基于化学信息学和代谢组学的中药抗代谢综合征药效有机成分及作用机制研究
发布时间：2021-05-27 07:54
代谢综合征（MetS）是以中心性肥胖、胰岛素抵抗、血脂异常、高血压等多重心血管危险因素聚集的复杂病理状态,主要临床后果为心脑血管疾病和2型糖尿病,已被全球认同为一个影响人类健康的重大卫生问题。目前认为,胰岛素抵抗是MetS的共同病理生理基础,中心性肥胖是导致胰岛素抵抗的重要因素,但其确切发病机制尚不清楚,当前仍然没有特异性治疗MetS的方法。中药具有多有机化合物、多作用通路和多靶标协同作用等特点,在防治复杂疾病方面具有独特的优势,有望成为防治MetS的重要策略。经典名方温胆汤（WDD）临床应用于多系统复杂性疾病,比如神经系统疾病、消化道疾病、高血压、糖尿病、肥胖等MetS相关疾病,其临床疗效显著。但是,目前WDD抗MetS药效有机成分及作用机制尚不清楚,其在体内的多有机化学成分-多靶标-多生物通路的整体药理作用特征未得到揭示。鉴于目前仍然没有一种完全解析中药复方药效物质基础和作用机制的研究方法,本论文综合运用化学信息学和代谢组学等多学科交叉方法,从化学信息、动物、细胞、蛋白质、代谢小分子等多层次、多角度地揭示中药复方WDD抗MetS的药效有机成分和作用机制,为临床药物选择和疗效评价提供...
【文章来源】：福建师范大学福建省
【文章页数】：179 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
中文摘要
abstract
绪论
1.代谢综合征研究进展
1.1 代谢综合征分子机制研究进展
1.2 代谢综合征防治
2.中药治疗代谢综合征研究现状
3.化学信息学方法在中药研究中的应用进展
3.1 网络药理学方法在中药研究中的应用进展
3.2 定量构效关系方法在中药研究中的应用进展
4.代谢组学方法在中药研究中的应用进展
5.课题研究的目的和意义
6.课题研究的主要内容
第一章 基于网络药理学的WDD抗 MetS药效有机成分及作用机制研究
第一节 引言
第二节 网络药理学方法
2.1 数据收集
2.2 类药性评价
2.3 靶标蛋白预测
2.4 网络构建及分析
第三节 实验材料与方法
3.1 WDD有机化合物收集和结构优化
3.2 化学空间分析和类药性质计算
3.3 WDD靶标识别和活性化合物筛选
3.4 WDD相互作用网络构建
第四节 实验结果与讨论
4.1 WDD中有机化合物的化学多样性和类药性质分析
4.2 WDD中活性化合物和作用靶标筛选
4.3 WDD抗 MetS作用的潜在生物通路分析
第五节 本章小结
第二章 基于UHPLC-Q Exactive Orbitrap/MS技术的WDD活性有机化学成分定性鉴别研究
第一节 引言
第二节 实验材料与方法
2.1 主要仪器
2.2 主要药品与试剂
2.3 WDD的制备
2.4 上机样品处理
2.5 液相色谱条件
2.6 质谱条件
2.7 WDD中水溶性和肠吸收性比较好化合物数据库构建
2.8 数据处理
第三节 实验结果与讨论
3.1 WDD中水溶性和肠吸收性比较好化合物数据库构建
3.2 UHPLC-Q Exactive Orbitrap/MS定性分析结果
3.3 讨论
第四节 本章小结
第三章 WDD抗 MetS大鼠药效作用机制实验研究
第一节 引言
第二节 实验材料与方法
2.1 主要试剂
2.2 主要试剂配制
2.3 主要仪器
2.4 实验药物准备
2.5 动物分组及给药
2.6 实验标本采集
2.7 实验指标项目及测定方法
2.8 图像采集分析方法
2.9 统计方法
第三节 实验结果与讨论
3.1 MetS大鼠造模数据分析
3.2 WDD对 Met S大鼠生化指标的影响
