乳腺包裹性乳头状癌临床病理和分子病理特征及发病机制探讨
发布时间：2021-04-01 15:45
背景:乳腺包裹性乳头状癌（Encapsulated papillary carcinoma,EPC）是乳腺癌中一种少见的肿瘤亚型,占乳腺癌的0.2-0.5%,常见于绝经后期的老年女性。绝大多数EPC为中低级别病例,中低级别EPC具有独特的临床病理特点,远处转移和复发的报道较少具有较好的预后。肌上皮免疫组化染色证实EPC与浸润癌更为类似,目前将中低级别EPC认为是一种介于原位癌与浸润癌之间的癌症类型。近年来高级别EPC逐渐被病理学家所认识,单纯性高级别EPC可能出现远处转移并且引起患者死亡,其临床病理特征较中低级别恶性程度更高且预后不良,但是高级别EPC与中低级别EPC临床病理特征具体差异仍不清楚,且中国人群EPC研究很少。此外,为了比较EPC与原位癌和浸润癌在分子特征上的差异,研究人员通过拷贝数变异分析和基因组变异分析的方法,最终获得的结果并不一致。目前EPC的分子遗传特征和发病机制目前仍知之甚少。第一部分:乳腺高级别EPC与中低级别EPC间临床病理特征差异的比较实验目的:乳腺高级别EPC与中低级别EPC间临床病理特征差异的比较,为诊断和认识高级别EPC提供更多信息,同时结合己有文献报...
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１文库构建流程图??
图２配对检测流程??测序??合格，根据文库的有效浓度及数据产出需求进行Ｉｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ?Ｐ双端测序是将每条插入片段的两端进行测序的方法，由于插入片
对比对到参考基因组上的有效数据进行覆盖度的统计。通常，人类样本的测??序ｒｅａｄ能达到９５％以上的比对率，测序深度在１０Ｘ以上ｒｅａｄ覆盖的位点检测出??的ＳＮＰ比较可信。具体流程见下图３。??（？序原箱）?Ｓ本铺分析Ａ??，＾?（?ＲＥＢＳ刺Ｔ）??＃牐茫欤澹幔睿牐洌幔簦幔牐剩崳??］?［?????（?Ｎｏｒｍａ味本?（?参■考序列比？ｄ分ｉ?Ｘ?Ｔｕｍｏｒ／Ｎｏｒｍａｌ＾ｙｊ＾＾?）??Ｉ?”??＾?Ｇｅｒｍｌｉｎｅ?ＳＮＰ／ＩｎＤｅｌ?）?丨■?■???１??（?Ｓｏｍａｔｉｃ?ＳＮＶ?）?＾?Ｓｏｍａｔｉｃ?ＩｎＤｅｌ?）??１?１??ｕ?”??（（高销突変／通路ｇｇ分析＂＊）??（ＮｏｖｏＤｎｖｅｒ己知驱动昼因碎０??（ＭＲＴ高铱突变基因泪关性分ｔｆＴ）??（?财５刚颂?）??分布情况分析?）??（ＮｏｖｏＤｒｕｇｇ?向用纷财ｊ?—＾??ＳＪＳｍ？＾ｔｆＴＰｒｏ?（?ＮｏｖｏＤＲ祕突挪＆?）??图３分析流程图??３．６主亚克隆分析及基因功能ＧＯ富集??在得到上述体系突变后，然后又利用肿瘤细胞比例（Ｃａｎｃｅｒ?Ｃｅｌｌ?Ｆｒｅｃａｔｉｏｎ，?ＣＣＦ），??ＣＣＦ是突变的特性，是指携带这个突变的肿瘤细胞占所有肿瘤细胞的比例。然后??对所得到的突变基因进行克隆分析，主要原理是：在肿瘤突变时间点上，我们对体??细胞的单核苷酸位点变异建立集合，构建模型，找出突变的源头Ｔ０，第一次克隆??扩增Ｔ１和子克隆扩增Ｔ２和Ｔ３。具体示意图如下图４。克隆分析是根据ＣＣＦ值??对突变进行聚类
【参考文献】：
期刊论文
[1]Incidence and mortality of stomach cancer in China,2014[J]. Lei Yang,Rongshou Zheng,Ning Wang,Yannan Yuan,Shuo Liu,Huichao Li,Siwei Zhang,Hongmei Zeng,Wanqing Chen. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(03)
本文编号：3113585
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：128 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１文库构建流程图??
图２配对检测流程??测序??合格，根据文库的有效浓度及数据产出需求进行Ｉｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ?Ｐ双端测序是将每条插入片段的两端进行测序的方法，由于插入片
对比对到参考基因组上的有效数据进行覆盖度的统计。通常，人类样本的测??序ｒｅａｄ能达到９５％以上的比对率，测序深度在１０Ｘ以上ｒｅａｄ覆盖的位点检测出??的ＳＮＰ比较可信。具体流程见下图３。??（？序原箱）?Ｓ本铺分析Ａ??，＾?（?ＲＥＢＳ刺Ｔ）??＃牐茫欤澹幔睿牐洌幔簦幔牐剩崳??］?［?????（?Ｎｏｒｍａ味本?（?参■考序列比？ｄ分ｉ?Ｘ?Ｔｕｍｏｒ／Ｎｏｒｍａｌ＾ｙｊ＾＾?）??Ｉ?”??＾?Ｇｅｒｍｌｉｎｅ?ＳＮＰ／ＩｎＤｅｌ?）?丨■?■???１??（?Ｓｏｍａｔｉｃ?ＳＮＶ?）?＾?Ｓｏｍａｔｉｃ?ＩｎＤｅｌ?）??１?１??ｕ?”??（（高销突変／通路ｇｇ分析＂＊）??（ＮｏｖｏＤｎｖｅｒ己知驱动昼因碎０??（ＭＲＴ高铱突变基因泪关性分ｔｆＴ）??（?财５刚颂?）??分布情况分析?）??（ＮｏｖｏＤｒｕｇｇ?向用纷财ｊ?—＾??ＳＪＳｍ？＾ｔｆＴＰｒｏ?（?ＮｏｖｏＤＲ祕突挪＆?）??图３分析流程图??３．６主亚克隆分析及基因功能ＧＯ富集??在得到上述体系突变后，然后又利用肿瘤细胞比例（Ｃａｎｃｅｒ?Ｃｅｌｌ?Ｆｒｅｃａｔｉｏｎ，?ＣＣＦ），??ＣＣＦ是突变的特性，是指携带这个突变的肿瘤细胞占所有肿瘤细胞的比例。然后??对所得到的突变基因进行克隆分析，主要原理是：在肿瘤突变时间点上，我们对体??细胞的单核苷酸位点变异建立集合，构建模型，找出突变的源头Ｔ０，第一次克隆??扩增Ｔ１和子克隆扩增Ｔ２和Ｔ３。具体示意图如下图４。克隆分析是根据ＣＣＦ值??对突变进行聚类
【参考文献】：
期刊论文
[1]Incidence and mortality of stomach cancer in China,2014[J]. Lei Yang,Rongshou Zheng,Ning Wang,Yannan Yuan,Shuo Liu,Huichao Li,Siwei Zhang,Hongmei Zeng,Wanqing Chen. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(03)
本文编号：3113585
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