论文摘要[C];2005年

相关博士学位论文 前9条

1 郭嘉慧;人肠癌细胞外泌体磷酸化蛋白质组中新磷酸化位点的发现[D];暨南大学;2017年

2 Haitham Mahmoud Boraei Ramadan;哺育蜂和采集蜂大脑磷酸化蛋白质组研究[D];中国农业科学院;2014年

3 胡苗清;游仆虫酸性核糖体磷酸化蛋白的性质研究[D];山西大学;2014年

4 沈伟;毕赤酵母醇氧化酶启动子调控相关激酶的研究与应用[D];华东理工大学;2017年

5 王京兰;磷酸化蛋白质分析方法研究及其在人胎肝磷酸化蛋白质组研究中的应用[D];中国人民解放军军事医学科学院;2004年

6 王辉清;前列腺癌非激素依赖转化中磷酸化蛋白差异及其作用途径研究[D];第二军医大学;2009年

7 隋少卉;磷酸化蛋白质组学定性与定量分析技术的研究及在肝细胞磷酸化蛋白质组学中的应用[D];中国人民解放军军事医学科学院;2007年

8 程涵;植物磷酸化蛋白质组的生物信息学分析[D];华中科技大学;2015年

9 梅国强;CPI和GP73的结构与功能研究[D];中国科学技术大学;2013年

相关硕士学位论文 前10条

1 吴建华;胍基修饰磁性材料对磷酸蛋白富集[D];天津科技大学;2013年

2 亓玉萍;蜂王浆高产蜜蜂和意大利蜜蜂血淋巴蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析[D];中国农业科学院;2016年

3 王紫s，

本文编号：1331619