3.3 WDD对 MetS大鼠肝组织PPARγ表达水平的影响
3.4 WDD对 MetS大鼠肝组织PPARβ表达水平的影响
3.5 WDD对 MetS大鼠肝组织LXRβ表达水平的影响
3.6 讨论
第四节 本章小结
第四章 WDD抗 MetS上调HDL-C表达水平的药效有机成分及作用机制研究
第一节 引言
第二节 QSAR研究方法
2.1 数据收集
2.2 分子结构优化和描述符计算
2.3 数据集划分
2.4 模型建立方法
2.5 模型评价
2.6 模型验证
第三节 实验材料与方法
3.1 主要试剂
3.2 主要仪器
3.3 血清HDL-C表达检测
3.4 血清ABCA1 表达检测
3.5 数据统计分析
3.6 ABCA1 表达上调剂QSAR分类模型构建
3.7 分子对接
3.8 WDD活性化合物的液相色谱质谱分析
第四节 实验结果与讨论
4.1 血清HDL-C和 ABCA1 检测结果
4.2 数据集划分
4.3 线性判别分类QSAR模型结果
4.4 分子描述符解释
4.5 支持向量机QSAR模型结果
4.6 人工神经网络QSAR模型结果
4.7 QSAR模型筛选WDD中上调ABCA1 表达的活性化合物
4.8 WDD中活性化合物上调ABCA1 表达的作用机制
4.9 WDD中上调ABCA1 表达有机化合物结构的定性鉴别
第五节 本章小结
第五章 基于GC-TOF/MS代谢组学组合方法的WDD抗 MetS药效有机成分及作用机制研究
第一节 引言
第二节 代谢组学方法
2.1 样本采集及预处理
2.2 代谢组学检测技术
2.3 代谢组学数据分析
2.4 代谢组学数据统计分析
2.5 特征代谢物筛选及生物通路分析
第三节 实验材料和方法
3.1 主要试剂
3.2 主要仪器
3.3 血清样本收集
3.4 GC-TOF/MS检测分析
3.5 GC-TOF/MS数据分析
3.6 KEGG通路分析
3.7 WDD抗 MetS代谢网络机制的药效有机成分分析
第四节 实验结果与讨论
4.1 大鼠血清样本代谢物的鉴定
4.2 降维统计分析
4.3 组间差异代谢物的筛选和鉴定
4.4 受影响代谢通路分析
4.5 分子对接实验结果
4.6 WDD中作用多代谢酶有机化合物结构的定性鉴别
4.7 讨论
第五节 本章小结
第六章 结论
附录
参考文献
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果
致谢
个人简历
本文编号：3207203
【文章来源】：福建师范大学福建省
【文章页数】：179 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
中文摘要
abstract
绪论
1.代谢综合征研究进展
1.1 代谢综合征分子机制研究进展
1.2 代谢综合征防治
2.中药治疗代谢综合征研究现状
3.化学信息学方法在中药研究中的应用进展
3.1 网络药理学方法在中药研究中的应用进展
3.2 定量构效关系方法在中药研究中的应用进展
4.代谢组学方法在中药研究中的应用进展
5.课题研究的目的和意义
6.课题研究的主要内容
第一章 基于网络药理学的WDD抗 MetS药效有机成分及作用机制研究
第一节 引言
第二节 网络药理学方法
2.1 数据收集
2.2 类药性评价
2.3 靶标蛋白预测
2.4 网络构建及分析
第三节 实验材料与方法
3.1 WDD有机化合物收集和结构优化
3.2 化学空间分析和类药性质计算
3.3 WDD靶标识别和活性化合物筛选
3.4 WDD相互作用网络构建
第四节 实验结果与讨论
4.1 WDD中有机化合物的化学多样性和类药性质分析
4.2 WDD中活性化合物和作用靶标筛选
4.3 WDD抗 MetS作用的潜在生物通路分析
第五节 本章小结
第二章 基于UHPLC-Q Exactive Orbitrap/MS技术的WDD活性有机化学成分定性鉴别研究
第一节 引言
第二节 实验材料与方法
2.1 主要仪器
2.2 主要药品与试剂
2.3 WDD的制备
2.4 上机样品处理
2.5 液相色谱条件
2.6 质谱条件
2.7 WDD中水溶性和肠吸收性比较好化合物数据库构建
2.8 数据处理
第三节 实验结果与讨论
3.1 WDD中水溶性和肠吸收性比较好化合物数据库构建
3.2 UHPLC-Q Exactive Orbitrap/MS定性分析结果
3.3 讨论
第四节 本章小结
第三章 WDD抗 MetS大鼠药效作用机制实验研究
第一节 引言
第二节 实验材料与方法
2.1 主要试剂
2.2 主要试剂配制
2.3 主要仪器
2.4 实验药物准备
2.5 动物分组及给药
2.6 实验标本采集
2.7 实验指标项目及测定方法
2.8 图像采集分析方法
2.9 统计方法
第三节 实验结果与讨论
3.1 MetS大鼠造模数据分析
3.2 WDD对 Met S大鼠生化指标的影响
3.3 WDD对 MetS大鼠肝组织PPARγ表达水平的影响
3.4 WDD对 MetS大鼠肝组织PPARβ表达水平的影响
3.5 WDD对 MetS大鼠肝组织LXRβ表达水平的影响
3.6 讨论
第四节 本章小结
第四章 WDD抗 MetS上调HDL-C表达水平的药效有机成分及作用机制研究
第一节 引言
第二节 QSAR研究方法
2.1 数据收集
2.2 分子结构优化和描述符计算
2.3 数据集划分
2.4 模型建立方法
2.5 模型评价
2.6 模型验证
第三节 实验材料与方法
3.1 主要试剂
3.2 主要仪器
3.3 血清HDL-C表达检测
3.4 血清ABCA1 表达检测
3.5 数据统计分析
3.6 ABCA1 表达上调剂QSAR分类模型构建
3.7 分子对接
3.8 WDD活性化合物的液相色谱质谱分析
第四节 实验结果与讨论
4.1 血清HDL-C和 ABCA1 检测结果
4.2 数据集划分
4.3 线性判别分类QSAR模型结果
4.4 分子描述符解释
4.5 支持向量机QSAR模型结果
4.6 人工神经网络QSAR模型结果
4.7 QSAR模型筛选WDD中上调ABCA1 表达的活性化合物
4.8 WDD中活性化合物上调ABCA1 表达的作用机制
4.9 WDD中上调ABCA1 表达有机化合物结构的定性鉴别
第五节 本章小结
第五章 基于GC-TOF/MS代谢组学组合方法的WDD抗 MetS药效有机成分及作用机制研究
第一节 引言
第二节 代谢组学方法
2.1 样本采集及预处理
2.2 代谢组学检测技术
2.3 代谢组学数据分析
2.4 代谢组学数据统计分析
2.5 特征代谢物筛选及生物通路分析
第三节 实验材料和方法
3.1 主要试剂
3.2 主要仪器
3.3 血清样本收集
3.4 GC-TOF/MS检测分析
3.5 GC-TOF/MS数据分析
3.6 KEGG通路分析
3.7 WDD抗 MetS代谢网络机制的药效有机成分分析
第四节 实验结果与讨论
4.1 大鼠血清样本代谢物的鉴定
4.2 降维统计分析
4.3 组间差异代谢物的筛选和鉴定
4.4 受影响代谢通路分析
4.5 分子对接实验结果
4.6 WDD中作用多代谢酶有机化合物结构的定性鉴别
4.7 讨论
第五节 本章小结
第六章 结论
附录
参考文献
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果
致谢
个人简历
本文编号：3207203
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